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chr1	175583592	175583802	211	*	Intron (ENST00000367674.7/7143, intron 1 of 22)	7143	ENST00000367674.7	159793	TNR	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005102,GO:0005576,GO:0005615,GO:0007155,GO:0007158,GO:0007411,GO:0008306,GO:0009986,GO:0022029,GO:0022408,GO:0030198,GO:0035641,GO:0045121,GO:0048692,GO:0050805,GO:0050808,GO:0050885,GO:0051968,GO:0051971,GO:0060291,GO:0062023,GO:0072534,GO:0098685,GO:0098978	hsa04151,hsa04510,hsa04512,hsa05165,hsa05206
chr1	175775026	175775280	255	*	Distal Intergenic	7143	ENST00000263525.6	-31410	TNR	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005102,GO:0005576,GO:0005615,GO:0007155,GO:0007158,GO:0007411,GO:0008306,GO:0009986,GO:0022029,GO:0022408,GO:0030198,GO:0035641,GO:0045121,GO:0048692,GO:0050805,GO:0050808,GO:0050885,GO:0051968,GO:0051971,GO:0060291,GO:0062023,GO:0072534,GO:0098685,GO:0098978	hsa04151,hsa04510,hsa04512,hsa05165,hsa05206
chr1	175983687	175984330	644	*	Intron (ENST00000461830.6/64326, intron 7 of 8)	677679	ENST00000517097.1	-15147	SCARNA3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005730,GO:0006396,GO:0015030	NA
chr1	176157474	176157703	230	*	Intron (ENST00000367667.5/64326, intron 3 of 17)	64326	ENST00000459744.5	-22392	COP1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0010212,GO:0016567,GO:0016607,GO:0031464,GO:0032436,GO:0043161,GO:0043687,GO:0046872,GO:0061630	hsa04115,hsa04120
chr1	176231666	176231847	182	*	Exon (ENST00000434367.1/ENST00000434367.1, exon 1 of 1)	64326	ENST00000367669.8	-24380	COP1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0010212,GO:0016567,GO:0016607,GO:0031464,GO:0032436,GO:0043161,GO:0043687,GO:0046872,GO:0061630	hsa04115,hsa04120
chr1	176314650	176314891	242	*	Intron (ENST00000701212.1/ENST00000701212.1, intron 5 of 6)	64326	ENST00000367669.8	-107364	COP1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0010212,GO:0016567,GO:0016607,GO:0031464,GO:0032436,GO:0043161,GO:0043687,GO:0046872,GO:0061630	hsa04115,hsa04120
chr1	176543857	176544055	199	*	Intron (ENST00000367661.7/60676, intron 1 of 4)	60676	ENST00000493665.1	6554	PAPPA2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0001558,GO:0005576,GO:0005829,GO:0006508,GO:0008237,GO:0008270,GO:0009651,GO:0016324,GO:0044267,GO:0060349,GO:0070062	NA
chr1	17675400	17675576	177	*	Intron (ENST00000361221.8/55160, intron 26 of 28)	55160	ENST00000495593.1	-18471	ARHGEF10L	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005096,GO:0005829,GO:0005829,GO:0030036,GO:0032933,GO:0032933,GO:0043547,GO:0051496,GO:0051496	NA
chr1	176954941	176955435	495	*	Intron (ENST00000367657.7/460, intron 11 of 22)	574441	ENST00000365739.4	74010	MIR488	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0032691,GO:0032717,GO:0032720,GO:0035195,GO:0035195,GO:0050728,GO:1903231	NA
chr1	176958455	176958622	168	*	Exon (ENST00000367657.7/460, exon 10 of 23)	574441	ENST00000365739.4	70823	MIR488	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0032691,GO:0032717,GO:0032720,GO:0035195,GO:0035195,GO:0050728,GO:1903231	NA
chr1	17754728	17754994	267	*	Promoter (<=1kb)	81569	ENST00000375406.2	-339	ACTL8	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005869,GO:0030855	NA
chr1	17755277	17755747	471	*	Promoter (<=1kb)	81569	ENST00000375406.2	0	ACTL8	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005869,GO:0030855	NA
chr1	17759270	17759631	362	*	Intron (ENST00000375406.2/81569, intron 1 of 2)	81569	ENST00000375406.2	3937	ACTL8	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005869,GO:0030855	NA
chr1	177642445	177642681	237	*	Intron (ENST00000663166.1/ENST00000663166.1, intron 1 of 4)	101928778	ENST00000427173.1	-57843	LINC01741	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	177786308	177786760	453	*	Intron (ENST00000664407.1/ENST00000664407.1, intron 1 of 6)	101928778	ENST00000670282.1	85760	LINC01741	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	178764376	178764615	240	*	Intron (ENST00000495034.5/55103, intron 1 of 9)	646976	ENST00000608517.1	-38091	646976	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	178767635	178767877	243	*	Intron (ENST00000495034.5/55103, intron 1 of 9)	646976	ENST00000608517.1	-41350	646976	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	178768489	178769486	998	*	Intron (ENST00000495034.5/55103, intron 1 of 9)	646976	ENST00000608517.1	-42204	646976	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	17932582	17932929	348	*	Distal Intergenic	105376812	ENST00000641892.1	-82783	LOC105376812	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	179425070	179425532	463	*	Intron (ENST00000617277.4/126859, intron 12 of 24)	126859	ENST00000434088.1	56169	AXDND1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	179478147	179478620	474	*	Intron (ENST00000617277.4/126859, intron 16 of 24)	126859	ENST00000484883.1	-13083	AXDND1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	179719111	179719277	167	*	Distal Intergenic	148753	ENST00000669730.1	-10914	FAM163A	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0016021	NA
chr1	180379912	180380292	381	*	Intron (ENST00000642319.1/84320, intron 6 of 13)	84320	ENST00000475338.2	33096	ACBD6	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000062,GO:0005515,GO:0005829,GO:0006637,GO:0008289	NA
chr1	180946973	180947364	392	*	3 UTR	57710	ENST00000461346.1	5780	KIAA1614	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005080,GO:0005634,GO:0005938,GO:0007098,GO:0007163,GO:0016324,GO:0060341	NA
chr1	181146369	181146719	351	*	Distal Intergenic	101928973	ENST00000435023.1	-27765	LINC01732	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr1	181256957	181257549	593	*	Distal Intergenic	100287948	ENST00000319701.2	20569	LINC01699	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr1	181420002	181420151	150	*	Intron (ENST00000524607.6/777, intron 2 of 11)	777	ENST00000533229.1	-63160	CACNA1E	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005245,GO:0005245,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005891,GO:0006816,GO:0007268,GO:0022843,GO:0034765,GO:0045202,GO:0050796,GO:0051899,GO:0070509,GO:0070588	hsa04010,hsa04020,hsa04930
chr1	181848964	181849269	306	*	Distal Intergenic	777	ENST00000700190.1	55296	CACNA1E	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005245,GO:0005245,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005891,GO:0006816,GO:0007268,GO:0022843,GO:0034765,GO:0045202,GO:0050796,GO:0051899,GO:0070509,GO:0070588	hsa04010,hsa04020,hsa04930
chr1	182044894	182045081	188	*	Distal Intergenic	127665	ENST00000339948.3	16631	ZNF648	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872	NA
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chr1	182133828	182134131	304	*	Intron (ENST00000663078.1/400799, intron 3 of 4)	127665	ENST00000411509.1	-64575	ZNF648	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872	NA
chr1	18231686	18232240	555	*	Intron (ENST00000251296.4/84966, intron 2 of 9)	84966	ENST00000412684.3	-46605	IGSF21	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005912,GO:0007156,GO:0007157,GO:0031362,GO:0042734,GO:0045211,GO:0060074,GO:0060077	NA
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chr1	184289083	184289540	458	*	Distal Intergenic	118827814	ENST00000605589.1	97164	C1orf21-DT	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr1	184542426	184542692	267	*	Promoter (2-3kb)	102724857	ENST00000489143.6	2433	102724857	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr1	185578416	185578750	335	*	Intron (ENST00000667194.1/101929093, intron 2 of 3)	101929093	ENST00000665129.1	49742	LINC01350	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr1	204983898	204984124	227	*	Promoter (2-3kb)	23114	ENST00000468328.5	2014	NFASC	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005925,GO:0007155,GO:0007411,GO:0007422,GO:0019226,GO:0019904,GO:0030425,GO:0033010,GO:0033268,GO:0033268,GO:0042552,GO:0043194,GO:0043312,GO:0050808,GO:0072659,GO:0097454,GO:0101003	hsa04514
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chr1	205474575	205475082	508	*	Distal Intergenic	101669762	ENST00000629113.2	-17484	BLACAT1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr1	227815380	227815587	208	*	Promoter (<=1kb)	339501	ENST00000366757.4	-88	PRSS38	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0004252,GO:0005576,GO:0006508	NA
chr1	227935821	227936132	312	*	Intron (ENST00000272164.6/7483, intron 1 of 3)	100847072	ENST00000584300.1	5551	MIR5008	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	228092519	228093036	518	*	Promoter (2-3kb)	375	ENST00000490705.2	2031	ARF1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0000287,GO:0002090,GO:0003723,GO:0003924,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005737,GO:0005770,GO:0005778,GO:0005802,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005925,GO:0006661,GO:0006878,GO:0006886,GO:0007015,GO:0014069,GO:0016192,GO:0019003,GO:0019886,GO:0019904,GO:0030017,GO:0030137,GO:0031252,GO:0032991,GO:0034315,GO:0034379,GO:0035722,GO:0043005,GO:0045807,GO:0045956,GO:0048471,GO:0050690,GO:0050714,GO:0050790,GO:0055108,GO:0060292,GO:0060999,GO:0070062,GO:0070142,GO:0097061,GO:0097212,GO:0098586,GO:0098974,GO:0098978,GO:1902307,GO:1902824,GO:1902953,GO:1903725,GO:1990386,GO:1990583	hsa04072,hsa04144,hsa05110,hsa05130,hsa05131,hsa05132,hsa05134
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chr1	228224828	228225617	790	*	Intron (ENST00000570156.7/84033, intron 10 of 115)	84033	ENST00000493977.2	9139	OBSCN	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311	NA
chr1	228232502	228232796	295	*	Intron (ENST00000570156.7/84033, intron 10 of 115)	84033	ENST00000493977.2	16813	OBSCN	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311	NA
chr1	228238301	228238887	587	*	Exon (ENST00000664490.1/ENST00000664490.1, exon 3 of 3)	84033	ENST00000493977.2	22612	OBSCN	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311	NA
chr1	228240361	228240797	437	*	Intron (ENST00000570156.7/84033, intron 10 of 115)	84033	ENST00000493977.2	24672	OBSCN	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311	NA
chr1	228242621	228243740	1120	*	Exon (ENST00000570156.7/84033, exon 11 of 116)	84033	ENST00000493977.2	26932	OBSCN	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311	NA
chr1	228245295	228245833	539	*	Exon (ENST00000570156.7/84033, exon 13 of 116)	84033	ENST00000493977.2	29606	OBSCN	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311	NA
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chr1	233561182	233561614	433	*	Distal Intergenic	3775	ENST00000366621.8	-52492	KCNK1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005242,GO:0005249,GO:0005267,GO:0005272,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005887,GO:0005887,GO:0006813,GO:0008076,GO:0016021,GO:0016324,GO:0022841,GO:0022841,GO:0030322,GO:0030425,GO:0031526,GO:0034705,GO:0035094,GO:0035725,GO:0042802,GO:0043204,GO:0043231,GO:0055037,GO:0060075,GO:0061337,GO:0071805,GO:0071805,GO:0097060,GO:1902937	NA
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chr1	23361316	23361739	424	*	3 UTR	80818	ENST00000374608.3	6647	ZNF436	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	23361837	23363350	1514	*	3 UTR	80818	ENST00000374608.3	5036	ZNF436	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	234290512	234290700	189	*	Intron (ENST00000366618.8/148641, intron 3 of 7)	100616380	ENST00000583284.1	-15767	MIR4671	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr1	234685543	234685699	157	*	Intron (ENST00000442382.1/ENST00000442382.1, intron 1 of 1)	105373209	ENST00000453568.1	11447	LOC105373209	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr1	247157603	247157964	362	*	Intron (ENST00000472531.5/7678, intron 3 of 3)	7678	ENST00000476312.1	-7653	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	247158227	247158418	192	*	Intron (ENST00000472531.5/7678, intron 3 of 3)	7678	ENST00000476312.1	-8277	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	247159223	247159982	760	*	Exon (ENST00000472531.5/7678, exon 2 of 4)	7678	ENST00000476312.1	-9273	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	247160204	247160597	394	*	Intron (ENST00000472531.5/7678, intron 1 of 3)	7678	ENST00000476312.1	-10254	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	247162130	247162520	391	*	Intron (ENST00000472531.5/7678, intron 1 of 3)	7678	ENST00000491356.5	9482	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	247164457	247164969	513	*	Intron (ENST00000472531.5/7678, intron 1 of 3)	7678	ENST00000491356.5	7033	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr1	247184193	247185017	825	*	Exon (ENST00000400933.2/ENST00000400933.2, exon 1 of 1)	7678	ENST00000543802.3	-12173	ZNF124	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr1	248229415	248229763	349	*	Promoter (1-2kb)	26245	ENST00000641868.1	-1654	OR2M4	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0007608,GO:0016021,GO:0050911	hsa04740
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chr1	2489136	2489522	387	*	Exon (ENST00000449969.5/9651, exon 9 of 22)	9651	ENST00000473964.5	-8260	PLCH2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0004435,GO:0004435,GO:0005509,GO:0005575,GO:0005737,GO:0005886,GO:0016042,GO:0043647,GO:0046488,GO:0048015,GO:0048015	hsa00562,hsa01100
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chr1	24975209	24975550	342	*	Distal Intergenic	864	ENST00000479341.1	-10088	RUNX3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000785,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001503,GO:0002062,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006468,GO:0016513,GO:0030097,GO:0030182,GO:0043231,GO:0043371,GO:0043378,GO:0045595,GO:0045786,GO:0045893,GO:0048935,GO:0050680,GO:0071559,GO:1990837	hsa04658,hsa05169
chr1	24992011	24992292	282	*	Distal Intergenic	864	ENST00000479341.1	-26890	RUNX3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000785,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001503,GO:0002062,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006468,GO:0016513,GO:0030097,GO:0030182,GO:0043231,GO:0043371,GO:0043378,GO:0045595,GO:0045786,GO:0045893,GO:0048935,GO:0050680,GO:0071559,GO:1990837	hsa04658,hsa05169
chr1	25599031	25599268	238	*	Distal Intergenic	57134	ENST00000374332.9	-17523	MAN1C1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0000139,GO:0004571,GO:0004571,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005975,GO:0006487,GO:0006491,GO:0030173,GO:0070062,GO:1904381	hsa00510,hsa00513,hsa01100,hsa04141
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chr1	26268555	26268789	235	*	Promoter (<=1kb)	64793	ENST00000469609.5	-501	CEP85	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000242,GO:0000922,GO:0005515,GO:0005730,GO:0005794,GO:0005813,GO:0005813,GO:0005829,GO:0006469,GO:0007059,GO:0046602	NA
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chr1	2630285	2631123	839	*	Promoter (<=1kb)	79258	ENST00000504800.5	-791	MMEL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0004175,GO:0004222,GO:0005615,GO:0005886,GO:0006508,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016485,GO:0046872	NA
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chr1	3336642	3337076	435	*	Intron (ENST00000511072.5/63976, intron 3 of 15)	105378604	ENST00000669140.1	-13493	105378604	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr1	3344071	3344328	258	*	Intron (ENST00000511072.5/63976, intron 3 of 15)	105378604	ENST00000669140.1	-20922	105378604	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr1	33938910	33939084	175	*	Intron (ENST00000373381.9/114784, intron 3 of 70)	402779	ENST00000431046.1	63444	CSMD2-AS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr1	35547464	35547747	284	*	Intron (ENST00000697000.1/79932, intron 2 of 21)	79932	ENST00000697034.1	6732	KIAA0319L	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0005515,GO:0005730,GO:0005794,GO:0005886,GO:0016021,GO:0016032,GO:0031410,GO:0031410	NA
chr1	3585927	3586392	466	*	Intron (ENST00000356575.9/1953, intron 3 of 36)	1953	ENST00000485002.6	24885	1953	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr1	40023434	40023846	413	*	Distal Intergenic	10487	ENST00000372797.7	-16387	CAP1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000902,GO:0001667,GO:0003779,GO:0005576,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005925,GO:0006898,GO:0007163,GO:0007165,GO:0007190,GO:0008179,GO:0019933,GO:0030036,GO:0030864,GO:0035578,GO:0043312,GO:0045761,GO:0070062	NA
chr1	40454012	40454313	302	*	Exon (ENST00000469416.1/65243, exon 3 of 5)	65243	ENST00000361584.5	3536	ZFP69B	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005730,GO:0006357,GO:0007030,GO:0046872	hsa05168
chr1	40464988	40465294	307	*	Exon (ENST00000565390.2/ENST00000565390.2, exon 1 of 1)	339559	ENST00000372706.6	-11996	ZFP69	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0006357,GO:0006629,GO:0019216,GO:0046872	hsa05168
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chr1	40515004	40515185	182	*	Exon (ENST00000358527.6/64789, exon 4 of 4)	64789	ENST00000471429.1	5919	EXO5	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003677,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005829,GO:0008310,GO:0036297,GO:0036297,GO:0045145,GO:0045145,GO:0046872,GO:0051539,GO:0090305	NA
chr1	40870521	40870787	267	*	Intron (ENST00000414199.1/ENST00000414199.1, intron 2 of 2)	163732	ENST00000372638.4	-8158	CITED4	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003713,GO:0003713,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0043627,GO:0045944	NA
chr1	40876477	40876831	355	*	Exon (ENST00000414199.1/ENST00000414199.1, exon 3 of 3)	163732	ENST00000372638.4	-14114	CITED4	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003713,GO:0003713,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0043627,GO:0045944	NA
chr1	40893683	40894512	830	*	Distal Intergenic	163732	ENST00000372638.4	-31320	CITED4	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003713,GO:0003713,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0043627,GO:0045944	NA
chr1	41255488	41255736	249	*	Intron (ENST00000657314.1/ENST00000657314.1, intron 1 of 1)	22955	ENST00000695335.1	-13182	SCMH1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003682,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006338,GO:0007283,GO:0009952,GO:0010369,GO:0016458,GO:0042393,GO:0045892,GO:0045892	NA
chr1	41400258	41400463	206	*	Distal Intergenic	101929901	ENST00000429109.1	-24589	FOXO6-AS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	41444310	41444843	534	*	Distal Intergenic	1907	ENST00000460255.1	39242	EDN2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0001516,GO:0001659,GO:0002690,GO:0003058,GO:0003099,GO:0003100,GO:0003100,GO:0005179,GO:0005179,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0006874,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007204,GO:0008284,GO:0010460,GO:0014824,GO:0014826,GO:0014826,GO:0019221,GO:0019229,GO:0019722,GO:0030593,GO:0031708,GO:0031708,GO:0042116,GO:0042310,GO:0045987,GO:0048016,GO:0048246,GO:0048286,GO:0060585,GO:0060585,GO:0097009	hsa04024,hsa04080,hsa04270,hsa04924
chr1	41762478	41762929	452	*	Intron (ENST00000372584.5/59269, intron 1 of 7)	59269	ENST00000643665.1	-100153	HIVEP3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006357,GO:0035914,GO:0045893,GO:0046872	NA
chr1	42026588	42027024	437	*	Intron (ENST00000489103.5/59269, intron 1 of 3)	59269	ENST00000489103.5	8901	HIVEP3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006357,GO:0035914,GO:0045893,GO:0046872	NA
chr1	42302263	42302493	231	*	Intron (ENST00000372572.5/22887, intron 4 of 14)	22887	ENST00000545068.5	12966	FOXJ3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0043565,GO:0045944,GO:1990837	NA
chr1	42587883	42588140	258	*	Intron (ENST00000660938.1/728621, intron 9 of 16)	728621	ENST00000471699.2	6467	CCDC30	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr1	42857444	42857692	249	*	Distal Intergenic	51058	ENST00000630961.1	6757	ZNF691	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	NA
chr1	42858897	42859514	618	*	Distal Intergenic	51058	ENST00000630961.1	8210	ZNF691	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	NA
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chr1	50932514	50932667	154	*	Intron (ENST00000396153.7/11124, intron 1 of 18)	11124	ENST00000487898.1	27071	FAF1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006915,GO:0007253,GO:0008219,GO:0010942,GO:0019887,GO:0019901,GO:0019904,GO:0030155,GO:0031072,GO:0031265,GO:0031334,GO:0031625,GO:0034098,GO:0042176,GO:0043065,GO:0043130,GO:0043161,GO:0045740,GO:0045859,GO:0048471,GO:0051059,GO:1902043,GO:1903364	hsa04217
chr1	51913817	51914008	192	*	3 UTR	4898	ENST00000354831.11	-35012	NRDC	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004222,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005829,GO:0006508,GO:0009986,GO:0046872,GO:0048408,GO:0051044,GO:0052548,GO:0120163	NA
chr1	52217814	52218064	251	*	Intron (ENST00000287727.8/9372, intron 2 of 18)	9372	ENST00000357206.6	75440	ZFYVE9	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005545,GO:0005769,GO:0005829,GO:0006897,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007179,GO:0016197,GO:0019904,GO:0031901,GO:0031901,GO:0031901,GO:0032991,GO:0043231,GO:0046872	hsa04144,hsa04350
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chr1	53095545	53096330	786	*	Intron (ENST00000611397.5/6512, intron 4 of 9)	6512	ENST00000488036.5	-4563	SLC1A7	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001504,GO:0005313,GO:0005886,GO:0006811,GO:0006835,GO:0014047,GO:0015293,GO:0015813,GO:0016021,GO:0098793,GO:0098810	hsa04721,hsa04724
chr1	53096404	53096842	439	*	Intron (ENST00000611397.5/6512, intron 4 of 9)	6512	ENST00000488036.5	-5422	SLC1A7	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001504,GO:0005313,GO:0005886,GO:0006811,GO:0006835,GO:0014047,GO:0015293,GO:0015813,GO:0016021,GO:0098793,GO:0098810	hsa04721,hsa04724
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chr1	66383205	66383709	505	*	Distal Intergenic	5142	ENST00000483863.2	15711	PDE4B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000930,GO:0001780,GO:0004114,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0005634,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005891,GO:0006198,GO:0007165,GO:0007186,GO:0008021,GO:0014069,GO:0030018,GO:0030552,GO:0030593,GO:0032729,GO:0032743,GO:0035690,GO:0043015,GO:0043197,GO:0044325,GO:0044325,GO:0046872,GO:0048471,GO:0050852,GO:0050900,GO:0060076,GO:0071222,GO:0071872,GO:0086004,GO:0140199,GO:1901841,GO:1901898	hsa00230,hsa01100,hsa04024,hsa04928,hsa05032
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chr1	69161482	69161780	299	*	Intron (ENST00000658427.1/105378787, intron 2 of 3)	105378786	ENST00000439878.1	87643	LINC02791	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr1	69168197	69168445	249	*	Intron (ENST00000658427.1/105378787, intron 2 of 3)	105378786	ENST00000439878.1	80978	LINC02791	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr1	6937325	6937558	234	*	Intron (ENST00000303635.12/23261, intron 3 of 22)	23261	ENST00000467267.1	63269	CAMTA1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003690,GO:0003712,GO:0005634,GO:0005730,GO:0005829,GO:0006357,GO:0035307,GO:0070886	NA
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chr1	7079318	7079520	203	*	Intron (ENST00000303635.12/23261, intron 3 of 22)	23261	ENST00000467267.1	205262	CAMTA1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003690,GO:0003712,GO:0005634,GO:0005730,GO:0005829,GO:0006357,GO:0035307,GO:0070886	NA
chr1	7079866	7080173	308	*	Intron (ENST00000303635.12/23261, intron 3 of 22)	23261	ENST00000467267.1	205810	CAMTA1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003690,GO:0003712,GO:0005634,GO:0005730,GO:0005829,GO:0006357,GO:0035307,GO:0070886	NA
chr1	7103594	7104112	519	*	Intron (ENST00000303635.12/23261, intron 4 of 22)	23261	ENST00000467267.1	229538	CAMTA1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003690,GO:0003712,GO:0005634,GO:0005730,GO:0005829,GO:0006357,GO:0035307,GO:0070886	NA
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chr1	79220690	79221211	522	*	Intron (ENST00000661030.1/64123, intron 1 of 16)	64123	ENST00000655029.1	15279	ADGRL4	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004930,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007189,GO:0016021,GO:0031410,GO:0065003	NA
chr1	80143473	80143813	341	*	Distal Intergenic	101927412	ENST00000418041.5	-391942	LINC01781	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr1	92403363	92403915	553	*	Distal Intergenic	79871	ENST00000477322.1	70121	RPAP2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004722,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008420,GO:0008420,GO:0009301,GO:0016591,GO:0042795,GO:0043175,GO:0046872,GO:0070940,GO:0070940,GO:0106306,GO:0106307	NA
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chr1	9259741	9260745	1005	*	Intron (ENST00000377403.7/9563, intron 3 of 4)	9563	ENST00000602477.1	19897	H6PD	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004345,GO:0005739,GO:0005788,GO:0006006,GO:0009051,GO:0017057,GO:0030246,GO:0047936,GO:0050661,GO:0097305,GO:2000064	hsa00030,hsa01100,hsa01200
chr1	9287413	9287653	241	*	Distal Intergenic	80176	ENST00000328089.11	-5241	SPSB1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000209,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006511,GO:0016567,GO:0019005,GO:0043161,GO:0043687,GO:1990756	NA
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chr1	93663394	93663668	275	*	Intron (ENST00000260502.11/8412, intron 2 of 11)	8412	ENST00000479503.2	-14572	BCAR3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001784,GO:0002089,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005925,GO:0007165,GO:0007264,GO:0008286,GO:0016020,GO:0019900,GO:0033138,GO:0042493,GO:0043410,GO:0043547,GO:0045740,GO:0045742,GO:0086100	NA
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chr1	93762321	93762593	273	*	Intron (ENST00000370244.5/8412, intron 2 of 13)	8412	ENST00000433544.1	12851	BCAR3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001784,GO:0002089,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005925,GO:0007165,GO:0007264,GO:0008286,GO:0016020,GO:0019900,GO:0033138,GO:0042493,GO:0043410,GO:0043547,GO:0045740,GO:0045742,GO:0086100	NA
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chr10	111928123	111928440	318	*	Intron (ENST00000656217.1/105378486, intron 2 of 2)	105378486	ENST00000656217.1	61469	105378486	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr10	120953367	120953634	268	*	Intron (ENST00000414774.1/105378519, intron 1 of 1)	105378519	ENST00000414774.1	27066	LOC105378519	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr10	5370891	5371385	495	*	Intron (ENST00000380433.5/114131, intron 1 of 1)	114131	ENST00000380433.5	5925	UCN3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005179,GO:0005576,GO:0005615,GO:0007189,GO:0007189,GO:0007586,GO:0009749,GO:0009755,GO:0009755,GO:0031669,GO:0032024,GO:0035902,GO:0042594,GO:0043196,GO:0043679,GO:0045838,GO:0051412,GO:0051429,GO:0051429,GO:0051431,GO:0071456	hsa04080
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chr10	53863245	53863472	228	*	Intron (ENST00000644397.2/65217, intron 27 of 37)	65217	ENST00000618301.4	-6039	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	5389455	5389652	198	*	Distal Intergenic	79861	ENST00000380419.8	15176	TUBAL3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000226,GO:0000278,GO:0003924,GO:0005200,GO:0005525,GO:0005737,GO:0005874	hsa04145,hsa04210,hsa04530,hsa04540,hsa05010,hsa05012,hsa05014,hsa05016,hsa05020,hsa05022,hsa05130,hsa05132
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chr10	53979580	53979754	175	*	Intron (ENST00000644397.2/65217, intron 21 of 37)	65217	ENST00000463095.2	-72363	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
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chr10	54227779	54227929	151	*	Intron (ENST00000644397.2/65217, intron 9 of 37)	65217	ENST00000642496.1	-31933	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
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chr10	54455739	54455949	211	*	Intron (ENST00000644397.2/65217, intron 3 of 37)	105378311	ENST00000422842.1	-30281	LOC105378311	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr10	54845226	54845517	292	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 4 of 5)	65217	ENST00000448885.5	-43935	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	54854935	54855324	390	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 4 of 5)	65217	ENST00000448885.5	-53644	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	54908176	54908563	388	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 3 of 5)	65217	ENST00000448885.5	-106885	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	54961123	54961434	312	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 3 of 5)	65217	ENST00000448885.5	-159832	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55001388	55001682	295	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 3 of 5)	65217	ENST00000448885.5	-200097	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55015651	55015819	169	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 3 of 5)	65217	ENST00000448885.5	-214360	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55080542	55080819	278	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 3 of 5)	65217	ENST00000458638.1	238795	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55293087	55293378	292	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 2 of 5)	65217	ENST00000458638.1	26236	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55296080	55296294	215	*	Intron (ENST00000613346.4/65217, intron 2 of 5)	65217	ENST00000458638.1	23320	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55319764	55320219	456	*	Promoter (<=1kb)	65217	ENST00000458638.1	-150	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55631410	55631640	231	*	Distal Intergenic	65217	ENST00000613346.4	-3468	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55667439	55667943	505	*	Exon (ENST00000450301.2/ENST00000450301.2, exon 1 of 1)	65217	ENST00000613346.4	-39497	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
chr10	55861947	55862217	271	*	Distal Intergenic	65217	ENST00000613346.4	-234005	PCDH15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007605,GO:0032420,GO:0045202,GO:0045494,GO:0048839,GO:0050953,GO:0050957	NA
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chr10	9755079	9755360	282	*	Distal Intergenic	105376402	ENST00000647601.1	122700	LINC02663	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr11	100789346	100789692	347	*	Intron (ENST00000298815.13/143872, intron 2 of 23)	143872	ENST00000524649.1	18980	ARHGAP42	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003085,GO:0005096,GO:0005096,GO:0005575,GO:0007165,GO:0035024,GO:0090630,GO:1904694	NA
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chr11	10917188	10917576	389	*	Distal Intergenic	729013	ENST00000530344.1	51927	ZBED5-AS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr11	10993025	10993243	219	*	Distal Intergenic	105376550	ENST00000647635.1	-27640	LINC02752	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	11091512	11091735	224	*	Intron (ENST00000647635.1/105376550, intron 1 of 6)	105376550	ENST00000525758.1	-26119	LINC02752	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	111798257	111798413	157	*	Intron (ENST00000532425.6/79796, intron 4 of 5)	79796	ENST00000525910.1	11277	ALG9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000026,GO:0000026,GO:0000030,GO:0005789,GO:0005789,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016020,GO:0016021,GO:0052918,GO:0052926,GO:0097502	hsa00510,hsa00513,hsa01100
chr11	114301184	114301819	636	*	Intron (ENST00000535401.5/4837, intron 4 of 4)	4837	ENST00000545255.1	3033	NNMT	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005829,GO:0005829,GO:0008112,GO:0008112,GO:0008170,GO:0010243,GO:0030760,GO:0031100,GO:0032259,GO:0034356,GO:0042493	hsa00760,hsa01100
chr11	114305083	114305291	209	*	Intron (ENST00000535401.5/4837, intron 4 of 4)	4837	ENST00000545255.1	6932	NNMT	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005829,GO:0005829,GO:0008112,GO:0008112,GO:0008170,GO:0010243,GO:0030760,GO:0031100,GO:0032259,GO:0034356,GO:0042493	hsa00760,hsa01100
chr11	114330613	114330920	308	*	Intron (ENST00000544925.1/ENST00000544925.1, intron 1 of 2)	4837	ENST00000545255.1	32462	NNMT	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005829,GO:0005829,GO:0008112,GO:0008112,GO:0008170,GO:0010243,GO:0030760,GO:0031100,GO:0032259,GO:0034356,GO:0042493	hsa00760,hsa01100
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chr11	132474682	132474953	272	*	Intron (ENST00000331898.11/4978, intron 3 of 6)	50863	ENST00000496198.1	142192	NTM	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	132504365	132504755	391	*	Intron (ENST00000331898.11/4978, intron 3 of 6)	50863	ENST00000496198.1	171875	NTM	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	132547259	132547504	246	*	Intron (ENST00000331898.11/4978, intron 2 of 6)	50863	ENST00000496198.1	214769	NTM	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	132580021	132580220	200	*	Intron (ENST00000331898.11/4978, intron 2 of 6)	50863	ENST00000496198.1	247531	NTM	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	132602760	132603151	392	*	Intron (ENST00000331898.11/4978, intron 2 of 6)	50863	ENST00000496198.1	270270	NTM	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	132657026	132657276	251	*	Exon (ENST00000331898.11/4978, exon 2 of 7)	4978	ENST00000525412.1	285734	OPCML	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	132868541	132868748	208	*	Intron (ENST00000331898.11/4978, intron 1 of 6)	4978	ENST00000525412.1	74262	OPCML	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	133004183	133004608	426	*	Intron (ENST00000524381.6/4978, intron 1 of 7)	4978	ENST00000374778.4	-60415	OPCML	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	133018862	133019109	248	*	Intron (ENST00000524381.6/4978, intron 1 of 7)	4978	ENST00000374778.4	-75094	OPCML	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	133027429	133027772	344	*	Intron (ENST00000524381.6/4978, intron 1 of 7)	4978	ENST00000374778.4	-83661	OPCML	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	133065364	133065761	398	*	Exon (ENST00000623990.1/ENST00000623990.1, exon 1 of 1)	4978	ENST00000374778.4	-121596	OPCML	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007155,GO:0008038,GO:0031225	NA
chr11	134739770	134740167	398	*	Intron (ENST00000513405.1/729305, intron 1 of 1)	729305	ENST00000513405.1	4174	LINC02714	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	13546173	13546442	270	*	Distal Intergenic	5741	ENST00000529816.1	-49992	PTH	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0001501,GO:0005179,GO:0005179,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0005615,GO:0006874,GO:0007186,GO:0007189,GO:0007189,GO:0007202,GO:0007266,GO:0007267,GO:0008628,GO:0009967,GO:0010288,GO:0010468,GO:0010629,GO:0010960,GO:0030501,GO:0031856,GO:0031857,GO:0032331,GO:0033280,GO:0034645,GO:0042493,GO:0045453,GO:0045471,GO:0045725,GO:0045944,GO:0046058,GO:0046326,GO:0046686,GO:0047485,GO:0048018,GO:0048873,GO:0051428,GO:0051428,GO:0051926,GO:0055062,GO:0060732,GO:0071107,GO:0071774,GO:0071864,GO:0071866,GO:0090290,GO:1900158	hsa04080,hsa04928,hsa04961,hsa05323
chr11	13620189	13620456	268	*	Distal Intergenic	84188	ENST00000354817.8	-48212	FAR1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005777,GO:0005777,GO:0005778,GO:0005779,GO:0005782,GO:0008611,GO:0008611,GO:0010025,GO:0010025,GO:0016491,GO:0035336,GO:0035336,GO:0043231,GO:0046474,GO:0080019,GO:0080019,GO:0102965	hsa04146
chr11	13659377	13659832	456	*	Distal Intergenic	84188	ENST00000354817.8	-8836	FAR1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005777,GO:0005777,GO:0005778,GO:0005779,GO:0005782,GO:0008611,GO:0008611,GO:0010025,GO:0010025,GO:0016491,GO:0035336,GO:0035336,GO:0043231,GO:0046474,GO:0080019,GO:0080019,GO:0102965	hsa04146
chr11	14056003	14056288	286	*	Intron (ENST00000576479.4/10418, intron 3 of 15)	10418	ENST00000576479.4	93280	SPON1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005201,GO:0005201,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005788,GO:0007155,GO:0010954,GO:0031012,GO:0032092,GO:0046872,GO:0050693,GO:0062023,GO:0062023,GO:1902430,GO:1902993	NA
chr11	14082479	14082661	183	*	Intron (ENST00000576479.4/10418, intron 5 of 15)	10418	ENST00000576479.4	119756	SPON1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005201,GO:0005201,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005788,GO:0007155,GO:0010954,GO:0031012,GO:0032092,GO:0046872,GO:0050693,GO:0062023,GO:0062023,GO:1902430,GO:1902993	NA
chr11	1414701	1415036	336	*	Intron (ENST00000308219.13/9024, intron 1 of 19)	9024	ENST00000382179.5	3549	BRSK2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000086,GO:0000287,GO:0004674,GO:0004674,GO:0004674,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005813,GO:0005813,GO:0006468,GO:0006468,GO:0006887,GO:0007409,GO:0007409,GO:0010975,GO:0018105,GO:0019901,GO:0030010,GO:0030010,GO:0030182,GO:0031532,GO:0035556,GO:0036503,GO:0042149,GO:0043462,GO:0048156,GO:0048471,GO:0050321,GO:0050321,GO:0050321,GO:0050321,GO:0050770,GO:0051117,GO:0051301,GO:0060590,GO:0061178,GO:0061178,GO:0070059,GO:0090176,GO:0106310,GO:0106311,GO:0150034,GO:1904152,GO:1904152,GO:2000807	NA
chr11	14335963	14336273	311	*	Promoter (<=1kb)	22800	ENST00000531421.5	893	RRAS2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0001649,GO:0003924,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005783,GO:0005886,GO:0005925,GO:0007265,GO:0016020,GO:0019003,GO:0030335,GO:0070062,GO:1901214	hsa04010,hsa04014,hsa04024,hsa04072,hsa04137,hsa04140,hsa04218,hsa04371,hsa04625,hsa04810,hsa05205
chr11	14336434	14336782	349	*	Promoter (<=1kb)	22800	ENST00000531421.5	384	RRAS2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0001649,GO:0003924,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005783,GO:0005886,GO:0005925,GO:0007265,GO:0016020,GO:0019003,GO:0030335,GO:0070062,GO:1901214	hsa04010,hsa04014,hsa04024,hsa04072,hsa04137,hsa04140,hsa04218,hsa04371,hsa04625,hsa04810,hsa05205
chr11	14601003	14601213	211	*	Intron (ENST00000418988.2/5682, intron 2 of 10)	5682	ENST00000418988.2	42404	PSMA1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000165,GO:0000209,GO:0000502,GO:0001530,GO:0002223,GO:0002479,GO:0002862,GO:0003723,GO:0004175,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005839,GO:0005839,GO:0005844,GO:0006521,GO:0010499,GO:0010972,GO:0016579,GO:0019773,GO:0019773,GO:0031145,GO:0031146,GO:0033209,GO:0038061,GO:0038095,GO:0043161,GO:0043161,GO:0043488,GO:0043687,GO:0050852,GO:0055085,GO:0060071,GO:0061418,GO:0070062,GO:0070498,GO:0090090,GO:0090263,GO:1901990,GO:1902036	hsa03050,hsa05010,hsa05012,hsa05014,hsa05016,hsa05017,hsa05020,hsa05022
chr11	14822786	14823229	444	*	Intron (ENST00000282096.9/5140, intron 7 of 15)	5140	ENST00000525439.1	33847	PDE3B	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0001525,GO:0004114,GO:0004114,GO:0004114,GO:0004115,GO:0004119,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005829,GO:0007162,GO:0007165,GO:0007186,GO:0016020,GO:0016020,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016525,GO:0032045,GO:0032869,GO:0033629,GO:0043422,GO:0043422,GO:0043951,GO:0043951,GO:0046872,GO:0050995	hsa00230,hsa01100,hsa04022,hsa04024,hsa04371,hsa04910,hsa04914,hsa04922,hsa04923,hsa04924,hsa05032
chr11	14928899	14929167	269	*	Intron (ENST00000523376.5/797, intron 5 of 9)	797	ENST00000523376.5	23902	CALCB	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005184,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0006874,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007189,GO:0031716,GO:0051480	hsa04080,hsa04270
chr11	15165580	15165929	350	*	Intron (ENST00000379554.7/387755, intron 2 of 12)	387755	ENST00000530161.5	16472	INSC	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000132,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005938,GO:0007399,GO:0008093,GO:0008356,GO:0009786,GO:0019904,GO:0030154,GO:0030674,GO:0031647,GO:0032991,GO:0032991,GO:0045176,GO:0045179	NA
chr11	1578169	1578664	496	*	Intron (ENST00000524947.1/338651, intron 1 of 1)	338651	ENST00000659213.1	4398	KRTAP5-AS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	15864945	15865207	263	*	Exon (ENST00000659436.1/ENST00000659436.1, exon 1 of 3)	105376570	ENST00000663478.1	-45321	LINC02682	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	15948118	15948543	426	*	Distal Intergenic	102464826	ENST00000352083.7	21078	MIR6073	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	15949240	15949519	280	*	Distal Intergenic	102464826	ENST00000352083.7	20102	MIR6073	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	1736555	1737013	459	*	Intron (ENST00000340134.5/402778, intron 2 of 2)	402778	ENST00000482459.1	12089	IFITM10	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005886,GO:0016021	NA
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chr11	17369918	17370243	326	*	Intron (ENST00000338965.9/374383, intron 4 of 4)	374383	ENST00000530403.1	18019	NCR3LG1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005886,GO:0016021,GO:0050776	NA
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chr11	55562425	55562716	292	*	Distal Intergenic	81309	ENST00000642128.1	7956	OR4C15	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911	hsa04740
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chr11	55834167	55834543	377	*	Distal Intergenic	390144	ENST00000378396.1	-4209	OR5D16	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004930,GO:0004984,GO:0005549,GO:0005886,GO:0007186,GO:0007608,GO:0016021,GO:0050911	hsa04740
chr11	55970719	55970964	246	*	Promoter (<=1kb)	282770	ENST00000641071.2	-774	OR10AG1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004930,GO:0004984,GO:0005515,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911	hsa04740
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chr11	61173967	61174292	326	*	Distal Intergenic	55048	ENST00000535818.1	-12352	VPS37C	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000813,GO:0000813,GO:0000813,GO:0005515,GO:0006612,GO:0006623,GO:0010008,GO:0016197,GO:0016236,GO:0019058,GO:0031902,GO:0036258,GO:0039702,GO:0043162,GO:0043231,GO:0043657,GO:0048306,GO:0070062,GO:0075733	hsa04144
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chr11	61281831	61282073	243	*	3 UTR	220001	ENST00000535710.1	-8025	VWCE	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003674,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005737,GO:0005737,GO:0098586,GO:0098586	NA
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chr11	64485673	64485861	189	*	Distal Intergenic	100996455	ENST00000316124.3	36599	LINC02724	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr11	64504904	64505374	471	*	Exon (ENST00000444862.2/ENST00000444862.2, exon 3 of 3)	55867	ENST00000377585.7	-50316	SLC22A11	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005452,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008514,GO:0009897,GO:0015347,GO:0015698,GO:0015711,GO:0015711,GO:0016324,GO:0046415,GO:0055085,GO:0070062	NA
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chr11	64553046	64553367	322	*	Promoter (2-3kb)	55867	ENST00000377585.7	-2323	SLC22A11	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005452,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008514,GO:0009897,GO:0015347,GO:0015698,GO:0015711,GO:0015711,GO:0016324,GO:0046415,GO:0055085,GO:0070062	NA
chr11	64595354	64595747	394	*	Intron (ENST00000377567.6/116085, intron 3 of 8)	116085	ENST00000336464.7	4091	SLC22A12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005886,GO:0005886,GO:0015143,GO:0015143,GO:0015711,GO:0015747,GO:0016021,GO:0016324,GO:0019725,GO:0030165,GO:0031526,GO:0031526,GO:0042493,GO:0046415,GO:0055085,GO:0070062	NA
chr11	64596011	64596358	348	*	Intron (ENST00000377567.6/116085, intron 3 of 8)	116085	ENST00000336464.7	4748	SLC22A12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005886,GO:0005886,GO:0015143,GO:0015143,GO:0015711,GO:0015747,GO:0016021,GO:0016324,GO:0019725,GO:0030165,GO:0031526,GO:0031526,GO:0042493,GO:0046415,GO:0055085,GO:0070062	NA
chr11	65060984	65061169	186	*	Promoter (2-3kb)	10004	ENST00000358658.8	-2431	NAALADL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0004177,GO:0004180,GO:0005509,GO:0006508,GO:0008233,GO:0008237,GO:0008270,GO:0016021,GO:0016021,GO:0016324,GO:0042803,GO:0043171	NA
chr11	65810244	65810643	400	*	Distal Intergenic	5017	ENST00000532448.1	16535	OVOL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001822,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007283,GO:0007498,GO:0009913,GO:0043588,GO:0046872,GO:0051729,GO:1901994,GO:1990837,GO:2000647	NA
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chr11	65837308	65837526	219	*	Intron (ENST00000533298.5/254122, intron 1 of 3)	254122	ENST00000533236.1	3304	SNX32	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005768,GO:0005829,GO:0015031,GO:0016241,GO:0035091,GO:0042147	hsa04144
chr11	65851344	65851822	479	*	Exon (ENST00000526972.5/254122, exon 5 of 5)	1072	ENST00000530413.1	4651	CFL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005925,GO:0005925,GO:0007010,GO:0007266,GO:0009615,GO:0015629,GO:0016020,GO:0016032,GO:0016363,GO:0022604,GO:0030027,GO:0030027,GO:0030036,GO:0030042,GO:0030042,GO:0030042,GO:0030043,GO:0031258,GO:0031982,GO:0032587,GO:0035722,GO:0040019,GO:0043066,GO:0044794,GO:0048870,GO:0051014,GO:0051015,GO:0051015,GO:0051015,GO:0051293,GO:0061001,GO:0070062	hsa04360,hsa04666,hsa04810,hsa05133,hsa05170
chr11	66309955	66310117	163	*	Distal Intergenic	57124	ENST00000311330.4	6927	CD248	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003674,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005737,GO:0008150,GO:0008284,GO:0009897,GO:0016021,GO:0016477,GO:0030246,GO:0031012,GO:0048535,GO:0050840,GO:0060033,GO:0070062,GO:1990430,GO:2000353	NA
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chr11	77814821	77815206	386	*	Intron (ENST00000308488.11/51773, intron 1 of 15)	51773	ENST00000530604.1	5493	RSF1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003712,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006334,GO:0006338,GO:0006352,GO:0016584,GO:0016887,GO:0031213,GO:0031213,GO:0034080,GO:0042393,GO:0042393,GO:0043392,GO:0045892,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045944,GO:0046872,GO:0050434	NA
chr11	77833405	77833659	255	*	Intron (ENST00000532481.5/28971, intron 1 of 3)	28971	ENST00000533193.5	-7360	AAMDC	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737,GO:0045600	NA
chr11	77854560	77854842	283	*	Intron (ENST00000532481.5/28971, intron 2 of 3)	28971	ENST00000525034.1	13422	AAMDC	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737,GO:0045600	NA
chr11	77854944	77855222	279	*	Intron (ENST00000532481.5/28971, intron 2 of 3)	28971	ENST00000525034.1	13806	AAMDC	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737,GO:0045600	NA
chr11	77856075	77856386	312	*	Intron (ENST00000532481.5/28971, intron 2 of 3)	28971	ENST00000525034.1	14937	AAMDC	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737,GO:0045600	NA
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chr12	129516049	129516235	187	*	Intron (ENST00000422113.7/121256, intron 3 of 8)	101927735	ENST00000542578.1	307448	TMEM132D-AS2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr12	129872633	129872794	162	*	Intron (ENST00000422113.7/121256, intron 1 of 8)	121256	ENST00000422113.7	31231	TMEM132D	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0010923,GO:0016021	NA
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chr12	130623793	130624015	223	*	Intron (ENST00000690449.1/23504, intron 2 of 22)	23504	ENST00000541840.2	9846	RIMBP2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005886,GO:0007274,GO:0010923,GO:0045202	NA
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chr12	132157623	132158599	977	*	Distal Intergenic	79050	ENST00000538784.2	6782	NOC4L	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003723,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005730,GO:0005730,GO:0006364,GO:0006364,GO:0016021,GO:0030692,GO:0031965,GO:0032040	NA
chr12	13218985	13219493	509	*	3 UTR	2012	ENST00000546357.1	5533	EMP1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0008219,GO:0008544,GO:0016021,GO:0032060	NA
chr12	132193520	132193725	206	*	Distal Intergenic	100996246	ENST00000538731.3	-3792	LINC02361	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr12	132193973	132194400	428	*	Distal Intergenic	100996246	ENST00000538731.3	-4245	LINC02361	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr12	132213569	132213817	249	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 6 of 10)	50614	ENST00000538356.1	-7410	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132220518	132220717	200	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 6 of 10)	50614	ENST00000538356.1	-14359	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132225408	132225746	339	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 6 of 10)	50614	ENST00000538356.1	-19249	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132225873	132226392	520	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 6 of 10)	50614	ENST00000538356.1	-19714	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132267579	132267843	265	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 2 of 10)	50614	ENST00000535208.1	7375	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132311318	132311850	533	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 1 of 10)	50614	ENST00000424720.6	17499	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132314667	132314867	201	*	Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 1 of 10)	50614	ENST00000424720.6	14482	GALNT9	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872	hsa00512,hsa00514,hsa01100
chr12	132394541	132394850	310	*	Distal Intergenic	101928416	ENST00000537720.1	64691	LOC101928416	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr12	132424884	132425178	295	*	Exon (ENST00000622182.1/ENST00000622182.1, exon 1 of 1)	57666	ENST00000434748.2	-64373	FBRSL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003723	NA
chr12	132455867	132456360	494	*	Distal Intergenic	57666	ENST00000434748.2	-33191	FBRSL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003723	NA
chr12	132463590	132464052	463	*	Distal Intergenic	57666	ENST00000434748.2	-25499	FBRSL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003723	NA
chr12	132464254	132464697	444	*	Distal Intergenic	57666	ENST00000434748.2	-24854	FBRSL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003723	NA
chr12	132518182	132519599	1418	*	Intron (ENST00000434748.2/57666, intron 2 of 16)	57666	ENST00000542061.2	11152	FBRSL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003723	NA
chr12	132611566	132611912	347	*	Promoter (<=1kb)	100507055	ENST00000376608.9	-984	LRCOL1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005576,GO:0007586,GO:0008047,GO:0016042,GO:0032094,GO:0050790	NA
chr12	132829261	132829720	460	*	Promoter (<=1kb)	2802	ENST00000686751.1	-118	GOLGA3	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005794,GO:0005794,GO:0005829,GO:0006891,GO:0007283,GO:0016020,GO:0017119,GO:0032580,GO:0045296,GO:0090498	NA
chr12	132839602	132840344	743	*	3 UTR	55743	ENST00000545046.5	7458	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132858939	132859384	446	*	Promoter (2-3kb)	55743	ENST00000535527.5	-2374	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132866090	132866829	740	*	Exon (ENST00000623177.1/ENST00000623177.1, exon 1 of 1)	55743	ENST00000535897.1	-4186	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132867112	132867456	345	*	Exon (ENST00000623177.1/ENST00000623177.1, exon 1 of 1)	55743	ENST00000535897.1	-5208	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132877209	132877500	292	*	Intron (ENST00000450056.7/55743, intron 3 of 17)	55743	ENST00000315585.11	5517	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132918794	132919108	315	*	3 UTR	55743	ENST00000499045.2	-9608	CHFR	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132921823	132922232	410	*	3 UTR	55743	ENST00000499045.2	-12637	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132924395	132924704	310	*	3 UTR	55743	ENST00000499045.2	-15209	CHFR	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132924799	132925114	316	*	3 UTR	55743	ENST00000499045.2	-15613	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132925658	132927104	1447	*	Exon (ENST00000360187.9/100289635, exon 5 of 5)	55743	ENST00000499045.2	-16472	CHFR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0000209,GO:0004842,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006511,GO:0007093,GO:0007093,GO:0016567,GO:0016605,GO:0019941,GO:0031398,GO:0031648,GO:0032436,GO:0044779,GO:0046872,GO:0051301,GO:0061630	NA
chr12	132929299	132929538	240	*	Intron (ENST00000536932.5/55743, intron 2 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	19077	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr12	132931258	132931474	217	*	Intron (ENST00000536932.5/55743, intron 2 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	17141	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr12	132931805	132932134	330	*	Intron (ENST00000536932.5/55743, intron 2 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	16481	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr12	132932986	132933611	626	*	Exon (ENST00000360187.9/100289635, exon 4 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	15004	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr12	132933788	132933994	207	*	Intron (ENST00000536932.5/55743, intron 2 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	14621	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr12	132934752	132934971	220	*	Intron (ENST00000536932.5/55743, intron 2 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	13644	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr12	132941067	132941927	861	*	Intron (ENST00000536932.5/55743, intron 2 of 5)	100289635	ENST00000539809.1	6688	ZNF605	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr12	133120359	133120677	319	*	Exon (ENST00000537226.3/101060200, exon 2 of 2)	101060200	ENST00000650709.1	9596	ZNF891	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr12	133135116	133135343	228	*	Intron (ENST00000538918.5/7556, intron 2 of 3)	10795	ENST00000540096.2	4132	ZNF268	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133135649	133135956	308	*	Intron (ENST00000538918.5/7556, intron 2 of 3)	10795	ENST00000540096.2	4665	ZNF268	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
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chr12	133155756	133156225	470	*	Exon (ENST00000426665.6/7556, exon 5 of 5)	7556	ENST00000537119.2	4769	ZNF10	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0032991,GO:0046872	hsa05168
chr12	133156364	133156905	542	*	Exon (ENST00000426665.6/7556, exon 5 of 5)	7556	ENST00000537119.2	5377	ZNF10	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0032991,GO:0046872	hsa05168
chr12	133158699	133158946	248	*	3 UTR	7556	ENST00000537119.2	7712	ZNF10	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0032991,GO:0046872	hsa05168
chr12	13317073	13317307	235	*	Distal Intergenic	283422	ENST00000527705.2	59123	LINC01559	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr12	133172908	133173699	792	*	Intron (ENST00000540096.2/10795, intron 5 of 10)	10795	ENST00000416488.5	-7710	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133182897	133183339	443	*	Promoter (1-2kb)	10795	ENST00000592241.5	1277	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133183906	133184123	218	*	Promoter (2-3kb)	10795	ENST00000592241.5	2286	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133185243	133185757	515	*	Intron (ENST00000540096.2/10795, intron 6 of 10)	10795	ENST00000592241.5	3623	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
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chr12	133193406	133193852	447	*	Promoter (1-2kb)	10795	ENST00000534953.1	1685	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133194244	133194911	668	*	Promoter (2-3kb)	10795	ENST00000534953.1	2523	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133200739	133201015	277	*	Intron (ENST00000540096.2/10795, intron 10 of 10)	10795	ENST00000534953.1	9018	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133201956	133204719	2764	*	3 UTR	10795	ENST00000534953.1	10235	ZNF268	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133205807	133206304	498	*	3 UTR	10795	ENST00000534953.1	14086	ZNF268	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133208461	133208968	508	*	3 UTR	10795	ENST00000534953.1	16740	ZNF268	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007346,GO:0008284,GO:0008285,GO:0015629,GO:0030154,GO:0030335,GO:0043065,GO:0043066,GO:0045597,GO:0045944,GO:0046872,GO:0071157	hsa05168
chr12	133210079	133210955	877	*	3 UTR	647589	ENST00000673940.1	16162	ANHX	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0001654,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357	NA
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chr12	28046907	28047107	201	*	Distal Intergenic	5744	ENST00000545234.6	-74174	PTHLH	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001501,GO:0002076,GO:0005179,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005794,GO:0005829,GO:0007186,GO:0007189,GO:0007189,GO:0007267,GO:0007565,GO:0008284,GO:0008285,GO:0008544,GO:0010468,GO:0030282,GO:0032330,GO:0032331,GO:0046058,GO:0051428,GO:0051428,GO:0061182	hsa04928
chr12	28368680	28368869	190	*	Intron (ENST00000540794.5/55297, intron 2 of 5)	55297	ENST00000539904.1	66046	CCDC91	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005654,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005802,GO:0005829,GO:0015031,GO:0016020,GO:0042802,GO:0090160,GO:0090160	NA
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chr12	30115780	30115960	181	*	Intron (ENST00000653361.1/ENST00000653361.1, intron 1 of 1)	105369717	ENST00000551202.1	180704	LINC02386	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr12	31942107	31942548	442	*	Intron (ENST00000662662.1/105369723, intron 1 of 2)	105369723	ENST00000662662.1	16768	LINC02422	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr12	32289001	32289260	260	*	Intron (ENST00000652176.1/636, intron 2 of 9)	636	ENST00000547680.2	-39142	BICD1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005200,GO:0005515,GO:0005794,GO:0005794,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005881,GO:0006396,GO:0008093,GO:0008093,GO:0008298,GO:0009653,GO:0016020,GO:0016032,GO:0019901,GO:0031267,GO:0031410,GO:0031871,GO:0033365,GO:0033365,GO:0034063,GO:0034452,GO:0034452,GO:0034452,GO:0045298,GO:0045505,GO:0045505,GO:0048260,GO:0048260,GO:0048471,GO:0048471,GO:0070507,GO:0070507,GO:0070840,GO:0070840,GO:0072385,GO:0072393,GO:0072393,GO:0099503,GO:1900275,GO:1900276,GO:1900737,GO:1904781	NA
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chr12	34597681	34597860	180	*	Distal Intergenic	84920	ENST00000266483.7	575185	ALG10	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0106073	hsa00510,hsa01100
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chr12	34634875	34635116	242	*	Distal Intergenic	84920	ENST00000266483.7	612379	ALG10	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0106073	hsa00510,hsa01100
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chr12	37540953	37541221	269	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-775541	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
chr12	37542803	37543059	257	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-773703	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
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chr12	37545919	37546251	333	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-770511	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
chr12	37547797	37548031	235	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-768731	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
chr12	37548895	37549122	228	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-767640	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
chr12	37559363	37559554	192	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-757208	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
chr12	37585352	37585551	200	*	Distal Intergenic	144245	ENST00000551464.1	-731211	ALG10B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005886,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0016021,GO:0016740,GO:0060050,GO:0106073,GO:1901980	hsa00510,hsa01100
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chr13	25410530	25410810	281	*	Intron (ENST00000381655.7/51761, intron 1 of 36)	51761	ENST00000682472.1	38317	ATP8A2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000287,GO:0001750,GO:0003011,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005768,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007409,GO:0007568,GO:0008285,GO:0010842,GO:0010976,GO:0010996,GO:0016021,GO:0016887,GO:0040018,GO:0042472,GO:0042755,GO:0043588,GO:0045332,GO:0048666,GO:0050884,GO:0050908,GO:0060052,GO:0061092,GO:0090555,GO:0140326,GO:0140331,GO:0140346	NA
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chr13	72947144	72947349	206	*	Intron (ENST00000326291.11/10464, intron 14 of 17)	10464	ENST00000489922.5	-22254	PIBF1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002376,GO:0005136,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005813,GO:0007080,GO:0031393,GO:0032695,GO:0032733,GO:0032815,GO:0034451,GO:0042531,GO:0042532,GO:0042976,GO:0060271,GO:0071539,GO:0090307,GO:1905515	NA
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chr13	75584157	75584604	448	*	Intron (ENST00000618773.4/7347, intron 5 of 7)	7347	ENST00000606347.1	15034	UCHL3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004843,GO:0004843,GO:0004843,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006511,GO:0008233,GO:0016567,GO:0016579,GO:0016579,GO:0016579,GO:0018215,GO:0019784,GO:0030163,GO:0043130,GO:0043687	NA
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chr13	76066827	76067093	267	*	Distal Intergenic	100861545	ENST00000565815.1	-131695	LINC00561	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr14	91761983	91762221	239	*	Intron (ENST00000554560.5/79820, intron 1 of 3)	79820	ENST00000556661.5	18467	CATSPERB	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005886,GO:0005929,GO:0007275,GO:0007283,GO:0030154,GO:0032570,GO:0035036,GO:0036128,GO:0036128	NA
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chr14	92364848	92365055	208	*	Intron (ENST00000393265.6/123041, intron 2 of 16)	123041	ENST00000531433.5	41655	SLC24A4	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005262,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006811,GO:0006874,GO:0006874,GO:0007608,GO:0007608,GO:0008273,GO:0008273,GO:0015293,GO:0016020,GO:0035725,GO:0044214,GO:0050896,GO:0070588,GO:0070588,GO:0071805,GO:0097186,GO:0098656	hsa04740
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chr15	56945800	56946020	221	*	Intron (ENST00000438423.6/6938, intron 3 of 20)	6938	ENST00000561152.1	26283	TCF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000785,GO:0000785,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000987,GO:0001228,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005737,GO:0006357,GO:0006955,GO:0007399,GO:0007517,GO:0008134,GO:0016607,GO:0030154,GO:0035497,GO:0043231,GO:0043425,GO:0045666,GO:0045944,GO:0046332,GO:0046982,GO:0070888,GO:0071837,GO:0090575,GO:1902036,GO:1990837	NA
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chr16	13890577	13890837	261	*	Distal Intergenic	2072	ENST00000682617.1	-29301	ERCC4	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000014,GO:0000109,GO:0000110,GO:0000110,GO:0000712,GO:0000723,GO:0000723,GO:0000724,GO:0000724,GO:0000781,GO:0001094,GO:0003677,GO:0003684,GO:0003684,GO:0003697,GO:0003697,GO:0004520,GO:0004520,GO:0004520,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006281,GO:0006281,GO:0006283,GO:0006289,GO:0006289,GO:0006293,GO:0006295,GO:0006295,GO:0006296,GO:0006296,GO:0006296,GO:0006303,GO:0008022,GO:0009411,GO:0009650,GO:0010506,GO:0010521,GO:0032205,GO:0033683,GO:0033683,GO:0034644,GO:0036297,GO:0042802,GO:0047485,GO:0051974,GO:0061819,GO:0070522,GO:0070911,GO:1901255,GO:1904357,GO:1905765,GO:1905768,GO:1990599,GO:1990841	hsa03420,hsa03460
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chr16	9569728	9569881	154	*	Intron (ENST00000653393.2/101927026, intron 4 of 5)	101927026	ENST00000634367.2	27683	LOC101927026	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr17	10348303	10348479	177	*	Intron (ENST00000252172.9/8735, intron 12 of 40)	8735	ENST00000621918.1	16065	MYH13	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000146,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005859,GO:0006936,GO:0009267,GO:0030016,GO:0032982,GO:0051015,GO:0070062	NA
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chr17	10772193	10772625	433	*	Intron (ENST00000647474.1/101101775, intron 3 of 5)	101101775	ENST00000664973.1	5516	TMEM220-AS1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr17	10847133	10847423	291	*	Intron (ENST00000647474.1/101101775, intron 3 of 5)	100289255	ENST00000643787.1	-9039	TMEM238L	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0016021	NA
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chr17	18996293	18997089	797	*	Intron (ENST00000317977.10/125206, intron 8 of 14)	644815	ENST00000399096.2	6691	FAM83G	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007165,GO:0019901,GO:0030509,GO:0030509	NA
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chr17	80727325	80727541	217	*	Intron (ENST00000574767.5/57521, intron 3 of 11)	57521	ENST00000575542.5	-15746	RPTOR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001002,GO:0001003,GO:0001006,GO:0001156,GO:0001558,GO:0001938,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005764,GO:0005765,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007050,GO:0008361,GO:0009267,GO:0010494,GO:0010506,GO:0010800,GO:0016032,GO:0016241,GO:0019901,GO:0030291,GO:0030295,GO:0030307,GO:0030307,GO:0030425,GO:0030674,GO:0030674,GO:0031669,GO:0031929,GO:0031929,GO:0031931,GO:0031931,GO:0032008,GO:0032147,GO:0033138,GO:0038202,GO:0038202,GO:0043025,GO:0044877,GO:0045945,GO:0071230,GO:0071230,GO:0071233,GO:0071889,GO:0071901,GO:0071902,GO:0071902,GO:1900034,GO:1900087	hsa04136,hsa04140,hsa04150,hsa04151,hsa04152,hsa04211,hsa04213,hsa04714,hsa04910,hsa05131,hsa05206
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chr17	81169775	81170310	536	*	Intron (ENST00000414089.5/388428, intron 2 of 5)	9625	ENST00000326724.9	-3554	AATK	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004672,GO:0004713,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0006468,GO:0007420,GO:0008150,GO:0016021,GO:0038083,GO:0048471,GO:0106310,GO:0106311	NA
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chr17	81425636	81426350	715	*	Intron (ENST00000675386.2/57597, intron 2 of 27)	57597	ENST00000585224.1	-17115	BAHCC1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003682	NA
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chr17	81985145	81985296	152	*	Intron (ENST00000581484.5/79058, intron 3 of 6)	79058	ENST00000584454.5	6959	ASPSCR1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006886,GO:0009898,GO:0012505,GO:0012506,GO:0019898,GO:0031401,GO:0033116,GO:0042593,GO:0043231,GO:0046324,GO:0048471	hsa05202
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chr17	82281444	82281798	355	*	Distal Intergenic	1453	ENST00000314028.11	-7744	CSNK1D	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000086,GO:0000139,GO:0001934,GO:0004672,GO:0004672,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004674,GO:0004674,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005794,GO:0005813,GO:0005819,GO:0005829,GO:0005876,GO:0005876,GO:0005886,GO:0006468,GO:0006468,GO:0007020,GO:0007030,GO:0010389,GO:0016055,GO:0018105,GO:0018105,GO:0032436,GO:0032436,GO:0032922,GO:0033116,GO:0034067,GO:0036064,GO:0042752,GO:0042752,GO:0045296,GO:0048208,GO:0048471,GO:0050321,GO:0051225,GO:0051225,GO:0061512,GO:0071539,GO:0090263,GO:0090263,GO:0097711,GO:0106310,GO:0106311,GO:1905426,GO:1905515,GO:1905515,GO:2000052	hsa04340,hsa04390,hsa04540,hsa04710
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chr17	82318500	82319998	1499	*	Promoter (<=1kb)	924	ENST00000312648.8	-892	CD7	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002250,GO:0005515,GO:0005886,GO:0006955,GO:0007169,GO:0016020,GO:0016021,GO:0038023,GO:0042110	hsa04640
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chr17	82945281	82945753	473	*	Promoter (1-2kb)	146712	ENST00000572267.1	-1232	B3GNTL1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0016757	NA
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chr17	83041237	83041907	671	*	Intron (ENST00000320865.4/146712, intron 3 of 12)	146712	ENST00000570947.5	6875	B3GNTL1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0016757	NA
chr17	83042110	83042618	509	*	Intron (ENST00000320865.4/146712, intron 3 of 12)	146712	ENST00000570947.5	6164	B3GNTL1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0016757	NA
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chr17	9833669	9834507	839	*	5 UTR	9340	ENST00000262441.10	7745	GLP2R	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0004930,GO:0004967,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007188,GO:0008284,GO:0008528,GO:0016021,GO:0017046,GO:0071377	hsa04080
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chr17	9881708	9882134	427	*	Intron (ENST00000574745.5/9340, intron 11 of 12)	5957	ENST00000570909.3	19068	RCVRN	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001750,GO:0001917,GO:0005509,GO:0007165,GO:0007601,GO:0007602,GO:0008048,GO:0016020,GO:0030425,GO:0031284,GO:0043204,GO:0051924	hsa04744
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chr19	11721641	11721966	326	*	3 UTR	55552	ENST00000586121.1	16916	ZNF823	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	11722324	11722721	398	*	Exon (ENST00000341191.11/55552, exon 4 of 4)	55552	ENST00000586121.1	16161	ZNF823	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	11723421	11723621	201	*	Intron (ENST00000341191.11/55552, intron 3 of 3)	55552	ENST00000586121.1	15261	ZNF823	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	11726439	11726650	212	*	Intron (ENST00000341191.11/55552, intron 1 of 3)	55552	ENST00000586121.1	12232	ZNF823	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	11756773	11757195	423	*	Exon (ENST00000436907.1/ENST00000436907.1, exon 4 of 4)	126068	ENST00000462251.1	-9805	ZNF441	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	11778512	11778756	245	*	Intron (ENST00000357901.5/126068, intron 3 of 3)	126068	ENST00000409902.5	11420	ZNF441	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	11780277	11781276	1000	*	3 UTR	126068	ENST00000409902.5	13185	ZNF441	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	17020892	17021288	397	*	Intron (ENST00000651564.2/27151, intron 2 of 41)	27151	ENST00000651564.2	5354	CPAMD8	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0001654,GO:0004867,GO:0005615,GO:0005886,GO:0010951	NA
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chr19	21257356	21257587	232	*	Distal Intergenic	170959	ENST00000594821.1	71412	ZNF431	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005634,GO:0006355,GO:0030154,GO:0043433,GO:0046872	hsa05168
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chr19	21677691	21678389	699	*	Exon (ENST00000594186.1/ENST00000594186.1, exon 1 of 1)	400682	ENST00000600907.1	39717	LOC400682	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr19	21816138	21816333	196	*	Intron (ENST00000354959.9/7594, intron 3 of 3)	7594	ENST00000354959.9	19849	ZNF43	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
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chr19	21850811	21851099	289	*	Promoter (<=1kb)	7594	ENST00000598381.5	869	ZNF43	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0003677,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
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chr19	37039403	37039691	289	*	Intron (ENST00000590332.1/147923, intron 1 of 1)	147923	ENST00000587029.5	31544	ZNF420	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0042981,GO:0046872	hsa05168
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chr19	37635376	37636068	693	*	Exon (ENST00000684514.1/22835, exon 6 of 6)	22835	ENST00000589018.5	18661	ZFP30	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	37650099	37650369	271	*	Intron (ENST00000589018.5/22835, intron 1 of 4)	22835	ENST00000589018.5	4360	ZFP30	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	37739086	37740003	918	*	3 UTR	126231	ENST00000339503.7	18593	ZNF573	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	37790305	37791430	1126	*	Intron (ENST00000591908.1/ENST00000591908.1, intron 1 of 1)	126231	ENST00000494605.2	-10427	ZNF573	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	3782213	3782960	748	*	Promoter (<=1kb)	4145	ENST00000588983.5	958	MATK	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004713,GO:0004713,GO:0004715,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005829,GO:0006468,GO:0008284,GO:0016020,GO:0018108,GO:0038128	hsa04722
chr19	37872489	37872821	333	*	Distal Intergenic	100631378	ENST00000433142.6	-17274	WDR87BP	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr19	44010433	44010650	218	*	3 UTR	7773	ENST00000585491.1	3733	ZNF230	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	44475251	44475507	257	*	3 UTR	7733	ENST00000592095.5	24988	ZNF180	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	44476415	44476873	459	*	3 UTR	7733	ENST00000592095.5	23622	ZNF180	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	44484255	44484943	689	*	3 UTR	7733	ENST00000592095.5	15552	ZNF180	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	44493520	44494001	482	*	Intron (ENST00000221327.8/7733, intron 2 of 4)	7733	ENST00000592095.5	6494	ZNF180	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	44495127	44496096	970	*	Intron (ENST00000221327.8/7733, intron 2 of 4)	7733	ENST00000592095.5	4399	ZNF180	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	44498593	44498794	202	*	Promoter (1-2kb)	7733	ENST00000592095.5	1701	ZNF180	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	44521480	44521730	251	*	Intron (ENST00000621342.4/125931, intron 4 of 11)	125931	ENST00000611497.4	7795	CEACAM20	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002376,GO:0016021,GO:0016324,GO:0031528	NA
chr19	4492175	4492756	582	*	Intron (ENST00000616600.5/84717, intron 6 of 15)	84717	ENST00000587016.5	-3577	HDGFL2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003690,GO:0003712,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0030307	NA
chr19	4553837	4554028	192	*	Intron (ENST00000677828.1/10501, intron 9 of 16)	10501	ENST00000586965.1	4429	SEMA6B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001755,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005887,GO:0007411,GO:0030215,GO:0030335,GO:0045499,GO:0048843,GO:0050919,GO:0071526	hsa04360
chr19	46326070	46326233	164	*	Intron (ENST00000377670.9/64344, intron 11 of 14)	64344	ENST00000529542.1	4290	HIF3A	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000785,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001525,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006357,GO:0006366,GO:0006915,GO:0016567,GO:0016607,GO:0043687,GO:0046983,GO:0061418	NA
chr19	47241954	47242413	460	*	Distal Intergenic	27113	ENST00000449228.5	-9188	BBC3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001836,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005739,GO:0005764,GO:0006915,GO:0006919,GO:0051117,GO:0070059,GO:0090200,GO:0097194,GO:1900740,GO:2001244	hsa01524,hsa04115,hsa04210,hsa04215,hsa04390,hsa05016,hsa05162,hsa05200,hsa05210
chr19	4780858	4781364	507	*	Exon (ENST00000663176.1/284424, exon 4 of 4)	407045	ENST00000384898.1	10188	MIR7-3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0035195	hsa05206
chr19	480463	481411	949	*	Distal Intergenic	284451	ENST00000315489.5	-5480	ODF3L2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005856,GO:0005881,GO:0005881	NA
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chr19	481560	481757	198	*	Distal Intergenic	284451	ENST00000315489.5	-6577	ODF3L2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005856,GO:0005881,GO:0005881	NA
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chr19	52069576	52069906	331	*	Intron (ENST00000598446.1/284371, intron 1 of 1)	9668	ENST00000600368.5	-5048	ZNF432	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	52115646	52116296	651	*	3 UTR	284371	ENST00000426391.6	-19881	ZNF841	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
chr19	52116445	52117001	557	*	3 UTR	284371	ENST00000426391.6	-20680	ZNF841	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
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chr19	52307515	52308205	691	*	Exon (ENST00000594379.1/ENST00000594379.1, exon 5 of 7)	147657	ENST00000335090.6	7121	ZNF480	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	52323786	52323993	208	*	3 UTR	162963	ENST00000403906.8	-12250	ZNF610	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	52325707	52325950	244	*	3 UTR	162963	ENST00000403906.8	-10293	ZNF610	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	52705758	52706277	520	*	3 UTR	55769	ENST00000687234.1	-15254	ZNF83	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	52793314	52793553	240	*	Distal Intergenic	162966	ENST00000648973.1	-6507	ZNF600	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
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chr19	52800936	52801122	187	*	Exon (ENST00000457749.7/7576, exon 4 of 4)	7576	ENST00000438150.2	4899	ZNF28	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	NA
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chr19	53239741	53240153	413	*	Exon (ENST00000599328.1/ENST00000599328.1, exon 1 of 1)	342926	ENST00000333952.8	11477	ZNF677	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	53329035	53329343	309	*	Distal Intergenic	91664	ENST00000595091.6	-4406	ZNF845	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
chr19	53351024	53351545	522	*	Exon (ENST00000595091.6/91664, exon 5 of 5)	170958	ENST00000497729.5	-14148	ZNF525	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	NA
chr19	53372041	53372364	324	*	5 UTR	170958	ENST00000593918.1	6312	ZNF525	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	NA
chr19	53407644	53407882	239	*	5 UTR	91661	ENST00000594030.2	12471	ZNF765	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	53407925	53408440	516	*	Exon (ENST00000396408.8/91661, exon 4 of 4)	91661	ENST00000594030.2	12752	ZNF765	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	53439797	53440157	361	*	Intron (ENST00000424846.3/147804, intron 1 of 1)	388561	ENST00000432094.6	-4844	ZNF761	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	53454625	53455108	484	*	3 UTR	388561	ENST00000334095.4	4729	ZNF761	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	58212650	58213057	408	*	Exon (ENST00000424679.6/10782, exon 5 of 5)	10782	ENST00000595146.1	4552	ZNF274	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000978,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005515,GO:0005730,GO:0005737,GO:0006355,GO:0006357,GO:0043565,GO:0046872,GO:1900112,GO:1990837	hsa04722
chr19	58254313	58254772	460	*	Intron (ENST00000599227.5/27300, intron 6 of 6)	27300	ENST00000651034.1	-6169	ZNF544	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
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chr19	58261294	58263815	2522	*	Promoter (<=1kb)	27300	ENST00000651034.1	353	ZNF544	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872	hsa05168
chr19	58271471	58271659	189	*	Intron (ENST00000637233.1/108903150, intron 6 of 11)	105372482	ENST00000693494.1	7149	105372482	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr19	58312074	58312803	730	*	5 UTR	105372481	ENST00000590505.1	3044	ERVK3-1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr19	58338743	58338940	198	*	Exon (ENST00000329665.5/342945, exon 3 of 3)	102465484	ENST00000622141.1	4055	MIR6806	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr19	58415643	58415892	250	*	Exon (ENST00000596921.5/201514, exon 2 of 3)	201514	ENST00000322834.7	6866	ZNF584	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	58432478	58433158	681	*	3 UTR	7691	ENST00000254166.4	6995	ZNF132	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	58434168	58434535	368	*	Exon (ENST00000254166.4/7691, exon 3 of 3)	7691	ENST00000254166.4	5618	ZNF132	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	58434797	58435263	467	*	Exon (ENST00000254166.4/7691, exon 3 of 3)	7691	ENST00000254166.4	4890	ZNF132	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	58448925	58449236	312	*	Promoter (2-3kb)	388569	ENST00000545523.5	-2375	ZNF324B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	58449685	58449927	243	*	Promoter (1-2kb)	388569	ENST00000545523.5	-1684	ZNF324B	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
chr19	6132254	6132712	459	*	Promoter (2-3kb)	81616	ENST00000591738.5	-2535	ACSBG2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004467,GO:0004467,GO:0005524,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006631,GO:0007275,GO:0007283,GO:0016020,GO:0016405,GO:0030154,GO:0035338,GO:0042759,GO:0047617,GO:0047676	hsa00061,hsa00071,hsa01100,hsa01212,hsa03320,hsa04920
chr19	6292088	6292237	150	*	Distal Intergenic	4298	ENST00000252674.9	-12113	MLLT1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001650,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006366,GO:0006368,GO:0006469,GO:0008023	hsa05202
chr19	6453959	6454603	645	*	Promoter (<=1kb)	79085	ENST00000595810.5	0	SLC25A23	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002082,GO:0005347,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005739,GO:0005743,GO:0006851,GO:0015867,GO:0016021,GO:0036444,GO:0043457,GO:0051282,GO:0051561,GO:0071277,GO:0097274,GO:1900069	NA
chr19	6564578	6564921	344	*	Distal Intergenic	970	ENST00000423145.7	26218	CD70	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002020,GO:0002456,GO:0005102,GO:0005125,GO:0005164,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007165,GO:0007267,GO:0019724,GO:0033209,GO:0042100,GO:0042102,GO:0070062,GO:0097191	hsa04060
chr19	667605	667843	239	*	Exon (ENST00000591866.2/ENST00000591866.2, exon 2 of 2)	55658	ENST00000589762.5	-4372	RNF126	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005154,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006511,GO:0006511,GO:0006513,GO:0042059,GO:0042127,GO:0042147,GO:0043161,GO:0043162,GO:0046872,GO:0061630,GO:0070534,GO:0070936,GO:0071629	NA
chr19	6694343	6694713	371	*	Promoter (1-2kb)	718	ENST00000598805.2	-1260	C3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001798,GO:0001934,GO:0001970,GO:0004866,GO:0005102,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005788,GO:0005886,GO:0006631,GO:0006954,GO:0006955,GO:0006956,GO:0006956,GO:0006956,GO:0006957,GO:0006958,GO:0007165,GO:0007186,GO:0009617,GO:0009986,GO:0010575,GO:0010828,GO:0010866,GO:0010884,GO:0010951,GO:0016322,GO:0030449,GO:0031715,GO:0032991,GO:0034774,GO:0035578,GO:0035846,GO:0043312,GO:0043687,GO:0044267,GO:0045745,GO:0045766,GO:0048260,GO:0050776,GO:0060100,GO:0070062,GO:0072562,GO:0097242,GO:0097278,GO:0150062,GO:0150064,GO:1905114,GO:2000427	hsa04080,hsa04145,hsa04610,hsa04613,hsa05131,hsa05133,hsa05134,hsa05140,hsa05142,hsa05150,hsa05152,hsa05167,hsa05168,hsa05171,hsa05203,hsa05322
chr19	6794982	6795356	375	*	Intron (ENST00000602142.6/7409, intron 1 of 26)	7409	ENST00000599806.5	10864	VAV1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001784,GO:0005085,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005911,GO:0006955,GO:0007186,GO:0007229,GO:0007264,GO:0008361,GO:0008361,GO:0019221,GO:0030168,GO:0030217,GO:0030593,GO:0031295,GO:0038095,GO:0038096,GO:0043065,GO:0043087,GO:0043547,GO:0045954,GO:0046579,GO:0046872,GO:0048010,GO:0051056,GO:0051897,GO:0072593,GO:0140031	hsa04015,hsa04024,hsa04062,hsa04510,hsa04650,hsa04660,hsa04662,hsa04664,hsa04666,hsa04670,hsa04810,hsa05135,hsa05205,hsa05417
chr19	6819998	6820259	262	*	Promoter (2-3kb)	7409	ENST00000594082.1	-2178	VAV1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001784,GO:0005085,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005911,GO:0006955,GO:0007186,GO:0007229,GO:0007264,GO:0008361,GO:0008361,GO:0019221,GO:0030168,GO:0030217,GO:0030593,GO:0031295,GO:0038095,GO:0038096,GO:0043065,GO:0043087,GO:0043547,GO:0045954,GO:0046579,GO:0046872,GO:0048010,GO:0051056,GO:0051897,GO:0072593,GO:0140031	hsa04015,hsa04024,hsa04062,hsa04510,hsa04650,hsa04660,hsa04662,hsa04664,hsa04666,hsa04670,hsa04810,hsa05135,hsa05205,hsa05417
chr19	6874249	6874445	197	*	Distal Intergenic	2015	ENST00000250572.12	-13121	ADGRE1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002250,GO:0004930,GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007189	NA
chr19	6894484	6894723	240	*	Promoter (1-2kb)	2015	ENST00000596944.1	-1656	ADGRE1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002250,GO:0004930,GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007189	NA
chr19	6900979	6901258	280	*	Intron (ENST00000250572.12/2015, intron 5 of 19)	2015	ENST00000595026.1	4573	ADGRE1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002250,GO:0004930,GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007189	NA
chr19	6901614	6901948	335	*	Exon (ENST00000250572.12/2015, exon 6 of 20)	2015	ENST00000595026.1	5208	ADGRE1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002250,GO:0004930,GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007189	NA
chr19	6906596	6907121	526	*	Intron (ENST00000250572.12/2015, intron 9 of 19)	2015	ENST00000595026.1	10190	ADGRE1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002250,GO:0004930,GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007189	NA
chr19	6983456	6983928	473	*	Intron (ENST00000600751.6/326342, intron 5 of 16)	326342	ENST00000597372.2	6870	ADGRE4P	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr19	6986018	6986244	227	*	Intron (ENST00000600751.6/326342, intron 4 of 16)	326342	ENST00000597372.2	4554	ADGRE4P	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr19	6986324	6986752	429	*	Exon (ENST00000600751.6/326342, exon 4 of 17)	326342	ENST00000597372.2	4046	ADGRE4P	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr19	7079639	7080107	469	*	Intron (ENST00000252840.11/79230, intron 5 of 7)	79230	ENST00000414706.2	9934	ZNF557	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr19	8239821	8240096	276	*	Intron (ENST00000561008.5/79603, intron 2 of 3)	79603	ENST00000557925.1	-10430	CERS4	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003677,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0016021,GO:0016410,GO:0030148,GO:0046513,GO:0046513,GO:0050291,GO:0050291	hsa00600,hsa01100,hsa04071
chr19	8243345	8243684	340	*	Intron (ENST00000561008.5/79603, intron 2 of 3)	79603	ENST00000557925.1	-6842	CERS4	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003677,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0016021,GO:0016410,GO:0030148,GO:0046513,GO:0046513,GO:0050291,GO:0050291	hsa00600,hsa01100,hsa04071
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chr2	116530705	116530953	249	*	Distal Intergenic	57628	ENST00000473362.1	716042	DPP10	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005886,GO:0006508,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008236,GO:0008239,GO:0008239,GO:0015459,GO:0016020,GO:0044325,GO:0072659,GO:1901379,GO:1901379,GO:1903078	NA
chr2	11661936	11662189	254	*	Exon (ENST00000306928.6/23620, exon 2 of 4)	23620	ENST00000306928.6	8006	NTSR2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004930,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007200,GO:0007218,GO:0007600,GO:0016492,GO:0042391	hsa04080
chr2	117028284	117028552	269	*	Distal Intergenic	8886	ENST00000263239.7	-786139	DDX18	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000463,GO:0003723,GO:0003724,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005694,GO:0005730,GO:0005730,GO:0016020,GO:0071392	NA
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chr2	117126541	117126864	324	*	Distal Intergenic	8886	ENST00000263239.7	-687827	DDX18	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000463,GO:0003723,GO:0003724,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005694,GO:0005730,GO:0005730,GO:0016020,GO:0071392	NA
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chr2	1256322	1256569	248	*	Exon (ENST00000489646.1/54221, exon 2 of 2)	54221	ENST00000471239.1	-6275	SNTG2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003779,GO:0005198,GO:0005515,GO:0005622,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005886,GO:0007417,GO:0016010,GO:0016013,GO:0030165,GO:0042383,GO:0097109	NA
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chr2	126039414	126039631	218	*	Distal Intergenic	105373600	ENST00000455174.2	78354	LINC01941	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr2	12654609	12654882	274	*	Intron (ENST00000664018.1/100506457, intron 4 of 5)	28951	ENST00000483034.1	-62028	TRIB2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000166,GO:0004672,GO:0004860,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005856,GO:0006468,GO:0006469,GO:0008134,GO:0031434,GO:0031625,GO:0032436,GO:0032436,GO:0032693,GO:0043405,GO:0043405,GO:0045599,GO:0055106	NA
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chr2	12796778	12797025	248	*	Intron (ENST00000663507.1/100506474, intron 4 of 6)	100422986	ENST00000579927.1	59411	MIR3125	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr21	34167274	34167564	291	*	Intron (ENST00000362077.4/64968, intron 2 of 5)	114036	ENST00000630751.2	9550	LINC00310	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr21	34324062	34324246	185	*	Intron (ENST00000362077.4/64968, intron 5 of 5)	9992	ENST00000290310.4	-39760	KCNE2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005242,GO:0005251,GO:0005251,GO:0005515,GO:0005764,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007568,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008076,GO:0009986,GO:0015459,GO:0015459,GO:0035690,GO:0042802,GO:0043586,GO:0044325,GO:0044325,GO:0060306,GO:0060307,GO:0060307,GO:0061337,GO:0071805,GO:0086002,GO:0086005,GO:0086005,GO:0086009,GO:0086011,GO:0086011,GO:0086091,GO:0086091,GO:0097623,GO:0097623,GO:0098915,GO:1901379,GO:1901387,GO:1901800,GO:1901979,GO:1902159,GO:1902259,GO:1902260,GO:1902260,GO:1902282,GO:1990573	hsa04971
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chr22	32620327	32620720	394	*	Intron (ENST00000358763.7/8224, intron 6 of 13)	105373004	ENST00000428201.1	37027	SYN3-AS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr22	32621028	32621317	290	*	Intron (ENST00000358763.7/8224, intron 6 of 13)	105373004	ENST00000428201.1	37728	SYN3-AS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr22	43462015	43462200	186	*	Intron (ENST00000417669.6/758, intron 3 of 6)	758	ENST00000480239.1	45260	MPPED1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150,GO:0016787	NA
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chr22	45134453	45134962	510	*	Exon (ENST00000426282.6/100506714, exon 3 of 3)	100506714	ENST00000665704.1	4795	NUP50-DT	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr22	49580292	49581072	781	*	Intron (ENST00000414287.5/348645, intron 1 of 4)	100500882	ENST00000581025.1	-36826	MIR3667	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr22	49702047	49702499	453	*	Distal Intergenic	348645	ENST00000400023.5	-44505	MIR3667HG	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr22	49901396	49902077	682	*	3 UTR	79087	ENST00000486602.1	5841	ALG12	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000009,GO:0000030,GO:0000030,GO:0005783,GO:0005788,GO:0005789,GO:0005789,GO:0006457,GO:0006487,GO:0006488,GO:0006488,GO:0016020,GO:0016021,GO:0052917,GO:0097502	hsa00510,hsa00513,hsa01100
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chr3	11963097	11963294	198	*	Distal Intergenic	6854	ENST00000621198.5	-41094	SYN2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005524,GO:0005886,GO:0007268,GO:0007269,GO:0007269,GO:0014069,GO:0017156,GO:0030672,GO:0030672,GO:0031201,GO:0042802,GO:0045202,GO:0097091,GO:0098685,GO:0098978	NA
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chr3	13213709	13214022	314	*	Intron (ENST00000648114.1/9922, intron 1 of 15)	9922	ENST00000648114.1	69259	IQSEC1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005085,GO:0005515,GO:0005730,GO:0008021,GO:0008289,GO:0014069,GO:0016020,GO:0030036,GO:0032012,GO:0043231,GO:0043547,GO:0051549,GO:0060996,GO:0120183	hsa04144
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chr3	13408813	13409184	372	*	Intron (ENST00000254508.7/23225, intron 1 of 39)	23225	ENST00000695492.1	11071	NUP210	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005635,GO:0005643,GO:0005789,GO:0006110,GO:0006406,GO:0006409,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016032,GO:0016925,GO:0019083,GO:0031965,GO:0043657,GO:0060964,GO:0065003,GO:0075733,GO:1900034	hsa03013,hsa05014
chr3	134346249	134346491	243	*	Distal Intergenic	51421	ENST00000506326.1	20350	51421	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr3	13539749	13539903	155	*	Distal Intergenic	2199	ENST00000404922.8	-9222	FBLN2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005201,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0010811,GO:0030023,GO:0030023,GO:0030198,GO:0031012,GO:0050840,GO:0062023,GO:0062023,GO:1903561	NA
chr3	13540950	13541191	242	*	Distal Intergenic	2199	ENST00000404922.8	-7934	FBLN2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005201,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0010811,GO:0030023,GO:0030023,GO:0030198,GO:0031012,GO:0050840,GO:0062023,GO:0062023,GO:1903561	NA
chr3	13541321	13541798	478	*	Distal Intergenic	2199	ENST00000404922.8	-7327	FBLN2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005201,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0010811,GO:0030023,GO:0030023,GO:0030198,GO:0031012,GO:0050840,GO:0062023,GO:0062023,GO:1903561	NA
chr3	13542298	13542591	294	*	Distal Intergenic	2199	ENST00000404922.8	-6534	FBLN2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005201,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0010811,GO:0030023,GO:0030023,GO:0030198,GO:0031012,GO:0050840,GO:0062023,GO:0062023,GO:1903561	NA
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chr3	15656188	15656578	391	*	Intron (ENST00000673620.1/686, intron 3 of 3)	23243	ENST00000498713.1	19645	ANKRD28	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000139,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0048208	NA
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chr3	40624046	40624333	288	*	Exon (ENST00000689790.1/ENST00000689790.1, exon 1 of 1)	285268	ENST00000492098.1	94758	ZNF621	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr3	44657072	44657491	420	*	Intron (ENST00000396056.7/7584, intron 3 of 3)	7584	ENST00000453164.1	8327	ZNF35	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007283,GO:0043565,GO:0046872,GO:0048471,GO:0071300	NA
chr3	44657655	44658359	705	*	Intron (ENST00000396056.7/7584, intron 3 of 3)	7584	ENST00000453164.1	8910	ZNF35	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000977,GO:0000981,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007283,GO:0043565,GO:0046872,GO:0048471,GO:0071300	NA
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chr3	45482861	45483219	359	*	Intron (ENST00000650792.2/23395, intron 9 of 20)	23395	ENST00000467936.5	-17322	LARS2	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0002161,GO:0004823,GO:0004823,GO:0004823,GO:0005524,GO:0005739,GO:0005759,GO:0006418,GO:0006429,GO:0006429,GO:0032543,GO:0106074	hsa00970
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chr3	99804726	99805507	782	*	Exon (ENST00000608028.1/ENST00000608028.1, exon 1 of 1)	84319	ENST00000463526.1	-12330	84319	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr4	116096898	116097117	220	*	Exon (ENST00000513136.2/ENST00000513136.2, exon 1 of 1)	105377383	ENST00000509983.1	200040	LOC105377383	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr4	38467370	38467618	249	*	Intron (ENST00000512517.1/101928776, intron 2 of 7)	101928776	ENST00000669996.1	22804	LINC01258	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr5	140781568	140781889	322	*	Distal Intergenic	56147	ENST00000378133.4	-4247	PCDHA1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005509,GO:0005576,GO:0005783,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007399	NA
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chr5	14164673	14165084	412	*	Intron (ENST00000698541.1/7204, intron 1 of 36)	7204	ENST00000509967.6	-18714	TRIO	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0004674,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005829,GO:0006468,GO:0007185,GO:0007186,GO:0007411,GO:0007417,GO:0042995,GO:0043065,GO:0045599,GO:0048812,GO:0050790,GO:0051056,GO:0106310,GO:0106311	NA
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chr5	179076880	179077076	197	*	Exon (ENST00000315475.7/30832, exon 4 of 5)	30832	ENST00000315475.7	16507	ZNF354C	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0046872	hsa05168
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chr5	77785171	77785553	383	*	Exon (ENST00000515712.1/ENST00000515712.1, exon 1 of 1)	6902	ENST00000380377.9	-8832	TBCA	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0003723,GO:0005515,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005874,GO:0006457,GO:0006457,GO:0007021,GO:0007023,GO:0015630,GO:0015630,GO:0015631,GO:0048487,GO:0051087	NA
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chr5	8151250	8151467	218	*	Distal Intergenic	4552	ENST00000508354.1	254813	MTRR	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000096,GO:0003958,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006306,GO:0006555,GO:0009086,GO:0009086,GO:0009235,GO:0010181,GO:0010181,GO:0010181,GO:0016491,GO:0016709,GO:0016723,GO:0030586,GO:0030586,GO:0030586,GO:0032259,GO:0033353,GO:0043418,GO:0045111,GO:0046655,GO:0046655,GO:0050660,GO:0050660,GO:0050660,GO:0050661,GO:0050667,GO:0070402,GO:0071949,GO:1904042	NA
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chr5	8327001	8327395	395	*	Intron (ENST00000654773.1/ENST00000654773.1, intron 1 of 1)	100505738	ENST00000667556.1	-123306	MIR4458HG	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
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chr5	8340084	8340652	569	*	Intron (ENST00000654773.1/ENST00000654773.1, intron 1 of 1)	100505738	ENST00000667556.1	-110049	MIR4458HG	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr5	8374262	8374639	378	*	Intron (ENST00000501071.2/729506, intron 3 of 5)	100505738	ENST00000667556.1	-76062	MIR4458HG	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr5	8386808	8387316	509	*	Intron (ENST00000501071.2/729506, intron 3 of 5)	100505738	ENST00000667556.1	-63385	MIR4458HG	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr5	8390768	8390988	221	*	Intron (ENST00000501071.2/729506, intron 2 of 5)	100505738	ENST00000667556.1	-59713	MIR4458HG	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	NA	NA
chr5	83998784	83998993	210	*	Intron (ENST00000296591.10/10085, intron 9 of 10)	10085	ENST00000510271.1	79835	EDIL3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005178,GO:0005201,GO:0005509,GO:0007155,GO:0007275,GO:0010811,GO:0062023,GO:0070062,GO:1903561	NA
chr5	84002751	84003030	280	*	Intron (ENST00000296591.10/10085, intron 9 of 10)	10085	ENST00000510271.1	75798	EDIL3	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0005178,GO:0005201,GO:0005509,GO:0007155,GO:0007275,GO:0010811,GO:0062023,GO:0070062,GO:1903561	NA
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chr5	9200857	9201241	385	*	Intron (ENST00000382496.10/9037, intron 9 of 22)	9037	ENST00000514923.4	64304	SEMA5A	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001755,GO:0001938,GO:0002043,GO:0005886,GO:0007155,GO:0007162,GO:0007267,GO:0007399,GO:0007411,GO:0007413,GO:0016020,GO:0016021,GO:0021536,GO:0030215,GO:0030215,GO:0030335,GO:0030836,GO:0035373,GO:0043395,GO:0045499,GO:0045545,GO:0045766,GO:0048675,GO:0048842,GO:0048843,GO:0048843,GO:0050918,GO:0050919,GO:0051897,GO:0060326,GO:0070062,GO:0071526,GO:0090263,GO:1990256,GO:2000352,GO:2001028	hsa04360
chr5	9218724	9219290	567	*	Intron (ENST00000382496.10/9037, intron 8 of 22)	9037	ENST00000514923.4	46255	SEMA5A	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001755,GO:0001938,GO:0002043,GO:0005886,GO:0007155,GO:0007162,GO:0007267,GO:0007399,GO:0007411,GO:0007413,GO:0016020,GO:0016021,GO:0021536,GO:0030215,GO:0030215,GO:0030335,GO:0030836,GO:0035373,GO:0043395,GO:0045499,GO:0045545,GO:0045766,GO:0048675,GO:0048842,GO:0048843,GO:0048843,GO:0050918,GO:0050919,GO:0051897,GO:0060326,GO:0070062,GO:0071526,GO:0090263,GO:1990256,GO:2000352,GO:2001028	hsa04360
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chr5	9732069	9732496	428	*	Intron (ENST00000511616.5/285692, intron 5 of 12)	50834	ENST00000514078.1	-19691	TAS2R1	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0001580,GO:0001580,GO:0004930,GO:0005886,GO:0007186,GO:0008527,GO:0016021,GO:0016021,GO:0033038,GO:0033038	hsa04742
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chr6	140218552	140218799	248	*	Intron (ENST00000683950.1/ENST00000683950.1, intron 1 of 1)	100500879	ENST00000582138.1	13300	MIR3668	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr6	142213430	142213721	292	*	Intron (ENST00000452973.6/51534, intron 5 of 5)	51534	ENST00000491881.1	43084	VTA1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005654,GO:0005771,GO:0005829,GO:0005829,GO:0008022,GO:0010008,GO:0015031,GO:0016197,GO:0016236,GO:0019058,GO:0032511,GO:0036258,GO:0043231,GO:0046755,GO:0070062,GO:0071985,GO:1904903	hsa04144
chr6	14228684	14228937	254	*	Distal Intergenic	102216342	ENST00000427276.1	56208	LINC01108	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr6	143377863	143378159	297	*	Distal Intergenic	134637	ENST00000606514.5	63818	ADAT2	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0002100,GO:0005515,GO:0005654,GO:0006400,GO:0008270,GO:0052717	NA
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chr6	1451147	1451697	551	*	Distal Intergenic	102466720	ENST00000611664.1	-60736	MIR6720	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
chr6	145442391	145442725	335	*	Intron (ENST00000638717.1/7957, intron 4 of 4)	7957	ENST00000638597.1	191957	EPM2A	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005634,GO:0016239,GO:0032007	NA
chr6	145728831	145729076	246	*	Intron (ENST00000638717.1/7957, intron 1 of 4)	7957	ENST00000638554.1	6200	EPM2A	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0005515,GO:0005634,GO:0016239,GO:0032007	NA
chr6	145790311	145790662	352	*	Exon (ENST00000638502.1/ENST00000638502.1, exon 1 of 1)	100507557	ENST00000629681.1	-8747	EPM2A-DT	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	NA	NA
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chr7	6675514	6675733	220	*	Intron (ENST00000366167.2/ENST00000366167.2, intron 2 of 3)	7559	ENST00000404360.5	25181	ZNF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
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chr7	6687736	6688136	401	*	Intron (ENST00000366167.2/ENST00000366167.2, intron 2 of 3)	7559	ENST00000404360.5	12778	ZNF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
chr7	6688957	6689596	640	*	3 UTR	7559	ENST00000404360.5	11318	ZNF12	HeLa-S3	h3k9me3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
chr7	6690672	6692402	1731	*	3 UTR	7559	ENST00000404360.5	8512	ZNF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
chr7	6692685	6693998	1314	*	Exon (ENST00000404360.5/7559, exon 4 of 5)	7559	ENST00000404360.5	6916	ZNF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
chr7	6694472	6694817	346	*	Intron (ENST00000366167.2/ENST00000366167.2, intron 2 of 3)	7559	ENST00000404360.5	6097	ZNF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
chr7	6695580	6695877	298	*	Intron (ENST00000366167.2/ENST00000366167.2, intron 2 of 3)	7559	ENST00000404360.5	5037	ZNF12	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005813,GO:0006357,GO:0045892,GO:0046872,GO:1990837	hsa05168
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chr9	130494096	130495244	1149	*	Exon (ENST00000352480.10/445, exon 13 of 15)	445	ENST00000372386.6	14240	ASS1	HeLa-S3	H3K9ME3	GSE29611	GO:0000050,GO:0000050,GO:0000050,GO:0000050,GO:0000052,GO:0000053,GO:0000053,GO:0001822,GO:0001889,GO:0003723,GO:0004055,GO:0004055,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005741,GO:0005764,GO:0005783,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006526,GO:0006526,GO:0006526,GO:0006531,GO:0006953,GO:0007494,GO:0007568,GO:0007584,GO:0007623,GO:0010043,GO:0010046,GO:0015643,GO:0016597,GO:0032355,GO:0042493,GO:0042802,GO:0043204,GO:0045429,GO:0060416,GO:0060539,GO:0070062,GO:0070852,GO:0071222,GO:0071230,GO:0071242,GO:0071320,GO:0071346,GO:0071356,GO:0071377,GO:0071400,GO:0071418,GO:0071499,GO:0071549,GO:1903038	hsa00220,hsa00250,hsa01100,hsa01230,hsa05418
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