seqnames start end width strand annotation geneId transcriptId distanceToTSS Symbol Type HM GSE GO KEGG chr1 106315296 106315689 394 * Distal Intergenic 107985116 ENST00000634868.1 276749 LOC107985116 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106369220 106369972 753 * Distal Intergenic 107985116 ENST00000634868.1 330673 LOC107985116 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106482900 106483245 346 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -334979 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106504636 106505019 384 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -313205 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106539583 106541077 1495 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -277147 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106577976 106578600 625 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -239624 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106582897 106583679 783 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -234545 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106607227 106607931 705 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -210293 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106635008 106635459 452 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -182765 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106673411 106673764 354 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -144460 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106685910 106686343 434 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -131881 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106728949 106729279 331 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -88945 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106735590 106736004 415 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -82220 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106775132 106776884 1753 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -41340 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106780757 106781359 603 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -36865 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106806618 106806965 348 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -11259 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106813389 106813895 507 * Distal Intergenic 105378889 ENST00000659929.1 -4329 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106822682 106823026 345 * Intron (ENST00000659929.1/105378889, intron 2 of 4) 105378889 ENST00000415910.3 4421 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 106829747 106830119 373 * Intron (ENST00000659929.1/105378889, intron 2 of 4) 105378889 ENST00000415910.3 11486 LINC01661 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 107100679 107101205 527 * Distal Intergenic 22854 ENST00000370073.6 -38802 NTNG1 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007409,GO:0009887,GO:0009888,GO:0010975,GO:0016477,GO:0034446,GO:0043256,GO:0046658,GO:0050804,GO:0050839,GO:0070831,GO:0098632,GO:0098632,GO:0098685,GO:0098978,GO:0099029,GO:0099560,GO:0150011,GO:2001222 hsa04360,hsa04514 chr1 107103064 107103640 577 * Distal Intergenic 22854 ENST00000370073.6 -36367 NTNG1 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007409,GO:0009887,GO:0009888,GO:0010975,GO:0016477,GO:0034446,GO:0043256,GO:0046658,GO:0050804,GO:0050839,GO:0070831,GO:0098632,GO:0098632,GO:0098685,GO:0098978,GO:0099029,GO:0099560,GO:0150011,GO:2001222 hsa04360,hsa04514 chr1 107170291 107171040 750 * Intron (ENST00000370073.6/22854, intron 2 of 7) 22854 ENST00000370066.5 21697 NTNG1 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007409,GO:0009887,GO:0009888,GO:0010975,GO:0016477,GO:0034446,GO:0043256,GO:0046658,GO:0050804,GO:0050839,GO:0070831,GO:0098632,GO:0098632,GO:0098685,GO:0098978,GO:0099029,GO:0099560,GO:0150011,GO:2001222 hsa04360,hsa04514 chr1 107203652 107204095 444 * Intron (ENST00000370073.6/22854, intron 2 of 7) 22854 ENST00000370066.5 55058 NTNG1 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 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Distal Intergenic 106144535 ENST00000667298.1 577083 LINC01037 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 192108947 192109192 246 * Distal Intergenic 64407 ENST00000367460.4 -49270 RGS18 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0003924,GO:0005096,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005886,GO:0007186,GO:0008277,GO:0009968,GO:0043547 NA chr1 193513663 193514161 499 * Intron (ENST00000656143.1/ENST00000656143.1, intron 1 of 5) 101929184 ENST00000660270.1 164532 LINC01031 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 193846391 193846898 508 * Intron (ENST00000656143.1/ENST00000656143.1, intron 2 of 5) 101929184 ENST00000660270.1 497260 LINC01031 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 194236189 194236804 616 * Distal Intergenic 101929184 ENST00000660270.1 887058 LINC01031 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 194267229 194267532 304 * Distal Intergenic 101929184 ENST00000660270.1 918098 LINC01031 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 194864912 194865264 353 * Intron (ENST00000648938.1/ENST00000648938.1, intron 3 of 3) 105371672 ENST00000657207.1 898161 LOC105371672 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 194927150 194927578 429 * Intron (ENST00000648938.1/ENST00000648938.1, intron 1 of 3) 105371672 ENST00000657207.1 835847 LOC105371672 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 195167455 195167724 270 * Distal Intergenic 105371672 ENST00000657207.1 595701 LOC105371672 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 195582102 195582560 459 * Distal Intergenic 105371672 ENST00000657207.1 180865 LOC105371672 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 195954754 195954998 245 * Distal Intergenic 105371673 ENST00000430519.2 110237 LINC01724 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr1 196644691 196645031 341 * Distal Intergenic 3075 ENST00000359637.3 -6723 CFH MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0006956,GO:0006957,GO:0008201,GO:0016032,GO:0030449,GO:0030449,GO:0042802,GO:0043395,GO:0070062,GO:0072562,GO:1903659 hsa04610,hsa05150 chr1 215419912 215420343 432 * Distal Intergenic 51133 ENST00000259154.9 -146961 KCTD3 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005886,GO:0051260 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(ENST00000670890.2/101928322, intron 1 of 2) 101928322 ENST00000661560.1 32176 CELF2-DT MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr10 107753619 107754010 392 * Intron (ENST00000630847.2/103695365, intron 5 of 5) 103695365 ENST00000622852.1 286689 LINC01435 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr10 107925399 107925724 326 * Intron (ENST00000630847.2/103695365, intron 2 of 5) 103695365 ENST00000622852.1 114975 LINC01435 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr10 10953132 10953472 341 * Promoter (<=1kb) 254312 ENST00000601050.6 -898 LINC00710 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr10 114986618 114986924 307 * Distal Intergenic 102724589 ENST00000433085.1 -7733 LINC02626 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr10 120129463 120129838 376 * Distal Intergenic 100616322 ENST00000580643.1 170950 MIR4682 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr10 122895556 122895986 431 * Intron (ENST00000425266.3/399815, intron 5 of 5) 118670 ENST00000368894.2 -14624 FAM24A MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005576 NA chr10 1812340 1812698 359 * Distal Intergenic 105 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4) 338811 ENST00000550003.1 13917 TAFA2 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005615,GO:0005634,GO:0005737,GO:0007165,GO:0007613,GO:0008542,GO:0048018 NA chr12 71097405 71097752 348 * Intron (ENST00000548497.1/ENST00000548497.1, intron 1 of 4) 7103 ENST00000552128.2 41523 TSPAN8 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005178,GO:0005515,GO:0005887,GO:0007283,GO:0009986,GO:0010468,GO:0030195,GO:0070062 NA chr12 72158585 72158987 403 * Intron (ENST00000547348.5/121278, intron 2 of 3) 29953 ENST00000548156.1 71319 TRHDE MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0004177,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006508,GO:0007165,GO:0007267,GO:0008217,GO:0008270,GO:0042277,GO:0043171,GO:0070006,GO:0070062 NA chr12 72317956 72318289 334 * Intron (ENST00000548156.1/29953, intron 2 of 4) 283392 ENST00000663912.1 -41002 TRHDE-AS1 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr12 72629315 72629904 590 * Intron (ENST00000261180.10/29953, intron 15 of 18) 29953 ENST00000549922.1 60685 TRHDE MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 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GSE96141 NA NA chr12 73850250 73850539 290 * Intron (ENST00000663261.1/100507377, intron 9 of 11) 105369840 ENST00000551387.1 89561 LINC02445 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr12 77114942 77115229 288 * Distal Intergenic 105369853 ENST00000667988.1 -13949 LOC105369853 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr12 77691540 77691910 371 * Intron (ENST00000550042.2/89795, intron 2 of 8) 89795 ENST00000397909.7 -138984 NAV3 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005524,GO:0005640,GO:0007026,GO:0007399,GO:0008017,GO:0016887,GO:0022008,GO:0030336,GO:0031116,GO:0032703,GO:1990752 NA chr12 77693561 77693976 416 * Intron (ENST00000550042.2/89795, intron 2 of 8) 89795 ENST00000397909.7 -136918 NAV3 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005524,GO:0005640,GO:0007026,GO:0007399,GO:0008017,GO:0016887,GO:0022008,GO:0030336,GO:0031116,GO:0032703,GO:1990752 NA chr12 77872410 77872743 334 * Intron (ENST00000550042.2/89795, intron 2 of 8) 89795 ENST00000536525.6 41121 NAV3 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 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86735917 86736216 300 * Intron (ENST00000548651.6/25834, intron 1 of 7) 25834 ENST00000548651.6 102599 MGAT4C MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0000139,GO:0006487,GO:0008375,GO:0008454,GO:0016021,GO:0018215,GO:0046872 hsa00510,hsa00513,hsa01100 chr12 87609960 87610299 340 * Distal Intergenic 400058 ENST00000599191.1 173157 MKRN9P MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr12 87963375 87963824 450 * Distal Intergenic 160419 ENST00000551163.2 64139 C12orf50 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0000346,GO:0003729,GO:0005515,GO:0016973 NA chr12 91050918 91051341 424 * 3 UTR 11081 ENST00000266719.4 6683 KERA MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0003674,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005796,GO:0007601,GO:0018146,GO:0031012,GO:0042340,GO:0043202,GO:0050896,GO:0061303 NA chr12 99368883 99369253 371 * Intron (ENST00000547776.6/56899, intron 12 of 25) 56899 ENST00000550157.1 17044 ANKS1B MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0014069,GO:0015030,GO:0043197,GO:0043231,GO:0046875,GO:0046875,GO:0048013,GO:1900383 NA chr13 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Intergenic 2098 ENST00000471867.3 -14479 ESD MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005515,GO:0005788,GO:0005829,GO:0008150,GO:0016788,GO:0018738,GO:0031410,GO:0042802,GO:0046294,GO:0047374,GO:0052689,GO:0070062,GO:1901687 hsa01100,hsa01200 chr13 47172949 47173773 825 * Distal Intergenic 3356 ENST00000543956.5 -275873 HTR2A MCF-7 h3k9me2 GSE96141 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(ENST00000436732.5/57628, intron 1 of 4) 57628 ENST00000492708.1 -36134 DPP10 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005886,GO:0006508,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008236,GO:0008239,GO:0008239,GO:0015459,GO:0016020,GO:0044325,GO:0072659,GO:1901379,GO:1901379,GO:1903078 NA chr2 115435676 115436145 470 * Intron (ENST00000436732.5/57628, intron 4 of 4) 57628 ENST00000488208.1 -4727 DPP10 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005886,GO:0006508,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008236,GO:0008239,GO:0008239,GO:0015459,GO:0016020,GO:0044325,GO:0072659,GO:1901379,GO:1901379,GO:1903078 NA chr2 115552949 115553527 579 * Intron (ENST00000410059.6/57628, intron 5 of 25) 57628 ENST00000488208.1 112077 DPP10 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005886,GO:0006508,GO:0008076,GO:0008076,GO:0008236,GO:0008239,GO:0008239,GO:0015459,GO:0016020,GO:0044325,GO:0072659,GO:1901379,GO:1901379,GO:1903078 NA chr2 115570193 115570485 293 * Intron (ENST00000410059.6/57628, intron 5 of 25) 57628 ENST00000488208.1 129321 DPP10 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 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363 * Intron (ENST00000262593.10/55816, intron 1 of 7) 55816 ENST00000395939.5 15857 DOK5 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005829,GO:0007169,GO:0007411,GO:0043410,GO:0051386 NA chr20 54492231 54492653 423 * Intron (ENST00000262593.10/55816, intron 1 of 7) 55816 ENST00000395939.5 16513 DOK5 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005829,GO:0007169,GO:0007411,GO:0043410,GO:0051386 NA chr20 54501687 54502693 1007 * Intron (ENST00000262593.10/55816, intron 1 of 7) 55816 ENST00000395939.5 25969 DOK5 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005829,GO:0007169,GO:0007411,GO:0043410,GO:0051386 NA chr20 54503287 54503771 485 * Intron (ENST00000262593.10/55816, intron 1 of 7) 55816 ENST00000395939.5 27569 DOK5 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005829,GO:0007169,GO:0007411,GO:0043410,GO:0051386 NA chr20 54508001 54508412 412 * Intron (ENST00000262593.10/55816, intron 1 of 7) 55816 ENST00000395939.5 32283 DOK5 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0005829,GO:0007169,GO:0007411,GO:0043410,GO:0051386 NA chr20 54519406 54519942 537 * Intron 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(1-2kb) 105372685 ENST00000671579.1 -1324 LOC105372685 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr20 7537526 7537904 379 * Distal Intergenic 102465865 ENST00000621515.1 165918 102465865 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr20 9650809 9651201 393 * Intron (ENST00000353224.10/57144, intron 2 of 9) 105372523 ENST00000657954.1 87868 105372523 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr21 10511648 10512055 408 * Intron (ENST00000496773.1/85319, intron 13 of 14) 7179 ENST00000622113.4 -9498 TPTE MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0004725,GO:0005634,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006470,GO:0007165,GO:0008138,GO:0008285,GO:0014065,GO:0016021,GO:0016311,GO:0016314,GO:0035335,GO:0042995,GO:0046856,GO:0048870,GO:0051896 NA chr21 28445068 28445415 348 * Intron (ENST00000659279.1/29104, intron 3 of 3) 29104 ENST00000654020.1 40313 29104 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr21 30771764 30772104 341 * Distal Intergenic 337977 ENST00000335093.5 -16336 KRTAP21-1 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0001942,GO:0005829,GO:0005882,GO:0031424 NA chr21 37932299 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Intergenic 1008 ENST00000503958.1 210648 CDH10 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 GO:0000902,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005912,GO:0007043,GO:0007156,GO:0007275,GO:0016339,GO:0016342,GO:0034332,GO:0034332,GO:0045296,GO:0098609,GO:0098742,GO:0098978,GO:0098982,GO:0099059,GO:0099060 NA chr5 25477851 25478355 505 * Distal Intergenic 105374693 ENST00000641091.1 180117 LINC02211 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 25588672 25588953 282 * Distal Intergenic 105374693 ENST00000641091.1 290938 LINC02211 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 25789188 25789555 368 * Distal Intergenic 105374693 ENST00000641091.1 491454 LINC02211 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 25976987 25977350 364 * Intron (ENST00000658114.1/ENST00000658114.1, intron 1 of 1) 105374693 ENST00000641091.1 679253 LINC02211 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 26136330 26136597 268 * Distal Intergenic 1007 ENST00000505020.1 754236 CDH9 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 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Intergenic 643401 ENST00000671061.1 298356 PURPL MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 27992312 27992519 208 * Distal Intergenic 105374698 ENST00000512849.1 295146 LINC02103 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 28035538 28035987 450 * Distal Intergenic 105374698 ENST00000512849.1 251678 LINC02103 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 28649012 28649480 469 * Intron (ENST00000658670.1/ENST00000658670.1, intron 2 of 2) 105374701 ENST00000666077.1 -90477 LOC105374701 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 3084951 3085410 460 * Distal Intergenic 102467074 ENST00000505396.2 -92425 LINC01377 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 NA NA chr5 42085135 42085366 232 * Distal Intergenic 26272 ENST00000505566.1 145837 FBXO4 MCF-7 H3K9ME2 GSE96141 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6) 106144608 ENST00000643616.1 61171 LINC00976 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 131793024 131793337 314 * Distal Intergenic 23167 ENST00000254624.10 -110756 EFR3A MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0046854,GO:0072659,GO:0072659 NA chr8 132362191 132362576 386 * Intron (ENST00000388996.10/3786, intron 1 of 14) 3786 ENST00000638588.1 -40646 KCNQ3 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005249,GO:0005249,GO:0005251,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005516,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007268,GO:0008076,GO:0008076,GO:0009986,GO:0016021,GO:0033268,GO:0034765,GO:0043194,GO:0043194,GO:0045202,GO:0060081,GO:0071805,GO:0071805 hsa04725 chr8 135382458 135382888 431 * Distal Intergenic 101927872 ENST00000518674.1 74064 LOC101927872 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 135748942 135749246 305 * Distal Intergenic 10656 ENST00000522578.1 101207 KHDRBS3 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 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Intron (ENST00000361421.2/9760, intron 1 of 8) 100505501 ENST00000523683.1 -50613 100505501 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 59822241 59822584 344 * Distal Intergenic 105375860 ENST00000521456.2 -217467 105375860 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 59841686 59842026 341 * Distal Intergenic 105375861 ENST00000665094.1 -204729 105375861 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 63725790 63726085 296 * Intron (ENST00000657758.1/ENST00000657758.1, intron 2 of 3) 286184 ENST00000653366.1 -43343 LINC01289 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 63939431 63939733 303 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 286184 ENST00000519550.1 170001 LINC01289 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 65907475 65907776 302 * Distal Intergenic 5150 ENST00000519626.1 -65153 PDE7A MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0004114,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0005829,GO:0006198,GO:0007165,GO:0007186,GO:0019933,GO:0046872 hsa00230,hsa01100,hsa05032 chr8 75992232 75992637 406 * Distal Intergenic 102724858 ENST00000668249.1 315678 LOC102724858 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 76416312 76416675 364 * Intron (ENST00000518732.1/101926978, intron 1 of 5) 101926978 ENST00000518732.1 9658 LINC01111 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 76638800 76639230 431 * Intron (ENST00000522961.1/107986952, intron 1 of 2) 100192378 ENST00000521894.1 -23479 ZFHX4-AS1 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 77344766 77345161 396 * Distal Intergenic 105375909 ENST00000518706.6 -53911 LOC105375909 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 77447520 77447830 311 * Promoter (2-3kb) 102724874 ENST00000524014.1 -2867 LOC102724874 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 77584993 77585228 236 * Distal Intergenic 102724874 ENST00000524014.1 134296 LOC102724874 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 78260381 78260790 410 * Distal Intergenic 105375911 ENST00000653339.1 247638 LOC105375911 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 78991804 78992100 297 * Distal Intergenic 112935892 ENST00000565297.2 156497 LINC02605 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 81084860 81085133 274 * Intron (ENST00000220597.4/55824, intron 1 of 8) 55824 ENST00000519326.1 -14684 PAG1 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0002250,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007165,GO:0016021,GO:0035556,GO:0035556,GO:0035591,GO:0042169,GO:0042169,GO:0045121,GO:0045121,GO:0050852,GO:0050863,GO:0050868 NA chr8 82424532 82424885 354 * Intron (ENST00000663058.1/105375931, intron 3 of 7) 105375931 ENST00000658531.1 -10526 LOC105375931 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 82470491 82470779 289 * Intron (ENST00000663058.1/105375931, intron 4 of 7) 105375931 ENST00000658531.1 35080 LOC105375931 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 84779208 84779607 400 * Intron (ENST00000522455.5/138046, intron 4 of 9) 138046 ENST00000521376.1 73272 RALYL MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0003723,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0042802 NA chr8 86737722 86738023 302 * Intron (ENST00000519041.1/107986895, intron 1 of 2) 54714 ENST00000519777.1 5586 CNGB3 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 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112268015 ENST00000520306.1 173046 LOC112268015 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr8 91110834 91111103 270 * Intron (ENST00000520099.5/100130742, intron 1 of 10) 100130742 ENST00000522144.1 8113 LRRC69 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0007165 NA chr8 91634602 91634989 388 * Intron (ENST00000521199.1/ENST00000521199.1, intron 2 of 3) 115111 ENST00000517930.1 277354 SLC26A7 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0001696,GO:0005254,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006821,GO:0008271,GO:0008272,GO:0015106,GO:0015106,GO:0015108,GO:0015116,GO:0015116,GO:0015301,GO:0015701,GO:0016323,GO:0016323,GO:0019531,GO:0019531,GO:0019532,GO:0055038,GO:1902358,GO:1902476 hsa04971 chr8 91828292 91828684 393 * Intron (ENST00000521199.1/ENST00000521199.1, intron 1 of 3) 862 ENST00000521078.1 142476 RUNX1T1 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0003677,GO:0003714,GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006351,GO:0016363,GO:0045599,GO:0045892,GO:0045892,GO:0046872 hsa05200,hsa05202,hsa05221 chr8 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102292083 102292645 563 * Distal Intergenic 414319 ENST00000374801.3 -226991 LINC00587 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr9 102623144 102623591 448 * Intron (ENST00000374801.3/414319, intron 3 of 4) 414319 ENST00000374801.3 103508 LINC00587 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr9 102716786 102717153 368 * Distal Intergenic 414319 ENST00000374801.3 197150 LINC00587 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 NA NA chr9 103010123 103010555 433 * Promoter (1-2kb) 1539 ENST00000590560.1 -1504 CYLC2 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005200,GO:0005634,GO:0007010,GO:0007275,GO:0007283,GO:0030154,GO:0033150 NA chr9 103028523 103028915 393 * Distal Intergenic 1539 ENST00000590560.1 16464 CYLC2 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005200,GO:0005634,GO:0007010,GO:0007275,GO:0007283,GO:0030154,GO:0033150 NA chr9 103061243 103061781 539 * Distal Intergenic 1539 ENST00000590560.1 49184 CYLC2 MCF-7 h3k9me2 GSE96141 GO:0005200,GO:0005634,GO:0007010,GO:0007275,GO:0007283,GO:0030154,GO:0033150 NA chr9 103134591 103135021 431 * Distal Intergenic 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