seqnames start end width strand annotation geneId transcriptId distanceToTSS Symbol Type HM data_source_link GO KEGG reference chr1 2324612 2325876 1265 * Intron (ENST00000378531.8/79906, intron 12 of 13) 6497 ENST00000507179.1 20966 SKI MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000122,GO:0000122,GO:0000122,GO:0000978,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001843,GO:0002089,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005667,GO:0005737,GO:0005813,GO:0006351,GO:0007179,GO:0008270,GO:0008285,GO:0009948,GO:0010626,GO:0014902,GO:0016604,GO:0016605,GO:0017053,GO:0019901,GO:0019904,GO:0021772,GO:0022011,GO:0030177,GO:0030326,GO:0030509,GO:0030512,GO:0030512,GO:0030512,GO:0030512,GO:0030514,GO:0030514,GO:0030514,GO:0031064,GO:0031625,GO:0032926,GO:0032991,GO:0035019,GO:0042802,GO:0043010,GO:0043388,GO:0043585,GO:0045668,GO:0045944,GO:0046332,GO:0046332,GO:0046811,GO:0048147,GO:0048593,GO:0048741,GO:0048870,GO:0060021,GO:0060041,GO:0060325,GO:0060349,GO:0060395,GO:0070491 NA NA 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Intron (ENST00000660938.1/728621, intron 16 of 16) 10465 ENST00000677900.1 -8185 PPIH MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000398,GO:0000398,GO:0000413,GO:0000413,GO:0003755,GO:0003755,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005681,GO:0005737,GO:0005737,GO:0006457,GO:0016018,GO:0016018,GO:0016607,GO:0043021,GO:0043231,GO:0045070,GO:0046540,GO:0065003,GO:0071001 hsa03040 NA chr1 46902199 46903321 1123 * Promoter (1-2kb) 163720 ENST00000505841.5 -1762 CYP4Z2P MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005506,GO:0016021,GO:0016705,GO:0020037 NA NA chr1 50034662 50035746 1085 * Intron (ENST00000651693.1/1996, intron 1 of 6) 1996 ENST00000651693.1 10633 ELAVL4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003730,GO:0005737,GO:0006396,GO:0006397,GO:0008143,GO:0008380,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030426,GO:0035925,GO:0043204,GO:0070935,GO:0097158,GO:1905870,GO:1990904 NA NA chr1 50297491 50298599 1109 * Intron (ENST00000641749.1/105378711, intron 1 of 11) 105378712 ENST00000641951.1 -17316 LINC02808 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr1 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-12815 GJD4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005243,GO:0005922,GO:0007267,GO:0016021,GO:0055085 NA NA chr10 37093554 37095032 1479 * Distal Intergenic 91074 ENST00000361713.2 -30566 ANKRD30A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 43719181 43720309 1129 * Distal Intergenic 102724264 ENST00000423349.5 58317 102724264 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 43725393 43726330 938 * Distal Intergenic 102724264 ENST00000423349.5 52296 102724264 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 43729408 43730373 612 * Distal Intergenic 102724264 ENST00000423349.5 48253 102724264 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 43788891 43790584 1694 * Promoter (<=1kb) 10151 ENST00000401429.1 0 10151 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 43832835 43834558 1724 * Intron (ENST00000659335.1/105378275, intron 2 of 4) 100506835 ENST00000666387.1 -10631 100506835 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 43994098 43995587 1490 * Distal Intergenic 283033 ENST00000664261.1 51005 283033 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 44110948 44112050 1103 * Distal Intergenic 283033 ENST00000664261.1 167855 283033 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 44127778 44129199 1422 * Distal Intergenic 100130539 ENST00000623589.1 -163370 100130539 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 44215824 44216740 917 * Distal Intergenic 100130539 ENST00000623589.1 -75829 100130539 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 44267084 44268353 1238 * Distal Intergenic 100130539 ENST00000623589.1 -24216 100130539 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 44303364 44304821 1147 * Intron (ENST00000658643.1/6387, intron 1 of 2) 6387 ENST00000658643.1 5399 6387 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 44488521 44489527 1007 * Distal Intergenic 6387 ENST00000496375.1 -102028 6387 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 45415990 45417152 1163 * Intron (ENST00000542434.5/240, intron 4 of 12) 240 ENST00000483623.2 -6932 ALOX5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001525,GO:0005096,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005829,GO:0005925,GO:0007165,GO:0030154,GO:0051056,GO:0090630,GO:0098978,GO:0098978,GO:0099175,GO:0099175 NA NA chr10 48746876 48748092 1217 * Intron (ENST00000325239.12/57705, intron 12 of 61) 57705 ENST00000374161.7 -54646 WDFY4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005769,GO:0005783,GO:0006914,GO:0019882,GO:0036037,GO:0098586 NA NA chr10 49226246 49227090 845 * Distal Intergenic 170371 ENST00000470884.1 -37661 TMEM273 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr10 57489521 57490560 1040 * Distal Intergenic 100500834 ENST00000583084.1 -184962 MIR3924 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 57550461 57551607 1147 * Distal Intergenic 100500834 ENST00000583084.1 -245902 MIR3924 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 59177111 59178126 1016 * Promoter (<=1kb) 84457 ENST00000373878.3 0 PHYHIPL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737 NA NA chr10 59450543 59451744 1202 * Distal Intergenic 220965 ENST00000512919.5 -87362 FAM13C MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA chr10 59472881 59474058 1178 * Distal Intergenic 105378318 ENST00000647375.1 -104409 LOC105378318 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 61253340 61255702 766 * Distal Intergenic 219623 ENST00000507507.1 158798 TMEM26 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr10 62557984 62559084 1101 * Intron (ENST00000647733.1/22891, intron 4 of 7) 22891 ENST00000421210.1 182440 ZNF365 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000723,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005813,GO:0010569,GO:0010977,GO:0021687,GO:0034451,GO:0043231,GO:0046872,GO:0048714,GO:0060997,GO:0110026,GO:0140059 NA NA chr10 62950441 62951947 1507 * Distal Intergenic 107984012 ENST00000690352.1 -30534 LOC107984012 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 63815858 63816997 1140 * Intron (ENST00000444770.1/ENST00000444770.1, intron 2 of 2) 101929846 ENST00000654322.1 185186 LOC101929846 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 67559329 67560353 1025 * Intron (ENST00000683963.1/29119, intron 3 of 16) 29119 ENST00000682166.1 105217 CTNNA3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005912,GO:0005912,GO:0005916,GO:0005916,GO:0007015,GO:0008013,GO:0008013,GO:0016477,GO:0030027,GO:0045296,GO:0051015,GO:0051015,GO:0086073,GO:0086091,GO:0090136,GO:0098609,GO:0098609,GO:0098911 hsa04390,hsa04520,hsa04670,hsa05100,hsa05200,hsa05213,hsa05226,hsa05412 NA chr10 71488343 71489861 1519 * Intron (ENST00000224721.12/64072, intron 3 of 69) 64072 ENST00000646131.1 -21259 CDH23 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005515,GO:0006816,GO:0007156,GO:0007601,GO:0007605,GO:0007626,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016339,GO:0016342,GO:0032420,GO:0045296,GO:0045494,GO:0050896,GO:0050953,GO:0050957,GO:0051480,GO:0060122,GO:0098742 NA NA chr10 72919919 72921611 1146 * Intron (ENST00000622652.1/170392, intron 6 of 7) 170392 ENST00000334011.10 26180 OIT3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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129451658 869 * Distal Intergenic 4255 ENST00000306010.8 -15532 MGMT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003677,GO:0003908,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006266,GO:0006281,GO:0006306,GO:0006307,GO:0008168,GO:0009008,GO:0016020,GO:0043066,GO:0046872,GO:2000781 NA NA chr10 130240558 130241704 1147 * Intron (ENST00000648275.1/107984002, intron 1 of 1) 107984002 ENST00000648275.1 27031 107984002 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 130403513 130404957 1132 * Intron (ENST00000648275.1/107984002, intron 1 of 1) 107984002 ENST00000648275.1 189986 107984002 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 130415665 130417433 1444 * Intron (ENST00000648275.1/107984002, intron 1 of 1) 107984002 ENST00000648275.1 202138 107984002 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 130574335 130576636 2200 * Distal Intergenic 107984002 ENST00000648275.1 360808 107984002 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr10 130712341 130713756 1325 * Distal Intergenic 100422867 ENST00000578683.1 248912 MIR378C MCF10A 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ENST00000396275.2 3847 MRGPRX3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0005515,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021 NA NA chr11 19412722 19415738 3017 * Intron (ENST00000360655.8/89797, intron 1 of 37) 89797 ENST00000360655.8 61998 NAV2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0007399,GO:0022008,GO:0032508,GO:0043138 NA NA chr11 20174268 20175706 1439 * Distal Intergenic 120237 ENST00000524983.3 -13793 DBX1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000981,GO:0003677,GO:0005634,GO:0006357,GO:0021515,GO:0021521 NA NA chr11 20538356 20540765 1749 * Distal Intergenic 9152 ENST00000298923.11 -58829 SLC6A5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001504,GO:0005768,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007268,GO:0015375,GO:0015375,GO:0016021,GO:0031045,GO:0035725,GO:0046872,GO:0060012,GO:0060012,GO:0098690,GO:0099056,GO:1903804,GO:1903804 hsa04721 NA chr11 22197529 22198857 1329 * Intron (ENST00000648804.1/203859, intron 5 of 23) 203859 ENST00000683834.1 4281 ANO5 MCF10A 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693195 ENST00000385139.1 -165895 MIR610 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 30666569 30667763 1189 * Distal Intergenic 744 ENST00000528686.2 -79697 MPPED2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0008081,GO:0016208,GO:0019002,GO:0030145 NA NA chr11 30723583 30725504 1922 * Distal Intergenic 101928338 ENST00000663545.1 -48409 LOC101928338 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 31123116 31124061 759 * Intron (ENST00000684477.1/341019, intron 11 of 38) 341019 ENST00000437348.5 3604 DCDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005737,GO:0005874,GO:0007049,GO:0008017,GO:0030246,GO:0030496,GO:0035556,GO:0051301,GO:0072686,GO:0090543,GO:1902412 NA NA chr11 31899280 31900533 1254 * Intron (ENST00000530348.5/5954, intron 1 of 3) 103157000 ENST00000630360.1 72933 PAUPAR MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 32125665 32126877 1213 * Intron (ENST00000419556.2/ENST00000419556.2, intron 2 of 2) 107984322 ENST00000525133.2 -5780 LOC107984322 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 32362952 32364485 1271 * Distal Intergenic 7490 ENST00000650986.1 27596 7490 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 33679227 33680454 1228 * Intron (ENST00000534431.1/105376617, intron 1 of 3) 105376617 ENST00000534431.1 16247 LOC105376617 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 42703726 42704604 737 * Distal Intergenic 100507205 ENST00000662615.1 -450005 LINC02740 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 43614126 43616522 1826 * Intron (ENST00000526615.6/51144, intron 3 of 4) 51144 ENST00000529261.5 -27744 HSD17B12 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001968,GO:0004303,GO:0005515,GO:0005518,GO:0005789,GO:0006633,GO:0006703,GO:0008201,GO:0009923,GO:0010811,GO:0016021,GO:0030198,GO:0031012,GO:0035338,GO:0050062,GO:0102339,GO:0102340,GO:0102341,GO:0102342 hsa00062,hsa00140,hsa01040,hsa01100,hsa01212 NA chr11 44021023 44024151 1797 * Distal Intergenic 390110 ENST00000378832.1 -23830 ACCSL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003824,GO:0009058,GO:0030170 NA NA chr11 44409704 44411321 1618 * Distal Intergenic 60529 ENST00000652299.1 -99565 ALX4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001501,GO:0001942,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0006357,GO:0007517,GO:0009791,GO:0009952,GO:0035115,GO:0035116,GO:0042733,GO:0042981,GO:0045944,GO:0048565,GO:0048704,GO:0060021,GO:0071837,GO:1990837 NA NA chr11 45126541 45127668 1128 * Intron (ENST00000530656.5/56981, intron 1 of 6) 56981 ENST00000534751.3 -18971 PRDM11 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005829,GO:0008168,GO:0010468,GO:0030308,GO:0032259,GO:0043408,GO:0045892,GO:0045893,GO:0051726,GO:2000271 NA NA chr11 45420276 45421412 1137 * Intron (ENST00000528445.1/ENST00000528445.1, intron 2 of 2) 399886 ENST00000664257.1 35129 LINC02687 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr11 49297061 49298415 1355 * Distal Intergenic 2346 ENST00000529648.1 -88423 FOLH1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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60747224 60748414 1191 * Distal Intergenic 219995 ENST00000405633.4 -8453 MS4A15 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr11 62307056 62308131 1076 * Distal Intergenic 404552 ENST00000358585.3 -7981 SCGB1D4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005615 NA NA chr11 63332185 63333282 951 * Distal Intergenic 114571 ENST00000279178.4 -36503 SLC22A9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0009914,GO:0015301,GO:0015347,GO:0015636,GO:0015711,GO:0015912,GO:0015913,GO:0016021,GO:0016323,GO:0043252,GO:0098656 NA NA chr11 64504145 64505472 1248 * Exon (ENST00000444862.2/ENST00000444862.2, exon 3 of 3) 55867 ENST00000377585.7 -50218 SLC22A11 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005452,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008514,GO:0009897,GO:0015347,GO:0015698,GO:0015711,GO:0015711,GO:0016324,GO:0046415,GO:0055085,GO:0070062 NA NA chr11 64587599 64589930 1776 * Promoter (1-2kb) 116085 ENST00000377567.6 -711 SLC22A12 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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(ENST00000413963.2/ENST00000413963.2, exon 1 of 1) 9965 ENST00000294312.4 -33248 FGF19 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000165,GO:0001934,GO:0001934,GO:0005104,GO:0005104,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005737,GO:0007399,GO:0008083,GO:0008284,GO:0008284,GO:0008543,GO:0008543,GO:0008543,GO:0008543,GO:0009887,GO:0010628,GO:0010629,GO:0030154,GO:0030334,GO:0046326,GO:0046330,GO:0051897,GO:0070374,GO:0070858 hsa04010,hsa04014,hsa04015,hsa04020,hsa04151,hsa04810,hsa05200,hsa05218,hsa05224,hsa05226 NA chr11 69813503 69814934 1432 * Promoter (2-3kb) 2248 ENST00000646078.1 2616 FGF3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000165,GO:0001934,GO:0005104,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005737,GO:0007165,GO:0007267,GO:0008083,GO:0008284,GO:0008284,GO:0008543,GO:0008543,GO:0008543,GO:0009653,GO:0009887,GO:0010628,GO:0030154,GO:0030334,GO:0051781,GO:0051897,GO:0055026 hsa04010,hsa04014,hsa04015,hsa04020,hsa04151,hsa04810,hsa05200,hsa05218,hsa05224,hsa05226 NA chr11 70041528 70044426 1560 * Intron 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intron 2 of 2) 105370004 ENST00000546414.1 118973 LINC02463 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 115793939 115794961 1023 * Intron (ENST00000549163.1/ENST00000549163.1, intron 2 of 2) 105370004 ENST00000546414.1 91176 LINC02463 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 115806523 115807764 1242 * Distal Intergenic 105370004 ENST00000546414.1 78373 LINC02463 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 116294795 116296103 1309 * Distal Intergenic 23389 ENST00000281928.9 -17102 MED13L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003712,GO:0006357,GO:0016592 hsa04919 NA chr12 117531042 117532894 1853 * Exon (ENST00000425217.5/283455, exon 11 of 20) 283455 ENST00000543793.1 22335 KSR2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004672,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006468,GO:0007165,GO:0007265,GO:0019722,GO:0046872,GO:0106310,GO:0106311,GO:0120162 hsa04014 NA chr12 117557812 117559523 1576 * Promoter (2-3kb) 283455 ENST00000543793.1 -2583 KSR2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Distal Intergenic 121256 ENST00000422113.7 -37819 TMEM132D MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0010923,GO:0016021 NA NA chr12 129944342 129945913 1572 * Distal Intergenic 121256 ENST00000422113.7 -40317 TMEM132D MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0010923,GO:0016021 NA NA chr12 129979426 129980601 1104 * Distal Intergenic 100190940 ENST00000291374.11 61741 LINC02418 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 130274659 130275708 1050 * Distal Intergenic 9271 ENST00000245255.7 -62179 PIWIL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003727,GO:0003729,GO:0004521,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006417,GO:0007275,GO:0007283,GO:0007286,GO:0007286,GO:0010529,GO:0019901,GO:0031047,GO:0033391,GO:0034584,GO:0034587,GO:0035093,GO:0043186,GO:0046872,GO:0051321,GO:0090502,GO:0097433,GO:0140262,GO:1905538 NA NA chr12 130314092 130315205 906 * Distal Intergenic 9271 ENST00000245255.7 -22682 PIWIL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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NA NA chr12 131642719 131644030 1312 * Intron (ENST00000537280.2/105370085, intron 4 of 5) 105370085 ENST00000537280.2 17793 LINC02414 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 131656399 131657678 1280 * Intron (ENST00000537280.2/105370085, intron 1 of 5) 105370085 ENST00000537280.2 4145 LINC02414 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 132238794 132239977 1184 * Intron (ENST00000328957.13/50614, intron 6 of 10) 50614 ENST00000411988.6 17765 GALNT9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0006493,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0030246,GO:0046872 hsa00512,hsa00514,hsa01100 NA chr13 19023115 19024459 1345 * Intron (ENST00000670804.1/348021, intron 4 of 4) 348021 ENST00000659140.1 14475 LINC00442 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 19074299 19075402 1104 * Intron (ENST00000657315.1/107984132, intron 3 of 3) 107984132 ENST00000657315.1 42913 LOC107984132 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 19427533 19428677 1145 * Intron (ENST00000696857.1/93492, intron 17 of 18) 93492 ENST00000462409.5 74557 TPTE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0004725,GO:0005634,GO:0005789,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006470,GO:0006661,GO:0008138,GO:0008285,GO:0014065,GO:0016021,GO:0016311,GO:0016314,GO:0035335,GO:0042995,GO:0046856,GO:0048870,GO:0051896 NA NA chr13 21210992 21214419 3428 * Distal Intergenic 103689843 ENST00000653059.1 -10102 LINC01046 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 26433883 26435168 1286 * Distal Intergenic 1024 ENST00000480323.1 33810 CDK8 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004672,GO:0004693,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006367,GO:0006468,GO:0008353,GO:0016592,GO:0016592,GO:0016592,GO:0032991,GO:0045944,GO:0051726 NA NA chr13 26712386 26713669 1237 * Distal Intergenic 107984597 ENST00000650558.1 -13582 LOC107984597 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 27706068 27707043 964 * Intron (ENST00000636817.1/105370129, intron 2 of 3) 105370128 ENST00000611364.2 -25487 105370128 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 28440973 28442002 1030 * Intron (ENST00000282397.9/2321, intron 3 of 29) 2321 ENST00000615840.4 53077 FLT1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001525,GO:0002244,GO:0002548,GO:0004714,GO:0005021,GO:0005021,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005615,GO:0005768,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005887,GO:0005925,GO:0007169,GO:0007275,GO:0008284,GO:0010863,GO:0014068,GO:0015629,GO:0016477,GO:0016477,GO:0018108,GO:0019838,GO:0030335,GO:0033674,GO:0035924,GO:0036323,GO:0036332,GO:0038084,GO:0043235,GO:0043235,GO:0043406,GO:0043410,GO:0043552,GO:0045766,GO:0045766,GO:0046777,GO:0048010,GO:0048010,GO:0048010,GO:0048514,GO:0048598,GO:1905563,GO:1990384 hsa04010,hsa04014,hsa04015,hsa04020,hsa04066,hsa04151,hsa04510,hsa05202,hsa05323 NA chr13 29014649 29015713 902 * Intron (ENST00000612955.6/23281, intron 2 of 15) 23281 ENST00000255289.5 -56271 MTUS2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005881,GO:0008017,GO:0008017,GO:0042803 NA NA chr13 29164770 29165796 729 * Intron (ENST00000612955.6/23281, intron 5 of 15) 23281 ENST00000255289.5 92786 MTUS2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005881,GO:0008017,GO:0008017,GO:0042803 NA NA chr13 29287088 29289058 1971 * Intron (ENST00000612955.6/23281, intron 6 of 15) 23281 ENST00000380808.6 -139569 MTUS2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005881,GO:0008017,GO:0008017,GO:0042803 NA NA chr13 30945682 30946813 1081 * Intron (ENST00000380473.8/122046, intron 2 of 6) 122046 ENST00000530916.1 -10145 TEX26 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737 NA NA chr13 31592744 31594398 1655 * Distal Intergenic 122042 ENST00000298386.7 -145128 RXFP2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001556,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007189,GO:0007190,GO:0007193,GO:0008285,GO:0008528,GO:0008584,GO:0009755,GO:0016500,GO:0017046,GO:0043066,GO:0043950 hsa04080,hsa04926 NA chr13 34907868 34909582 1715 * Distal Intergenic 26960 ENST00000692464.1 -32688 NBEA MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005802,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0008104,GO:0012505,GO:0016020,GO:0019901 NA NA chr13 35933951 35935472 764 * Intron (ENST00000360631.8/9201, intron 4 of 16) 9201 ENST00000615680.4 -78090 DCLK1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001764,GO:0004672,GO:0005524,GO:0005887,GO:0006468,GO:0007399,GO:0007417,GO:0009615,GO:0014069,GO:0016197,GO:0018105,GO:0021952,GO:0030900,GO:0035556,GO:0048675,GO:0048812,GO:0048813,GO:0106310,GO:0106311,GO:1900181 NA NA chr13 36699949 36701231 1283 * Distal Intergenic 400120 ENST00000315190.4 25929 SERTM1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0016021,GO:0043231,GO:0043231 NA NA chr13 48703991 48705335 1345 * Intron (ENST00000614739.4/57105, intron 4 of 4) 57105 ENST00000682523.1 50062 CYSLTR2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001631,GO:0004974,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006955,GO:0007186,GO:0007218,GO:0008528,GO:0061737 hsa04020,hsa04080 NA chr13 50856771 50859566 2796 * Intron (ENST00000652753.1/107984567, intron 4 of 5) 220107 ENST00000400393.3 -12832 DLEU7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chr13 51983766 51984866 1101 * Intron (ENST00000242839.10/540, intron 1 of 20) 540 ENST00000673844.1 -4775 ATP7B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0005375,GO:0005507,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005739,GO:0005770,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005887,GO:0006825,GO:0006825,GO:0006825,GO:0006878,GO:0006878,GO:0015677,GO:0016020,GO:0016323,GO:0031410,GO:0032588,GO:0034220,GO:0043682,GO:0043682,GO:0043682,GO:0043682,GO:0046688,GO:0048471,GO:0051208,GO:0060003,GO:0098662 hsa01524,hsa04978 NA chr13 52717947 52720643 2697 * Intron (ENST00000448904.6/11061, intron 4 of 6) 11061 ENST00000431550.1 18709 CNMD MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001501,GO:0001886,GO:0001937,GO:0005576,GO:0006029,GO:0012505,GO:0016021,GO:0016525,GO:0016525,GO:0030948,GO:0051216 NA NA chr13 52939926 52941023 1098 * Distal Intergenic 10562 ENST00000219022.3 -87790 OLFM4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003824,GO:0005198,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005654,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007155,GO:0010939,GO:0030141,GO:0032991,GO:0035580,GO:0042581,GO:0042582,GO:0042981,GO:0043312,GO:0045171,GO:0045296,GO:0048471,GO:0050764,GO:0070062,GO:1900026,GO:1904724,GO:2000389 NA NA chr13 52944456 52946244 1789 * Distal Intergenic 10562 ENST00000219022.3 -82569 OLFM4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003824,GO:0005198,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005654,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007155,GO:0010939,GO:0030141,GO:0032991,GO:0035580,GO:0042581,GO:0042582,GO:0042981,GO:0043312,GO:0045171,GO:0045296,GO:0048471,GO:0050764,GO:0070062,GO:1900026,GO:1904724,GO:2000389 NA NA chr13 53144663 53145805 1143 * Intron (ENST00000660057.1/102723875, intron 3 of 5) 102723875 ENST00000417989.1 6003 LINC01065 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 53158554 53159559 919 * Distal Intergenic 102723875 ENST00000660057.1 -6640 LINC01065 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 53279202 53280950 1463 * Intron (ENST00000657016.1/ENST00000657016.1, intron 1 of 3) 102723875 ENST00000660057.1 -127288 LINC01065 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 55386816 55388093 1101 * Distal Intergenic 100846996 ENST00000583098.1 212362 MIR5007 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 56225741 56226917 1177 * Distal Intergenic 122183 ENST00000377931.1 -914001 PRR20A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 57815085 57816174 1090 * Distal Intergenic 27253 ENST00000615375.1 180072 PCDH17 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005515,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0030534,GO:0050805,GO:0098978,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099056,GO:0099560,GO:1904071,GO:2000807 NA NA chr13 57880599 57881638 1040 * Distal Intergenic 27253 ENST00000615375.1 245586 PCDH17 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Distal Intergenic 101926897 ENST00000615202.1 -6853 LINC02338 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58160801 58162118 1318 * Distal Intergenic 101926897 ENST00000615202.1 -3709 LINC02338 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58208299 58209747 1193 * Exon (ENST00000615202.1/101926897, exon 3 of 3) 106144531 ENST00000454780.2 23370 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58214498 58215982 1485 * Exon (ENST00000454780.2/106144531, exon 6 of 7) 106144531 ENST00000454780.2 17135 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58239758 58241083 1070 * Distal Intergenic 106144531 ENST00000454780.2 -6641 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58306777 58307891 1115 * Distal Intergenic 106144531 ENST00000454780.2 -73660 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58308316 58309430 1115 * Distal Intergenic 106144531 ENST00000454780.2 -75199 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58392289 58394123 1835 * Distal Intergenic 106144531 ENST00000454780.2 -159172 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58600636 58602988 1066 * Distal Intergenic 106144531 ENST00000454780.2 -367519 LINC00374 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58801065 58802347 1283 * Distal Intergenic 105370224 ENST00000666115.1 428289 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58824748 58826173 1426 * Distal Intergenic 105370224 ENST00000666115.1 404463 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58873304 58874697 1314 * Distal Intergenic 105370224 ENST00000666115.1 355939 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58919054 58920220 1167 * Distal Intergenic 105370224 ENST00000666115.1 310416 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 58942539 58944087 1247 * Distal Intergenic 105370224 ENST00000666115.1 286549 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 59176290 59177375 1086 * Intron (ENST00000666115.1/105370224, intron 1 of 4) 105370224 ENST00000666115.1 53261 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 59436083 59437342 1260 * Distal Intergenic 105370224 ENST00000666115.1 -205447 LOC105370224 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 60901195 60902139 945 * Intron (ENST00000658247.1/101926930, intron 3 of 4) 103456507 ENST00000669007.1 -14842 LINC01442 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 60915986 60917326 1341 * Promoter (<=1kb) 103456507 ENST00000669007.1 0 LINC01442 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 61012899 61014155 1257 * Intron (ENST00000658247.1/101926930, intron 4 of 4) 103456507 ENST00000414201.3 95857 LINC01442 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 61034732 61037166 2435 * Intron (ENST00000658247.1/101926930, intron 4 of 4) 103456507 ENST00000414201.3 117690 LINC01442 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 61088976 61090661 1686 * Intron (ENST00000658247.1/101926930, intron 4 of 4) 100422973 ENST00000578032.1 109219 MIR3169 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 61256988 61258702 1576 * Distal Intergenic 100422973 ENST00000578032.1 -57108 MIR3169 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 61615386 61616648 1263 * Distal Intergenic 101926951 ENST00000472649.2 -187440 LINC02339 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 61940371 61942717 2347 * Distal Intergenic 100874143 ENST00000432697.2 86831 LINC00358 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 62474151 62475400 1250 * Distal Intergenic 105370232 ENST00000671601.1 99505 LOC105370232 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 62959695 62960855 1161 * Distal Intergenic 100874176 ENST00000438352.2 -162981 LINC00448 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 63333544 63334587 683 * Distal Intergenic 104355293 ENST00000439454.3 -5415 LINC00376 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 63953381 63954940 1115 * Intron (ENST00000650541.1/144766, intron 5 of 6) 102723968 ENST00000606050.1 -109256 LOC102723968 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 70808690 70809931 1242 * Distal Intergenic 100885781 ENST00000655045.1 -205111 LINC00348 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 71026239 71027382 1083 * Intron (ENST00000655045.1/100885781, intron 1 of 4) 100885781 ENST00000671240.1 11138 LINC00348 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr13 72483976 72485093 1118 * Distal Intergenic 440145 ENST00000377818.4 242536 MZT1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005813,GO:0005813,GO:0005819,GO:0005819,GO:0005829,GO:0008274,GO:0008274,GO:0031021,GO:0033566,GO:0051415,GO:0090307 NA NA chr13 77937294 77938598 966 * Intron (ENST00000607862.5/100874222, intron 1 of 2) 1910 ENST00000377211.8 -17526 EDNRB MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intergenic 3981 ENST00000686095.1 107940 LIG4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000012,GO:0000781,GO:0000793,GO:0001701,GO:0002328,GO:0003677,GO:0003677,GO:0003909,GO:0003909,GO:0003910,GO:0003910,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005958,GO:0005958,GO:0005958,GO:0006260,GO:0006266,GO:0006297,GO:0006297,GO:0006302,GO:0006302,GO:0006303,GO:0006303,GO:0006303,GO:0006303,GO:0006303,GO:0006303,GO:0007049,GO:0007417,GO:0008022,GO:0008283,GO:0010165,GO:0010332,GO:0016874,GO:0032807,GO:0032807,GO:0033077,GO:0033151,GO:0033152,GO:0033153,GO:0035019,GO:0036464,GO:0043524,GO:0045190,GO:0046872,GO:0048146,GO:0050769,GO:0051102,GO:0051103,GO:0051103,GO:0051103,GO:0051276,GO:0051301,GO:0051402,GO:0070419,GO:0071285,GO:0071479,GO:0071897,GO:0075713,GO:0097680,GO:2001252 hsa03450 NA chr13 108146926 108148331 1131 * Distal Intergenic 3981 ENST00000686095.1 66855 LIG4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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GO:0000083,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000987,GO:0001228,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0006357,GO:0006366,GO:0006977,GO:0008134,GO:0008544,GO:0019904,GO:0043276,GO:0045944,GO:0045944,GO:0051091,GO:0070317,GO:0070345,GO:0090575,GO:1900087,GO:1900740,GO:2000278 hsa04110,hsa04350 NA chr13 113659900 113662463 1605 * Promoter (1-2kb) 496 ENST00000335288.5 -1702 ATP4B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001671,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005890,GO:0006883,GO:0007155,GO:0008900,GO:0010243,GO:0010248,GO:0030007,GO:0032496,GO:0032781,GO:0034220,GO:0036376,GO:0045851,GO:1990573 hsa00190,hsa01100,hsa04966,hsa04971 NA chr14 19741024 19742331 1140 * Promoter (1-2kb) 441669 ENST00000642117.2 -1240 OR4Q3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911 hsa04740 NA chr14 19912676 19913754 1079 * Distal Intergenic 79317 ENST00000315915.5 -6853 OR4K5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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ENST00000546412.2 -106544 LINC02306 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 27078831 27080162 1332 * Intron (ENST00000656336.1/102725045, intron 2 of 5) 100423019 ENST00000582802.1 170189 MIR4307 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 27513287 27514466 1180 * Intron (ENST00000553392.5/728755, intron 2 of 5) 100505967 ENST00000662039.1 -98111 LINC00645 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 27762742 27763946 1205 * Exon (ENST00000555797.1/728755, exon 2 of 4) 728755 ENST00000555797.1 81340 MIR3171HG MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 27939631 27940901 1271 * Distal Intergenic 728755 ENST00000555797.1 -94345 MIR3171HG MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 29519838 29522395 2558 * Distal Intergenic 5587 ENST00000691338.1 56054 PRKD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005654,GO:0006357,GO:0045893,GO:0046982 NA NA chr14 39838358 39839925 1568 * Intron (ENST00000652126.1/105370462, intron 3 of 7) 112267899 ENST00000557197.1 363423 LOC112267899 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 39841644 39842640 997 * Intron (ENST00000652126.1/105370462, intron 3 of 7) 112267899 ENST00000557197.1 366709 LOC112267899 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 39937140 39938194 1055 * Intron (ENST00000652126.1/105370462, intron 3 of 7) 105370462 ENST00000553464.2 -278333 LOC105370462 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 39960697 39962254 1558 * Intron (ENST00000652126.1/105370462, intron 3 of 7) 105370462 ENST00000553464.2 -254273 LOC105370462 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 40500806 40501961 1156 * Distal Intergenic 105370467 ENST00000651539.1 -128045 LOC105370467 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 40560133 40561585 1453 * Distal Intergenic 105370467 ENST00000651539.1 -68421 LOC105370467 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 40707509 40709169 1198 * Intron (ENST00000651539.1/105370467, intron 3 of 10) 105370467 ENST00000651539.1 77503 LOC105370467 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 41086218 41088022 1805 * Intron (ENST00000651006.1/644919, intron 3 of 3) 644919 ENST00000515218.2 131320 LINC02315 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 41310328 41311567 1240 * Distal Intergenic 105370469 ENST00000557067.1 293289 LRFN5-DT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 44872032 44873157 1126 * Distal Intergenic 122525 ENST00000325192.8 -24118 C14orf28 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 46163777 46164628 774 * Intron (ENST00000666179.1/100506412, intron 2 of 4) 100506412 ENST00000556886.1 99618 LINC00871 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 46364486 46365420 680 * Intron (ENST00000666179.1/100506412, intron 4 of 4) 100506412 ENST00000556071.5 -105939 LINC00871 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 46507797 46508775 979 * Distal Intergenic 100506412 ENST00000659741.1 20019 LINC00871 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 46509396 46510404 1009 * Distal Intergenic 100506412 ENST00000659741.1 21618 LINC00871 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 46533179 46534398 1220 * Distal Intergenic 100506412 ENST00000659741.1 45401 LINC00871 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 46738138 46739288 1151 * Distal Intergenic 140801 ENST00000298283.5 -86357 RPL10L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000027,GO:0003735,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005783,GO:0005829,GO:0005844,GO:0006412,GO:0007283,GO:0016020,GO:0022625,GO:0022625 hsa03010,hsa05171 NA chr14 47173841 47175226 1165 * Intron (ENST00000426342.7/161357, intron 2 of 15) 161357 ENST00000554762.5 -42003 MDGA2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005576,GO:0005886,GO:0021522,GO:0031225 NA NA chr14 47561772 47563266 1455 * Intron (ENST00000399232.8/161357, intron 1 of 16) 161357 ENST00000557238.5 63259 MDGA2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intergenic 55195 ENST00000530417.6 -29815 CCDC198 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA chr14 57953774 57955158 1385 * Intron (ENST00000556568.1/341880, intron 1 of 1) 341880 ENST00000554648.1 26905 SLC35F4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021,GO:0022857,GO:0055085 NA NA chr14 58582329 58583920 1592 * Distal Intergenic 9786 ENST00000556235.1 42462 KIAA0586 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001917,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005814,GO:0007224,GO:0007224,GO:0036064,GO:0036064,GO:0060271,GO:0060271,GO:0070201 NA NA chr14 60423692 60425160 1145 * Intron (ENST00000498565.5/317761, intron 3 of 4) 317761 ENST00000498565.5 29890 C14orf39 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000801,GO:0000801,GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005694,GO:0007129,GO:0007129,GO:0007275,GO:0007283,GO:0007283,GO:0010705,GO:0010705,GO:0048477,GO:0048477,GO:0051090 NA NA chr14 62961159 62962333 1143 * Intron (ENST00000322893.12/27133, intron 6 of 10) 27133 ENST00000420622.6 82853 27133 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA 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78741135 1008 * Intron (ENST00000634499.2/9369, intron 9 of 21) 105370589 ENST00000555680.1 -30194 LOC105370589 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 79307248 79308363 1116 * Intron (ENST00000634499.2/9369, intron 16 of 21) 9369 ENST00000556003.1 -5688 NRXN3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0005887,GO:0007158,GO:0007411,GO:0007612,GO:0030534,GO:0035176,GO:0038023,GO:0046872,GO:0050839,GO:0071625,GO:0097109 hsa04514 NA chr14 79956233 79957332 1100 * Intron (ENST00000554307.1/112267892, intron 2 of 2) 112267892 ENST00000554307.1 16837 LOC112267892 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 81539108 81540280 1173 * Distal Intergenic 6400 ENST00000336735.9 -5255 SEL1L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000836,GO:0000839,GO:0000839,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006641,GO:0007219,GO:0009306,GO:0016021,GO:0016567,GO:0030433,GO:0030433,GO:0030970,GO:0036503,GO:0036503,GO:0036513,GO:0044322,GO:0050821,GO:0055085,GO:1904380 hsa04141 NA chr14 81752694 81753737 1044 * 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92294192 1306 * Distal Intergenic 123041 ENST00000393265.6 -28389 SLC24A4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005262,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006811,GO:0006874,GO:0006874,GO:0007608,GO:0007608,GO:0008273,GO:0008273,GO:0015293,GO:0016020,GO:0035725,GO:0044214,GO:0050896,GO:0070588,GO:0070588,GO:0071805,GO:0097186,GO:0098656 hsa04740 NA chr14 92343012 92345112 2101 * Intron (ENST00000393265.6/123041, intron 2 of 16) 123041 ENST00000531433.5 19819 SLC24A4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005262,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006811,GO:0006874,GO:0006874,GO:0007608,GO:0007608,GO:0008273,GO:0008273,GO:0015293,GO:0016020,GO:0035725,GO:0044214,GO:0050896,GO:0070588,GO:0070588,GO:0071805,GO:0097186,GO:0098656 hsa04740 NA chr14 92864948 92866110 1163 * Distal Intergenic 105370629 ENST00000554653.5 -20242 LINC02833 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 93417305 93418348 1044 * Intron (ENST00000256339.8/57578, intron 1 of 49) 57578 ENST00000555664.5 -11989 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(ENST00000553433.1/ENST00000553433.1, exon 2 of 2) 101929634 ENST00000564585.1 10655 LINC02280 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 104823879 104825540 1662 * Promoter (2-3kb) 196872 ENST00000555578.1 2678 LINC00638 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 104846493 104847402 910 * Distal Intergenic 283638 ENST00000414716.8 -17866 CEP170B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737,GO:0005874 NA NA chr14 105541145 105544819 1386 * Distal Intergenic 80757 ENST00000431372.1 12521 TMEM121 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0008150,GO:0016021 NA NA chr14 105541600 105544955 2001 * Distal Intergenic 80757 ENST00000431372.1 12976 TMEM121 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0008150,GO:0016021 NA NA chr14 105580234 105581715 1125 * Distal Intergenic 102465871 ENST00000616769.1 -39401 MIR8071-1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 105616831 105618244 1414 * Promoter (2-3kb) 102465871 ENST00000616769.1 -2872 MIR8071-1 MCF10A 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Distal Intergenic 105370973 ENST00000555396.1 -24726 LOC105370973 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr15 92466773 92469991 3219 * Promoter (1-2kb) 104613533 ENST00000554440.1 1555 LOC104613533 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr15 94140338 94142729 2392 * Distal Intergenic 101927112 ENST00000558874.1 -32400 LINC01581 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr15 96900091 96901199 1109 * Distal Intergenic 145946 ENST00000560327.1 116604 SPATA8 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA chr15 96939825 96941756 1932 * Distal Intergenic 145946 ENST00000560327.1 156338 SPATA8 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA chr15 97104913 97106476 1089 * Distal Intergenic 107984764 ENST00000559321.2 -109336 LINC02253 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr15 97333649 97334728 1080 * Intron (ENST00000559321.2/107984764, intron 2 of 5) 105371006 ENST00000559394.2 -14328 LOC105371006 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr15 98437205 98438381 734 * Exon (ENST00000558256.5/283777, exon 7 of 7) 105371011 ENST00000686546.1 -16184 LINC02351 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr15 98994580 98995826 1247 * Intron (ENST00000559468.1/105371016, intron 2 of 3) 145814 ENST00000637120.1 9636 PGPEP1L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0006508,GO:0008234 NA NA chr16 2357202 2358497 1040 * Promoter (2-3kb) 650655 ENST00000494925.1 -2647 ABCA17P MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr16 3550385 3552493 2109 * 3 UTR 197358 ENST00000618137.1 4501 NLRC3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007249,GO:0014067,GO:0032088,GO:0032687,GO:0032688,GO:0032715,GO:0032715,GO:0032720,GO:0032720,GO:0034451,GO:0035556,GO:0036312,GO:0042110,GO:0043124,GO:0043124,GO:0043231,GO:0045824,GO:0048147,GO:0048471,GO:0050680,GO:0050728,GO:1900016,GO:1900226,GO:1901223 NA NA chr16 8506084 8507106 1023 * Distal Intergenic 283953 ENST00000562516.1 24907 TMEM114 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0016021,GO:0016324,GO:0016327 NA NA chr16 13265103 13266233 1131 * Intron (ENST00000662907.1/107984137, intron 2 of 2) 729993 ENST00000571619.5 18787 SHISA9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0008328,GO:0014069,GO:0030165,GO:0032281,GO:0032591,GO:0032591,GO:0045202,GO:0045211,GO:0048172,GO:0048172,GO:0098962,GO:0098978,GO:0099061,GO:2000311 NA NA chr16 13574460 13575679 1170 * Distal Intergenic 729993 ENST00000665873.1 225731 SHISA9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0008328,GO:0014069,GO:0030165,GO:0032281,GO:0032591,GO:0032591,GO:0045202,GO:0045211,GO:0048172,GO:0048172,GO:0098962,GO:0098978,GO:0099061,GO:2000311 NA NA chr16 13774457 13775536 1080 * Intron (ENST00000573369.5/ENST00000573369.5, intron 3 of 4) 2072 ENST00000682617.1 -144602 ERCC4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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124359 ENST00000562753.1 10509 CDYL2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003714,GO:0003824,GO:0005515,GO:0005634,GO:0045892 NA NA chr16 80840452 80842688 1904 * Promoter (<=1kb) 100996425 ENST00000651617.1 0 ARLNC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr16 82209669 82210837 1132 * Distal Intergenic 10200 ENST00000258169.9 -39445 MPHOSPH6 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000176,GO:0000176,GO:0000178,GO:0000178,GO:0000460,GO:0000460,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005829,GO:0006364 hsa03018 NA chr16 82243693 82244834 1142 * Distal Intergenic 10200 ENST00000258169.9 -73469 MPHOSPH6 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000176,GO:0000176,GO:0000178,GO:0000178,GO:0000460,GO:0000460,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005829,GO:0006364 hsa03018 NA chr16 85230325 85231587 1101 * Intron (ENST00000637419.1/23199, intron 1 of 2) 107984830 ENST00000653746.1 3122 LOC107984830 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr16 86013345 86014911 1567 * Distal Intergenic 107984811 ENST00000598933.2 -77122 LINC02132 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr16 86024907 86026248 1342 * Distal Intergenic 107984811 ENST00000598933.2 -88684 LINC02132 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr16 87630356 87632568 1927 * Intron (ENST00000537256.5/57338, intron 1 of 5) 57338 ENST00000563609.1 -20994 JPH3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005789,GO:0005886,GO:0007612,GO:0007613,GO:0014701,GO:0016021,GO:0030314,GO:0035640,GO:0040011,GO:0048167,GO:0048168,GO:0050885,GO:0060314,GO:0060402 NA NA chr16 87938154 87940355 2202 * Promoter (1-2kb) 763 ENST00000648177.1 -1574 CA5A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004089,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005759,GO:0006730,GO:0008270,GO:0015701,GO:0016836 hsa00910,hsa01100 NA chr16 88171477 88174477 3001 * Distal Intergenic 101928880 ENST00000665557.1 -12128 LINC02182 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr16 88271396 88272978 1400 * Intron (ENST00000563190.1/ENST00000563190.1, intron 1 of 3) 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NA chr17 58847933 58850251 2318 * Intron (ENST00000308249.4/22843, intron 1 of 6) 22843 ENST00000308249.4 92079 PPM1E MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004722,GO:0004724,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005739,GO:0006469,GO:0006469,GO:0006470,GO:0032991,GO:0035690,GO:0035970,GO:0046872,GO:0051496,GO:0106306,GO:0106307 NA NA chr17 62122368 62123405 1038 * Exon (ENST00000384395.1/ENST00000384395.1, exon 1 of 1) 9969 ENST00000397786.7 -57090 MED13 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003712,GO:0003712,GO:0003713,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006357,GO:0006367,GO:0016020,GO:0016592,GO:0016592,GO:0030374,GO:0042809,GO:0045893,GO:0045944,GO:0046966,GO:0060261 hsa04919 NA chr17 62336154 62337280 1127 * Distal Intergenic 105371936 ENST00000635817.2 -6661 LOC105371936 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr17 70977192 70978587 1106 * Distal Intergenic 101928165 ENST00000665992.1 152737 CASC17 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr17 73618714 73620072 1359 * Intron 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ENST00000597799.1 14097 284361 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50577327 50578509 1183 * Distal Intergenic 94030 ENST00000652263.1 -8892 94030 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50601292 50603521 1271 * Distal Intergenic 84258 ENST00000595117.1 22613 84258 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50653722 50655790 2069 * Promoter (2-3kb) 342918 ENST00000490451.1 -2706 342918 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50832540 50833632 1093 * Promoter (<=1kb) 55554 ENST00000598239.6 0 55554 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50840863 50842152 1290 * Intron (ENST00000598079.1/105372441, intron 2 of 2) 55554 ENST00000326856.8 -3650 55554 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50851811 50852988 1178 * Promoter (1-2kb) 354 ENST00000601503.5 -1927 354 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr19 50959002 50960208 1207 * 3 UTR 25818 ENST00000593428.5 -5909 KLK5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Promoter (<=1kb) 57348 ENST00000462769.1 -156 TTYH1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000278,GO:0005229,GO:0005254,GO:0005381,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006821,GO:0006826,GO:0016021,GO:0030868,GO:0031527,GO:0031589,GO:0032433,GO:0034220,GO:0034707,GO:0034755,GO:0045202,GO:0046847,GO:0072320,GO:0072320,GO:0098609,GO:1902476 NA NA chr19 54490543 54491628 1086 * Distal Intergenic 3904 ENST00000412608.5 -6251 LAIR2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005576,GO:0050776 NA NA chr19 54600744 54601951 1166 * 3 UTR 11024 ENST00000453777.1 7084 LILRA1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002250,GO:0003823,GO:0004888,GO:0005886,GO:0006952,GO:0007166,GO:0016021,GO:0050776 hsa04380,hsa04662 NA chr19 54898308 54900575 1960 * Distal Intergenic 9437 ENST00000291890.9 -5573 NCR1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006968,GO:0007165,GO:0016514,GO:0030101,GO:0042269,GO:0050776 hsa04650 NA chr19 54993443 54994548 1106 * Promoter (<=1kb) 55655 ENST00000542755.1 225 NLRP2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000781,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005737,GO:0005794,GO:0005829,GO:0006915,GO:0006954,GO:0032088,GO:0032090,GO:0032731,GO:0043231,GO:0043280,GO:0045087 NA NA chr2 1220763 1222752 1990 * Intron (ENST00000308624.10/54221, intron 9 of 16) 54221 ENST00000498321.1 11634 SNTG2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003779,GO:0005198,GO:0005515,GO:0005622,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005886,GO:0007417,GO:0016010,GO:0016013,GO:0030165,GO:0042383,GO:0097109 NA NA chr2 2367065 2368077 1013 * Distal Intergenic 23040 ENST00000648688.1 -35401 MYT1L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007399,GO:0008270,GO:0030182,GO:0048663,GO:0048665,GO:0048666 NA NA chr2 2464331 2466476 2146 * Distal Intergenic 23040 ENST00000648688.1 -132667 MYT1L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007399,GO:0008270,GO:0030182,GO:0048663,GO:0048665,GO:0048666 NA NA chr2 2499835 2500953 1119 * Distal Intergenic 107985839 ENST00000414065.1 155677 LOC107985839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2521116 2522594 1220 * Distal Intergenic 107985839 ENST00000414065.1 134036 LOC107985839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2628812 2629875 1064 * Distal Intergenic 107985839 ENST00000414065.1 26755 LOC107985839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2681633 2683303 1619 * Exon (ENST00000687814.2/ENST00000687814.2, exon 1 of 2) 107985839 ENST00000701266.1 13139 LOC107985839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2688577 2689826 1250 * Intron (ENST00000702511.1/ENST00000702511.1, intron 1 of 1) 107985839 ENST00000701266.1 6616 LOC107985839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2715150 2717563 2414 * Exon (ENST00000652954.1/105373390, exon 3 of 4) 107985839 ENST00000701266.1 -18708 LOC107985839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2927788 2929589 1802 * Intron (ENST00000457478.1/101927554, intron 5 of 6) 101927554 ENST00000667683.1 71861 LINC01250 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 2985119 2986663 1032 * Intron (ENST00000457478.1/101927554, intron 3 of 6) 101927554 ENST00000667683.1 14787 LINC01250 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 3013515 3014775 1261 * Intron (ENST00000457478.1/101927554, intron 3 of 6) 101927554 ENST00000667683.1 -12065 LINC01250 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 3023509 3024905 1390 * Intron (ENST00000457478.1/101927554, intron 3 of 6) 101927554 ENST00000667683.1 -22059 LINC01250 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 3684872 3685933 1062 * Intron (ENST00000252505.4/55821, intron 7 of 11) 55821 ENST00000476389.5 -8688 ALLC MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000256,GO:0004037 hsa00230,hsa01100 NA chr2 3819521 3820424 821 * Intron (ENST00000399143.9/728597, intron 10 of 10) 728597 ENST00000451101.1 -23760 DCDC2C MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737,GO:0005815,GO:0005874,GO:0030864,GO:0035556,GO:0036126 NA NA chr2 4199562 4200707 1146 * Distal Intergenic 107985841 ENST00000442831.1 -58831 LOC107985841 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 4451850 4453298 1128 * Distal Intergenic 727982 ENST00000432314.5 190057 LINC01249 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 4843830 4844977 1148 * Distal Intergenic 727982 ENST00000412134.6 -187332 LINC01249 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 6883691 6884928 1238 * Exon (ENST00000489749.1/91543, exon 2 of 2) 91543 ENST00000477834.1 4897 RSAD2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001650,GO:0003824,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005739,GO:0005741,GO:0005743,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005789,GO:0005794,GO:0005811,GO:0009615,GO:0016032,GO:0034157,GO:0034165,GO:0035710,GO:0043367,GO:0043621,GO:0045071,GO:0046872,GO:0050709,GO:0050778,GO:0051539,GO:0051539,GO:0051607,GO:0051607,GO:0060337,GO:2000553 hsa05160,hsa05164 NA chr2 7062462 7065134 2673 * Exon (ENST00000649356.2/101929452, exon 5 of 6) 101929452 ENST00000649356.2 12746 LOC101929452 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 7152113 7153998 1261 * Distal Intergenic 101929452 ENST00000664324.1 -74197 LOC101929452 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 8619501 8621467 1967 * Promoter (1-2kb) 105373411 ENST00000425678.1 1475 LOC105373411 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 8673405 8675033 1607 * Promoter (1-2kb) 100506299 ENST00000656008.1 1592 ID2-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 9651584 9652928 1345 * Intron (ENST00000667551.1/105373418, intron 3 of 3) 105373418 ENST00000663514.1 12791 LOC105373418 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 10233314 10234585 1134 * Distal Intergenic 100422929 ENST00000580325.1 -40643 MIR4261 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 10871844 10873431 1588 * Promoter (2-3kb) 101929733 ENST00000652896.1 2566 LINC01954 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 10949323 10951729 2407 * Distal Intergenic 3754 ENST00000295082.3 37389 KCNF1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005249,GO:0005267,GO:0005515,GO:0005886,GO:0006813,GO:0008076,GO:0016021,GO:0034765,GO:0051260,GO:0071805 NA NA chr2 15787057 15788556 1500 * Distal Intergenic 101926966 ENST00000476839.2 86526 LINC01804 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 15970187 15971634 1448 * Distal Intergenic 4613 ENST00000703162.1 26630 MYCN MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006357,GO:0006357,GO:0010628,GO:0010629,GO:0019900,GO:0045893,GO:0045944,GO:0046983,GO:1903800,GO:1990837 hsa05202 NA chr2 16024458 16026594 1990 * Intron (ENST00000652394.1/104797537, intron 1 of 4) 104797537 ENST00000652731.1 -3979 GACAT3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16039042 16040358 1317 * Intron (ENST00000652394.1/104797537, intron 3 of 4) 104797537 ENST00000652731.1 8469 GACAT3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16040963 16042035 1073 * Intron (ENST00000652394.1/104797537, intron 3 of 4) 104797537 ENST00000426539.1 -8392 GACAT3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16221209 16222492 1083 * Distal Intergenic 107985855 ENST00000425176.5 -131764 LOC107985855 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16236692 16237780 1089 * Intron (ENST00000420404.2/ENST00000420404.2, intron 3 of 3) 107985855 ENST00000425176.5 -116476 LOC107985855 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16254296 16255450 1155 * Intron (ENST00000420404.2/ENST00000420404.2, intron 3 of 3) 107985855 ENST00000425176.5 -98806 LOC107985855 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16302601 16304751 2151 * Intron (ENST00000420404.2/ENST00000420404.2, intron 3 of 3) 107985855 ENST00000425176.5 -49505 LOC107985855 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 16496249 16497508 1172 * Distal Intergenic 105373444 ENST00000689924.1 -17626 LOC105373444 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 17379580 17380627 1004 * Distal Intergenic 729475 ENST00000399080.3 137813 RAD51AP2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000724,GO:0003690,GO:0003697,GO:0005515,GO:0008150,GO:0032991,GO:0036297 NA NA chr2 18034986 18036139 1154 * Intron (ENST00000465292.5/3790, intron 2 of 4) 3790 ENST00000419802.1 155603 3790 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 19633382 19634789 1396 * Distal Intergenic 105373461 ENST00000432822.1 -76926 105373461 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 20926503 20927699 1187 * Distal Intergenic 101928271 ENST00000447260.1 66732 101928271 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 21152288 21153674 1387 * Distal Intergenic 100129278 ENST00000405799.3 28320 TDRD15 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 21400506 21401338 808 * Intron (ENST00000435237.1/105374320, intron 1 of 5) 100507562 ENST00000417609.1 3923 100507562 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 21791297 21792382 1086 * Intron (ENST00000435237.1/105374320, intron 3 of 5) 645949 ENST00000668104.1 -80641 LINC01822 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 21829232 21830873 1120 * Intron (ENST00000435237.1/105374320, intron 4 of 5) 645949 ENST00000668104.1 -118576 LINC01822 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 21898231 21899317 1087 * Intron (ENST00000435237.1/105374320, intron 4 of 5) 645949 ENST00000668104.1 -187575 LINC01822 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 22140114 22141921 1111 * Intron (ENST00000450551.1/105374322, intron 2 of 4) 102723362 ENST00000657386.1 -366208 102723362 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 22213006 22214295 1029 * Intron (ENST00000450551.1/105374322, intron 1 of 4) 102723362 ENST00000657386.1 -293834 102723362 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 22239927 22240848 811 * Intron (ENST00000450551.1/105374322, intron 1 of 4) 102723362 ENST00000657386.1 -267281 102723362 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 22293399 22295155 1426 * Intron (ENST00000450551.1/105374322, intron 1 of 4) 102723362 ENST00000657386.1 -212974 102723362 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 22751457 22752324 835 * Distal Intergenic 102723362 ENST00000655510.1 215045 102723362 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 22982151 22983212 1062 * Distal Intergenic 107985792 ENST00000432612.1 47209 107985792 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 23080335 23081441 1107 * Intron (ENST00000421581.1/107985792, intron 1 of 6) 107985792 ENST00000421581.1 9396 107985792 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 24780383 24781452 961 * Distal Intergenic 391356 ENST00000467797.1 10154 PTRHD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004045,GO:0005515 NA NA chr2 26657600 26661853 3625 * Distal Intergenic 130106 ENST00000288861.5 -16234 CIB4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000287,GO:0005509,GO:0005515 NA NA chr2 29645745 29647205 1427 * Intron (ENST00000389048.8/238, intron 3 of 28) 238 ENST00000618119.4 70495 238 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 29852601 29854214 1372 * Intron (ENST00000389048.8/238, intron 1 of 28) 238 ENST00000389048.8 67372 238 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 30347926 30349139 1214 * Promoter (<=1kb) 285043 ENST00000671597.1 730 285043 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 31580900 31583395 2496 * Promoter (<=1kb) 6716 ENST00000622030.2 0 6716 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 33499494 33500877 1384 * Intron (ENST00000402538.7/25780, intron 2 of 18) 25780 ENST00000407811.5 -12998 RASGRP3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000165,GO:0000165,GO:0005085,GO:0005096,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007264,GO:0007265,GO:0019900,GO:0019992,GO:0031267,GO:0032045,GO:0043547,GO:0048471 hsa04010,hsa04014,hsa04015,hsa04662,hsa05200 NA chr2 34858691 34859832 1142 * Intron (ENST00000453451.5/107985808, intron 2 of 5) 107985808 ENST00000587791.5 -8562 LOC107985808 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 35138399 35140105 1707 * Intron (ENST00000453451.5/107985808, intron 2 of 5) 107985808 ENST00000627058.2 -19042 LOC107985808 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 35697652 35698741 1090 * Distal Intergenic 100616475 ENST00000584780.1 226247 MIR548AD MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 35906585 35907783 1199 * Distal Intergenic 100616475 ENST00000584780.1 435180 MIR548AD MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 36209823 36210864 1042 * Distal Intergenic 51232 ENST00000280527.7 -144914 CRIM1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004867,GO:0005010,GO:0005520,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007399,GO:0010951,GO:0016021,GO:0030165,GO:0030514,GO:0045668,GO:0048009 NA NA chr2 40964886 40966232 1347 * Distal Intergenic 101929700 ENST00000420187.1 218399 LINC01794 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 41216123 41217304 1182 * Distal Intergenic 101929700 ENST00000420187.1 469636 LINC01794 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 41228615 41230656 2042 * Distal Intergenic 101929700 ENST00000420187.1 482128 LINC01794 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 41238557 41239940 1384 * Distal Intergenic 101929700 ENST00000420187.1 492070 LINC01794 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 47589725 47591303 1579 * Intron (ENST00000646415.1/4436, intron 16 of 17) 56660 ENST00000327876.5 -18740 56660 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 48057045 48058358 1314 * Intron (ENST00000651429.1/105374591, intron 3 of 8) 105374593 ENST00000650693.1 53033 LOC105374593 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 49632227 49633256 1030 * Distal Intergenic 107985810 ENST00000635306.1 -180331 LOC107985810 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 49659104 49660484 1381 * Distal Intergenic 107985810 ENST00000635306.1 -207208 LOC107985810 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 49797672 49799062 1207 * Distal Intergenic 9378 ENST00000630656.1 174877 NRXN1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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(ENST00000606978.5/105369168, intron 4 of 9) 105374780 ENST00000453714.7 -67586 LOC105374780 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 66203184 66204363 1120 * Distal Intergenic 105369168 ENST00000668467.1 70649 LINC02934 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 71655506 71656847 1146 * Exon (ENST00000258104.8/8291, exon 42 of 55) 8291 ENST00000468173.1 44727 DYSF MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001778,GO:0002280,GO:0002280,GO:0002281,GO:0002281,GO:0005509,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005543,GO:0005544,GO:0005544,GO:0005768,GO:0005769,GO:0005770,GO:0005886,GO:0006906,GO:0006936,GO:0007009,GO:0016021,GO:0030139,GO:0030315,GO:0030315,GO:0030659,GO:0031410,GO:0033292,GO:0034451,GO:0042383,GO:0050765,GO:0050765,GO:0061025,GO:0070062 NA NA chr2 71721747 71723040 1294 * Distal Intergenic 8291 ENST00000468173.1 110968 DYSF MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intron (ENST00000409884.6/80059, intron 3 of 3) 101927907 ENST00000445178.1 176721 LRRTM4-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 77275753 77276837 1085 * Intron (ENST00000409884.6/80059, intron 3 of 3) 80059 ENST00000409282.1 245373 LRRTM4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005615,GO:0016021,GO:0031012,GO:0045211 NA NA chr2 77476528 77477669 1142 * Intron (ENST00000409884.6/80059, intron 3 of 3) 80059 ENST00000409282.1 44541 LRRTM4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005615,GO:0016021,GO:0031012,GO:0045211 NA NA chr2 78220341 78221394 1054 * Intron (ENST00000667782.1/101927967, intron 1 of 6) 101927967 ENST00000667782.1 69075 LOC101927967 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 78360200 78362326 1888 * Distal Intergenic 101927967 ENST00000667782.1 -69731 LOC101927967 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 78455896 78457158 1263 * Distal Intergenic 101927967 ENST00000667782.1 -165427 LOC101927967 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 78569501 78571034 1534 * Distal Intergenic 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212462835 1272 * Intron (ENST00000342788.9/2066, intron 1 of 27) 2066 ENST00000435846.1 -32317 2066 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 216903316 216905026 1711 * Intron (ENST00000695932.1/105373877, intron 2 of 11) 101928278 ENST00000695939.1 17277 IGFBP-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 216953245 216955251 2007 * Intron (ENST00000695932.1/105373877, intron 2 of 11) 101928278 ENST00000695939.1 67206 IGFBP-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 217546121 217547018 898 * Intron (ENST00000474063.5/729582, intron 1 of 11) 729582 ENST00000474063.5 52914 DIRC3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 218841574 218842974 1401 * Exon (ENST00000456160.1/ENST00000456160.1, exon 1 of 1) 53632 ENST00000529249.5 -9488 PRKAG3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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1121 * Intron (ENST00000358864.2/117532, intron 11 of 19) 117532 ENST00000496948.2 6898 117532 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 2718214 2719263 1050 * Intron (ENST00000609451.6/57593, intron 6 of 16) 57593 ENST00000469215.2 12546 57593 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 4238619 4239536 783 * Intron (ENST00000379453.6/146, intron 1 of 1) 146 ENST00000379453.6 9751 ADRA1D MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001996,GO:0004930,GO:0004937,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007188,GO:0007200,GO:0007204,GO:0007267,GO:0008284,GO:0042802,GO:0043410,GO:0045907,GO:0071880,GO:0150099 hsa04020,hsa04022,hsa04080,hsa04261,hsa04270,hsa04970 NA chr20 5309646 5311833 1739 * Intron (ENST00000678254.1/128674, intron 2 of 2) 128674 ENST00000217270.4 4581 PROKR2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004983,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007218,GO:0007623 NA NA chr20 5365995 5367035 781 * Intron (ENST00000668553.1/ENST00000668553.1, intron 2 of 3) 128674 ENST00000678254.1 -49041 PROKR2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004983,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007218,GO:0007623 NA NA chr20 5403599 5404725 1127 * Intron (ENST00000668553.1/ENST00000668553.1, intron 2 of 3) 100507629 ENST00000669296.1 32520 LINC00658 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 5896228 5897682 1183 * Distal Intergenic 1114 ENST00000378961.9 -13828 CHGB MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005179,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005788,GO:0007165,GO:0030141,GO:0043687,GO:0044267 NA NA chr20 6208974 6210097 1124 * Distal Intergenic 55612 ENST00000699096.1 -85760 FERMT1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 21412194 21413727 1525 * Distal Intergenic 105372558 ENST00000419666.2 13301 LOC105372558 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 21603812 21604847 1036 * Intron (ENST00000687963.1/101929625, intron 1 of 3) 101929625 ENST00000624385.1 -7797 LINC01727 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 21844268 21846136 1415 * Distal Intergenic 5075 ENST00000485038.1 135998 PAX1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001501,GO:0001756,GO:0005634,GO:0006357,GO:0006366,GO:0008283,GO:0043367,GO:0043374,GO:0045944,GO:0048538,GO:0048856,GO:0060017,GO:0060349,GO:0061056,GO:1990837 NA NA chr20 22536728 22537726 999 * Distal Intergenic 105372564 ENST00000685359.1 -12519 LOC105372564 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 23556333 23558376 1496 * Distal Intergenic 128821 ENST00000376979.4 10108 CST9L MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004869,GO:0005515,GO:0005615,GO:0010951,GO:0019730 NA NA chr20 23703640 23704754 1115 * Distal Intergenic 1472 ENST00000217423.4 -14602 CST4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001580,GO:0001895,GO:0004869,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005615,GO:0010951,GO:0045861,GO:0070062 hsa04970 NA chr20 23739856 23741123 1268 * Intron (ENST00000671162.1/105372574, intron 2 of 3) 1469 ENST00000304749.7 9812 CST1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001580,GO:0004869,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005615,GO:0010951 hsa04970 NA chr20 24716453 24718061 1609 * Distal Intergenic 79953 ENST00000482637.1 131551 SYNDIG1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005887,GO:0006886,GO:0014069,GO:0030672,GO:0031901,GO:0035254,GO:0042803,GO:0043197,GO:0043198,GO:0043231,GO:0044297,GO:0051965,GO:0060076,GO:0097091,GO:0098839 NA NA chr20 24821716 24822807 1092 * Distal Intergenic 8530 ENST00000480798.2 -126462 CST7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Promoter (<=1kb) 728882 ENST00000584356.1 0 FAM182B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 29753873 29755989 1273 * Distal Intergenic 105379478 ENST00000659588.1 205212 FAM242B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 29770265 29771478 1214 * Distal Intergenic 105379478 ENST00000659588.1 221604 FAM242B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 31322865 31324547 1683 * Distal Intergenic 245930 ENST00000400549.1 -14280 DEFB116 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005576,GO:0042742,GO:0045087 NA NA chr20 32956081 32957458 1378 * Intron (ENST00000400522.9/388795, intron 23 of 26) 388795 ENST00000524882.1 39021 EFCAB8 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509 NA NA chr20 32976111 32977190 1080 * Distal Intergenic 140732 ENST00000420875.5 27117 SUN5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005635,GO:0005637,GO:0005794,GO:0006998,GO:0007283,GO:0007286,GO:0016021,GO:0034993,GO:0043495,GO:0097224,GO:0097224 NA NA chr20 33093101 33094565 1465 * Intron (ENST00000375483.4/149954, intron 11 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GO:0005829,GO:0007169,GO:0007411,GO:0043410,GO:0051386 NA NA chr20 54990884 54992523 1640 * Distal Intergenic 102723578 ENST00000627529.2 -416375 LINC01440 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 55372781 55373828 1048 * Distal Intergenic 102723578 ENST00000627529.2 -35070 LINC01440 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 56155268 56157091 1824 * Distal Intergenic 4159 ENST00000243911.2 -91641 MC3R MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002027,GO:0004930,GO:0004977,GO:0004980,GO:0004980,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007187,GO:0007189,GO:0007189,GO:0007200,GO:0008217,GO:0017046,GO:0019222,GO:0032922,GO:0042309,GO:0042923,GO:0045475,GO:0055078,GO:0060259 hsa04080 NA chr20 56744368 56745541 1032 * Distal Intergenic 7022 ENST00000416606.1 114134 TFAP2C MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001228,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005739,GO:0005829,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007267,GO:0008584,GO:0040029,GO:0042127,GO:0045944,GO:0045944,GO:0048856,GO:1990837 NA NA chr20 57887298 57888989 1692 * Distal Intergenic 105376992 ENST00000616333.1 -114915 LINC01742 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 58196236 58197809 1333 * Distal Intergenic 140731 ENST00000457363.2 30844 ANKRD60 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 59392750 59394274 1525 * Distal Intergenic 1908 ENST00000672969.1 91229 EDN3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001755,GO:0002690,GO:0003100,GO:0003100,GO:0005102,GO:0005179,GO:0005179,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0006874,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007267,GO:0007275,GO:0008015,GO:0008284,GO:0010460,GO:0010468,GO:0010961,GO:0014824,GO:0014826,GO:0014826,GO:0019229,GO:0030072,GO:0030182,GO:0030318,GO:0030593,GO:0031708,GO:0031708,GO:0042310,GO:0043406,GO:0045597,GO:0045840,GO:0046887,GO:0048016,GO:0048070,GO:0060585,GO:1901381 hsa04024,hsa04080,hsa04270,hsa04924 NA chr20 59637926 59640092 2167 * Intron (ENST00000359926.7/116154, intron 1 of 12) 116154 ENST00000541461.5 9317 PHACTR3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003779,GO:0004864,GO:0005515,GO:0005654,GO:0008157,GO:0016363,GO:0030036,GO:0032515 NA NA chr20 60196479 60197718 1057 * Intron (ENST00000654397.1/284757, intron 4 of 6) 284757 ENST00000427820.1 15591 MIR646HG MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 60197747 60199928 2182 * Intron (ENST00000654397.1/284757, intron 4 of 6) 284757 ENST00000427820.1 16859 MIR646HG MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 60524944 60527012 1790 * Intron (ENST00000668055.1/284757, intron 3 of 4) 100616440 ENST00000581228.1 -37550 MIR548AG2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 60649769 60652519 2751 * Exon (ENST00000659856.1/284757, exon 6 of 6) 100616440 ENST00000581228.1 85207 MIR548AG2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 60900495 60902957 2463 * Distal Intergenic 105372699 ENST00000613711.1 138621 LOC105372699 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 61889093 61890846 693 * Intron (ENST00000614565.5/1002, intron 7 of 15) 100302168 ENST00000408490.1 62816 MIR1257 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 63075939 63078940 2753 * Intron (ENST00000606208.5/63930, intron 1 of 1) 768096 ENST00000433161.1 -23265 HAR1A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 63111259 63112929 1671 * Distal Intergenic 105372719 ENST00000665943.1 -3289 LOC105372719 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 63147544 63148847 1116 * Intron (ENST00000665538.1/ENST00000665538.1, intron 1 of 2) 406909 ENST00000384866.1 -29653 MIR124-3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0035195 hsa05206 NA chr20 63149295 63150470 1176 * Intron (ENST00000665538.1/ENST00000665538.1, intron 1 of 2) 406909 ENST00000384866.1 -28030 MIR124-3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0035195 hsa05206 NA chr21 8419597 8421019 1423 * Exon (ENST00000652246.1/ENST00000652246.1, exon 1 of 1) 103504733 ENST00000617390.1 -11511 MIR6724-4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr21 18594698 18595989 1292 * Intron (ENST00000437492.6/101927797, intron 2 of 4) 100422920 ENST00000580069.1 90175 MIR548X MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr21 25680378 25681393 737 * Intron (ENST00000480456.6/58494, intron 1 of 9) 58494 ENST00000460679.5 -8473 JAM2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005178,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005887,GO:0005923,GO:0007286,GO:0007520,GO:0009986,GO:0030198,GO:0031642,GO:0035633,GO:0036477,GO:0044291,GO:0045123,GO:0050900,GO:0050901,GO:0070160,GO:0071593,GO:0097241,GO:0098609,GO:0098609,GO:0098636,GO:2000403 hsa04514,hsa04530,hsa04670,hsa05120 NA chr21 28161647 28163670 2024 * Exon (ENST00000453420.5/101927973, exon 5 of 6) 101927973 ENST00000433303.1 6473 101927973 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr21 29957730 29958851 1122 * Distal Intergenic 2897 ENST00000472429.1 -17697 GRIK1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007215,GO:0007268,GO:0007399,GO:0007417,GO:0008066,GO:0015276,GO:0015277,GO:0034220,GO:0035235,GO:0035249,GO:0038023,GO:0045211,GO:0050804,GO:0051966,GO:0060078,GO:1904315 hsa04080,hsa04724 NA chr21 29987172 29988353 1182 * Distal Intergenic 2897 ENST00000472429.1 -47139 GRIK1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007215,GO:0007268,GO:0007399,GO:0007417,GO:0008066,GO:0015276,GO:0015277,GO:0034220,GO:0035235,GO:0035249,GO:0038023,GO:0045211,GO:0050804,GO:0051966,GO:0060078,GO:1904315 hsa04080,hsa04724 NA chr21 30382627 30383689 1063 * Distal Intergenic 100422891 ENST00000581194.1 -7249 MIR4327 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr21 30571312 30572863 1552 * Distal Intergenic 337974 ENST00000334849.2 -9998 KRTAP19-7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005829,GO:0005882,GO:0031424 NA NA chr21 30669671 30670809 1139 * Distal Intergenic 337985 ENST00000382826.2 26807 KRTAP20-3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005882 NA NA chr21 30876567 30877918 1150 * Distal Intergenic 337880 ENST00000332378.6 3662 KRTAP11-1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005829,GO:0005882,GO:0031424 NA NA chr21 30926774 30928752 1586 * Distal Intergenic 337880 ENST00000332378.6 -45194 KRTAP11-1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005829,GO:0005882,GO:0031424 NA NA chr21 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(ENST00000416555.1/150084, intron 1 of 2) 150084 ENST00000457325.1 -5389 IGSF5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005923,GO:0009986,GO:0016021,GO:0016324,GO:0098609 hsa04530,hsa05120 NA chr21 39946652 39948066 1415 * Distal Intergenic 5121 ENST00000467565.1 48176 PCP4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005516,GO:0005516,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0032991,GO:0045666,GO:0099004 NA NA chr21 40054494 40056720 2227 * Exon (ENST00000400454.6/1826, exon 29 of 33) 100616148 ENST00000585040.1 155711 MIR4760 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr21 41104349 41105632 1284 * Distal Intergenic 284835 ENST00000446910.1 41801 LINC00323 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr21 42354490 42355730 1241 * Distal Intergenic 7032 ENST00000463771.5 -3493 TFF2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005615,GO:0030277,GO:0031723,GO:0060455,GO:0070098 NA NA chr21 44453848 44454941 1069 * Promoter (<=1kb) 100861510 ENST00000426578.1 343 LRRC3-DT MCF10A 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of 9) 128954 ENST00000651146.1 13228 GAB4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 19681077 19682373 1297 * Distal Intergenic 5413 ENST00000455784.7 -32130 SEPTIN5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003924,GO:0003924,GO:0005198,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005886,GO:0005940,GO:0008021,GO:0008021,GO:0015630,GO:0016080,GO:0017157,GO:0017157,GO:0030534,GO:0031105,GO:0031105,GO:0032153,GO:0034613,GO:0035176,GO:0042802,GO:0060090,GO:0061640,GO:2000300 hsa05012,hsa05022 NA chr22 22458465 22460375 1141 * Distal Intergenic 140883 ENST00000613655.1 29093 ZNF280B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872 NA NA chr22 22982162 22983407 1194 * Distal Intergenic 2781 ENST00000615612.2 -87112 GNAZ MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001664,GO:0003924,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005635,GO:0005783,GO:0005829,GO:0005834,GO:0005886,GO:0006457,GO:0007186,GO:0007188,GO:0007193,GO:0031683,GO:0031821,GO:0046872 hsa04730 NA chr22 22984352 22985505 1154 * Distal Intergenic 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8248 NEFH MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000226,GO:0005200,GO:0005200,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005883,GO:0007409,GO:0008017,GO:0014069,GO:0019894,GO:0019901,GO:0030031,GO:0030424,GO:0030674,GO:0033693,GO:0048936,GO:0060052,GO:0061564,GO:0070840,GO:0097418,GO:0098685,GO:0099160,GO:0099184,GO:0099185,GO:1902513,GO:1990830 hsa05014,hsa05022 NA chr22 30143056 30144484 1429 * Intron (ENST00000336726.11/150280, intron 10 of 10) 150280 ENST00000491605.1 49098 HORMAD2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000795,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005813,GO:0005829,GO:0051177,GO:0051321 NA NA chr22 30470201 30471412 1212 * Promoter (<=1kb) 266629 ENST00000540910.5 0 SEC14L3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0008289,GO:0070062 NA NA chr22 31924684 31925768 1085 * Promoter (2-3kb) 105372998 ENST00000654264.1 2639 LOC105372998 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 35133252 35134349 1098 * Intron (ENST00000423311.1/104310353, intron 4 of 5) 91464 ENST00000404699.7 67094 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intron 1 of 6) 25830 ENST00000432404.5 4244 SULT4A1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008146,GO:0008146,GO:0008150,GO:0008202,GO:0042802,GO:0050427,GO:0051923 NA NA chr22 44322519 44324036 1518 * Distal Intergenic 85352 ENST00000381176.5 -9568 SHISAL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0016021 NA NA chr22 44415411 44417542 2132 * Distal Intergenic 101927526 ENST00000415702.1 -25785 LINC01656 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 44419064 44420232 1119 * Distal Intergenic 101927526 ENST00000415702.1 -23095 LINC01656 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 44460076 44462025 1950 * Distal Intergenic 101927526 ENST00000415702.1 16749 LINC01656 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 44476699 44478187 1341 * Distal Intergenic 84247 ENST00000341255.4 20046 RTL6 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 44512334 44517543 5210 * Distal Intergenic 84247 ENST00000341255.4 -14101 RTL6 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 45366344 45367808 1465 * Intron (ENST00000357450.9/27127, intron 15 of 24) 55007 ENST00000479180.1 29949 FAM118A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0016021,GO:0042802 NA NA chr22 47351345 47352418 1074 * Intron (ENST00000434707.1/339685, intron 1 of 3) 339685 ENST00000434707.1 5776 LOC339685 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 47378338 47379503 707 * Distal Intergenic 339685 ENST00000434707.1 32769 LOC339685 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 47410965 47412406 1442 * Distal Intergenic 339685 ENST00000434707.1 65396 LOC339685 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 47436079 47437633 785 * Distal Intergenic 101927722 ENST00000405369.3 49478 LINC01644 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 47679307 47680891 1166 * Intron (ENST00000650947.2/284930, intron 2 of 6) 284930 ENST00000651983.1 -5309 EPIC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 47816016 47817275 1260 * Intron (ENST00000664761.1/284930, intron 5 of 5) 284930 ENST00000651270.1 116822 EPIC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA 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2) 100144603 ENST00000654727.1 3302 CHKB-DT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 181019 182416 1398 * Intron (ENST00000663345.1/101927174, intron 1 of 2) 101927174 ENST00000663345.1 14305 CHL1-AS2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 296332 297581 1250 * Intron (ENST00000256509.7/10752, intron 2 of 27) 10752 ENST00000620033.4 -22102 CHL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007155,GO:0007165,GO:0007411,GO:0016021,GO:0031103,GO:0070062 NA NA chr3 370091 371304 1214 * Promoter (2-3kb) 10752 ENST00000470880.6 -2292 CHL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007155,GO:0007165,GO:0007411,GO:0016021,GO:0031103,GO:0070062 NA NA chr3 2916940 2918312 1288 * Intron (ENST00000427741.5/152330, intron 11 of 20) 152330 ENST00000475817.1 16226 CNTN4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intron (ENST00000454887.1/23066, intron 3 of 3) 105376955 ENST00000448129.1 19520 LINC02022 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 13176062 13177472 1411 * Intron (ENST00000648114.1/9922, intron 1 of 15) 9922 ENST00000613206.2 -102633 IQSEC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005085,GO:0005515,GO:0005730,GO:0008021,GO:0008289,GO:0014069,GO:0016020,GO:0030036,GO:0032012,GO:0043231,GO:0043547,GO:0051549,GO:0060996,GO:0120183 hsa04144 NA chr3 13616703 13617882 1180 * Promoter (2-3kb) 2199 ENST00000477845.1 2805 FBLN2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005201,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0010811,GO:0030023,GO:0030023,GO:0030198,GO:0031012,GO:0050840,GO:0062023,GO:0062023,GO:1903561 NA NA chr3 13713270 13714464 1056 * Intron (ENST00000438915.1/285375, intron 1 of 1) 285375 ENST00000665476.1 62537 LINC00620 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 13959813 13960929 1056 * Intron (ENST00000532880.6/348825, intron 3 of 4) 348825 ENST00000529129.6 16470 TPRXL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 14680057 14681402 644 * Intron (ENST00000435614.5/84077, intron 1 of 16) 84077 ENST00000412910.1 4878 C3orf20 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737,GO:0016021 NA NA chr3 14712736 14714197 1462 * Exon (ENST00000435614.5/84077, exon 8 of 17) 84077 ENST00000495387.1 8381 C3orf20 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737,GO:0016021 NA NA chr3 14904178 14906240 2020 * Intron (ENST00000543601.5/152273, intron 9 of 18) 152273 ENST00000476851.1 7216 FGD5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001726,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005856,GO:0005886,GO:0007010,GO:0008360,GO:0030027,GO:0030036,GO:0031267,GO:0032587,GO:0043087,GO:0046847,GO:0046872 NA NA chr3 15546465 15547626 1111 * Distal Intergenic 8292 ENST00000603808.5 -24714 COLQ MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001507,GO:0005201,GO:0005201,GO:0005515,GO:0005581,GO:0005604,GO:0005615,GO:0005886,GO:0008201,GO:0030054,GO:0030198,GO:0031012,GO:0043083,GO:0062023 NA NA chr3 16553372 16554420 1049 * Distal Intergenic 100996597 ENST00000670078.1 17029 LINC00690 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 16713314 16714647 1315 * Distal Intergenic 1618 ENST00000454457.1 -43008 DAZL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003723,GO:0003730,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0007275,GO:0007281,GO:0007283,GO:0008494,GO:0008494,GO:0032991,GO:0045948,GO:0045948,GO:0070935 NA NA chr3 17101085 17102061 643 * Distal Intergenic 23228 ENST00000419842.1 90591 PLCL2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002322,GO:0002337,GO:0004435,GO:0005515,GO:0005737,GO:0006629,GO:0007214,GO:0032228,GO:0033135,GO:0048015,GO:0050811,GO:0050859,GO:0070679,GO:0120163,GO:1900122 NA NA chr3 18448924 18450165 1242 * Intron (ENST00000414198.7/101927777, intron 1 of 6) 6304 ENST00000415069.6 -3303 SATB1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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of 1) 10777 ENST00000450234.5 -421766 ARPP21 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0003676,GO:0005516,GO:0005575,GO:0005737,GO:0008150,GO:0034605 NA NA chr3 36764463 36766084 1622 * Promoter (<=1kb) 85443 ENST00000636136.2 0 DCLK3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004672,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005737,GO:0018105,GO:0106310,GO:0106311 NA NA chr3 37577567 37579262 1156 * Intron (ENST00000422441.5/3680, intron 15 of 15) 3680 ENST00000461533.1 -104614 ITGA9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005518,GO:0005886,GO:0007155,GO:0007229,GO:0008305,GO:0030198,GO:0034679,GO:0042060,GO:0043236,GO:0046872 hsa04151,hsa04510,hsa04512,hsa04514,hsa04810,hsa05165,hsa05410,hsa05412,hsa05414 NA chr3 37657295 37659099 1805 * Intron (ENST00000264741.10/3680, intron 17 of 27) 3680 ENST00000461533.1 -24777 ITGA9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005518,GO:0005886,GO:0007155,GO:0007229,GO:0008305,GO:0030198,GO:0034679,GO:0042060,GO:0043236,GO:0046872 hsa04151,hsa04510,hsa04512,hsa04514,hsa04810,hsa05165,hsa05410,hsa05412,hsa05414 NA chr3 38061826 38063006 1181 * Promoter (<=1kb) 9940 ENST00000447130.1 0 DLEC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008285 NA NA chr3 38083812 38084943 1109 * Exon (ENST00000440294.6/9940, exon 7 of 17) 9940 ENST00000469151.1 21034 DLEC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008285 NA NA chr3 41371500 41374016 1041 * Intron (ENST00000301831.9/54986, intron 35 of 36) 54986 ENST00000489118.1 -93349 ULK4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000226,GO:0005524,GO:0006468,GO:0010975,GO:0043408,GO:0046328,GO:0090036,GO:0106310,GO:0106311,GO:1900744,GO:2001222 NA NA chr3 42480833 42482266 1152 * Distal Intergenic 7433 ENST00000433647.5 -7033 VIPR1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004999,GO:0004999,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007166,GO:0007186,GO:0007187,GO:0007188,GO:0008284,GO:0008528,GO:0017046,GO:0017046,GO:0043235 hsa04080 NA chr3 43050208 43051126 819 * Promoter (2-3kb) 729085 ENST00000690675.1 -2405 GASK1A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005576,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005901,GO:0043231 NA NA chr3 43123498 43124519 804 * Distal Intergenic 84892 ENST00000687440.1 -17413 POMGNT2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001764,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006493,GO:0006493,GO:0006493,GO:0008375,GO:0008375,GO:0008375,GO:0016021,GO:0016757,GO:0018215,GO:0035269,GO:0035269,GO:0097363,GO:0097363,GO:0097363 hsa00515,hsa01100 NA chr3 43929283 43930424 1142 * Distal Intergenic 406929 ENST00000385219.1 -183788 MIR138-1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005634,GO:0005737,GO:0007162,GO:0008285,GO:0010629,GO:0030336,GO:0032088,GO:0033689,GO:0035195,GO:0035195,GO:0035278,GO:0043553,GO:0044854,GO:0045668,GO:0045944,GO:0050728,GO:0051001,GO:0051497,GO:0051897,GO:0060761,GO:1900045,GO:1903231,GO:1903671,GO:1903753,GO:1905460,GO:2000134 NA NA chr3 44531327 44532494 1168 * Distal Intergenic 285346 ENST00000489411.1 -20691 ZNF852 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intron 5 of 9) 401067 ENST00000446775.5 -3269 IQCF3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005516 NA NA chr3 51828564 51829661 1098 * Promoter (<=1kb) 401067 ENST00000465028.1 0 IQCF3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005516 NA NA chr3 54400695 54403672 1131 * Intron (ENST00000415676.6/55799, intron 5 of 38) 55799 ENST00000478466.1 127921 CACNA2D3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005245,GO:0005886,GO:0005891,GO:0034765,GO:0046872,GO:0061337,GO:0070588 hsa04010,hsa04260,hsa04261,hsa04921,hsa05410,hsa05412,hsa05414 NA chr3 57325375 57326505 1131 * Intron (ENST00000351747.6/201625, intron 47 of 58) 201625 ENST00000494758.5 -16130 DNAH12 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005524,GO:0005737,GO:0005874,GO:0005929,GO:0007018,GO:0008569,GO:0030286 hsa05014,hsa05016,hsa05022 NA chr3 58686298 58687319 995 * Distal Intergenic 131177 ENST00000489857.5 -19464 FAM3D MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005125,GO:0005576,GO:0005615,GO:0007165,GO:0046676,GO:0070093 NA NA chr3 61260228 61261802 1575 * Distal Intergenic 2272 ENST00000468189.5 -8769 FHIT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000166,GO:0001650,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006163,GO:0006163,GO:0015964,GO:0015964,GO:0031625,GO:0031625,GO:0032435,GO:0032435,GO:0042802,GO:0047710,GO:0047710,GO:0072332,GO:0072332 hsa00230,hsa01100,hsa05222,hsa05223 NA chr3 61363250 61364406 1157 * Distal Intergenic 2272 ENST00000468189.5 -111791 FHIT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000166,GO:0001650,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006163,GO:0006163,GO:0015964,GO:0015964,GO:0031625,GO:0031625,GO:0032435,GO:0032435,GO:0042802,GO:0047710,GO:0047710,GO:0072332,GO:0072332 hsa00230,hsa01100,hsa05222,hsa05223 NA chr3 66665492 66666626 1135 * Distal Intergenic 105377144 ENST00000661256.1 157813 LOC105377144 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 66916127 66917357 1231 * Distal Intergenic 84541 ENST00000484414.5 -80950 KBTBD8 MCF10A 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intron 1 of 1) 441025 ENST00000512043.1 -51708 LINC02483 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr4 75378950 75380078 1129 * Intron (ENST00000510744.1/ENST00000510744.1, intron 1 of 1) 441025 ENST00000512043.1 24874 LINC02483 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr4 75409822 75411046 1225 * Intron (ENST00000507739.5/ENST00000507739.5, intron 1 of 2) 441025 ENST00000512043.1 55746 LINC02483 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr4 75581907 75582889 983 * Intron (ENST00000307465.9/8999, intron 12 of 13) 8999 ENST00000515793.1 14251 CDKL2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004672,GO:0004693,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005813,GO:0006468,GO:0007165,GO:0007548,GO:0051726 NA NA chr4 77532243 77533396 1154 * Intron (ENST00000286758.4/10563, intron 1 of 4) 10563 ENST00000286758.4 20490 CXCL13 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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2032 * Intron (ENST00000264938.8/6550, intron 1 of 16) 107986395 ENST00000652670.1 -5557 LOC107986395 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr5 792870 794257 1388 * Distal Intergenic 101928768 ENST00000689543.2 8045 101928768 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr5 986650 988835 2186 * Exon (ENST00000399869.1/100506688, exon 2 of 2) 100506688 ENST00000399869.1 8473 LINC02982 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr5 1124075 1125232 1158 * Distal Intergenic 10723 ENST00000264930.10 -12012 SLC12A7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0005887,GO:0006811,GO:0006884,GO:0007268,GO:0008519,GO:0015379,GO:0019901,GO:0032991,GO:0045202,GO:0055064,GO:0055075,GO:0140157,GO:1902476,GO:1990573 hsa04966 NA chr5 1157156 1158472 1313 * Distal Intergenic 101928857 ENST00000505972.2 20074 TERLR1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr5 1439656 1441234 1322 * Intron (ENST00000270349.12/6531, intron 3 of 14) 6531 ENST00000270349.12 4206 SLC6A3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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253018 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr6 31371715 31373480 1766 * Intron (ENST00000649421.1/ENST00000649421.1, intron 1 of 1) 3106 ENST00000696560.1 -4648 3106 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr6 32464320 32465781 1462 * Intron (ENST00000449413.1/ENST00000449413.1, intron 1 of 1) 3122 ENST00000395388.7 24433 HLA-DRA MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0001772,GO:0001916,GO:0002250,GO:0002469,GO:0002491,GO:0002503,GO:0002504,GO:0005515,GO:0005764,GO:0005765,GO:0005765,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006955,GO:0009986,GO:0012507,GO:0016032,GO:0019886,GO:0019886,GO:0023026,GO:0030247,GO:0030658,GO:0030666,GO:0030669,GO:0031902,GO:0032395,GO:0032588,GO:0032831,GO:0042605,GO:0042608,GO:0042613,GO:0042613,GO:0043382,GO:0045622,GO:0050852,GO:0050890,GO:0060333,GO:0070062,GO:0071556,GO:2000516 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intron 5 of 5) 101927314 ENST00000665968.1 -81922 LOC101927314 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr6 97609126 97611350 1183 * Intron (ENST00000457513.2/101927314, intron 5 of 5) 101927314 ENST00000665968.1 -15564 LOC101927314 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr6 98153867 98155484 1618 * Intron (ENST00000669069.1/101927314, intron 10 of 11) 100302164 ENST00000459007.1 129336 MIR2113 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:1903561 NA NA chr6 98192934 98194109 1176 * Intron (ENST00000669069.1/101927314, intron 10 of 11) 100302164 ENST00000459007.1 168403 MIR2113 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:1903561 NA NA chr6 98563265 98564487 1223 * Distal Intergenic 5454 ENST00000328345.8 -270087 POU3F2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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1 of 3) 219578 ENST00000611114.1 -104782 ZNF804B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005634,GO:0046872 NA NA chr7 89237637 89238583 947 * Intron (ENST00000333190.5/219578, intron 2 of 3) 219578 ENST00000611114.1 19483 ZNF804B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005634,GO:0046872 NA NA chr7 89475657 89476733 1077 * Intron (ENST00000655452.1/105375387, intron 3 of 5) 105375387 ENST00000665308.1 31668 LOC105375387 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 89508843 89509940 1098 * Distal Intergenic 105375387 ENST00000665308.1 64854 LOC105375387 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 89532836 89534351 771 * Distal Intergenic 105375387 ENST00000665308.1 88847 LOC105375387 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 89956400 89957374 975 * Intron (ENST00000478318.6/100874100, intron 2 of 2) 442523 ENST00000691157.1 -161984 DPY19L2P4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 90090600 90091903 1304 * Intron (ENST00000478318.6/100874100, intron 2 of 2) 442523 ENST00000691157.1 -27455 DPY19L2P4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 90435022 90436125 1104 * Intron (ENST00000480135.1/9069, intron 2 of 3) 102723899 ENST00000451941.6 29441 PTTG1IP2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 91441953 91443216 1149 * Intron (ENST00000418395.1/105375392, intron 2 of 5) 105375392 ENST00000664526.1 -12340 LINC02932 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 93403877 93406141 2265 * Distal Intergenic 55610 ENST00000443443.1 53979 VPS50 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000149,GO:0000149,GO:0005515,GO:0005829,GO:0015031,GO:0016020,GO:0032456,GO:0032456,GO:0032456,GO:0042147,GO:0055037,GO:0070062,GO:1990745,GO:1990745 NA NA chr7 95057873 95059057 1185 * Intron (ENST00000433360.6/55607, intron 2 of 19) 55607 ENST00000289495.7 147790 PPP1R9A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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hsa00250,hsa01100,hsa01230 NA chr7 98575070 98576378 1241 * Distal Intergenic 4885 ENST00000265634.4 -40907 NPTX2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005576,GO:0007268,GO:0008306,GO:0030246,GO:0046872,GO:0098962,GO:0098962,GO:0098978,GO:0098978 NA NA chr7 98695085 98696093 1009 * Distal Intergenic 4885 ENST00000466102.1 75418 NPTX2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005576,GO:0007268,GO:0008306,GO:0030246,GO:0046872,GO:0098962,GO:0098962,GO:0098978,GO:0098978 NA NA chr7 98758131 98760638 2508 * Distal Intergenic 222865 ENST00000450876.5 106308 TMEM130 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0005515,GO:0005794,GO:0005887 NA NA chr7 99937763 99939737 1122 * Intron (ENST00000456499.1/ENST00000456499.1, intron 1 of 2) 349149 ENST00000312891.3 -8143 349149 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 101582451 101584311 1652 * Distal Intergenic 100506527 ENST00000437900.1 -13445 LINC01007 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr7 106158484 106160607 2124 * Distal Intergenic 6856 ENST00000483448.1 -45908 SYPL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005887,GO:0007268,GO:0016021,GO:0017075,GO:0030141,GO:0030285,GO:0030672,GO:0042470,GO:0070062 NA NA chr7 107650581 107651655 1075 * Exon (ENST00000668981.1/286002, exon 2 of 2) 5172 ENST00000644269.2 -9173 SLC26A4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0005887,GO:0006811,GO:0006885,GO:0007605,GO:0008271,GO:0008272,GO:0015106,GO:0015108,GO:0015111,GO:0015116,GO:0015301,GO:0015698,GO:0015701,GO:0015705,GO:0016021,GO:0016324,GO:0016324,GO:0019531,GO:0019532,GO:0031526,GO:0032880,GO:0070062,GO:0070062,GO:1902358,GO:1902476 hsa04918 NA chr7 108933263 108935054 1792 * Intron (ENST00000413406.1/ENST00000413406.1, intron 1 of 3) 154907 ENST00000624695.1 -48676 LINC02903 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr7 108941781 108942861 1081 * Intron (ENST00000413406.1/ENST00000413406.1, intron 1 of 3) 154907 ENST00000624695.1 -57194 LINC02903 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr7 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4435924 4437267 1344 * Intron (ENST00000635120.2/64478, intron 2 of 69) 64478 ENST00000400186.7 557434 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr8 4465700 4466803 1104 * Intron (ENST00000635120.2/64478, intron 2 of 69) 64478 ENST00000400186.7 527898 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr8 4717114 4718161 1048 * Intron (ENST00000635120.2/64478, intron 1 of 69) 64478 ENST00000400186.7 276540 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr8 4771767 4772919 1153 * Intron (ENST00000635120.2/64478, intron 1 of 69) 64478 ENST00000400186.7 221782 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr8 5184778 5185955 1178 * Distal Intergenic 64478 ENST00000602557.5 -189806 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr8 5204832 5206011 1180 * Distal Intergenic 64478 ENST00000602557.5 -209860 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr8 5267610 5268734 1125 * Distal Intergenic 64478 ENST00000602557.5 -272638 CSMD1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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63900856 2118 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 286184 ENST00000519550.1 129309 LINC01289 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 63955522 63957004 1202 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 286184 ENST00000519550.1 186092 LINC01289 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 63995347 63996430 1084 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 286184 ENST00000519550.1 225917 LINC01289 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 64017570 64019099 1530 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 102724623 ENST00000520365.1 221183 LINC01414 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 64032127 64033165 1039 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 102724623 ENST00000520365.1 207117 LINC01414 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 64043997 64045482 1225 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 102724623 ENST00000520365.1 194800 LINC01414 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 64054626 64055645 1020 * Intron (ENST00000523191.5/102724623, intron 4 of 5) 102724623 ENST00000520365.1 184637 LINC01414 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 64378406 64380315 1910 * Promoter (<=1kb) 406908 ENST00000385081.1 0 MIR124-2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0035195 hsa05206 NA chr8 64512692 64513838 1147 * Distal Intergenic 401463 ENST00000520834.1 63425 BHLHE22-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 67896938 67897815 838 * Distal Intergenic 80243 ENST00000288368.5 -54231 PREX2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005085,GO:0005096,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007186,GO:0007186,GO:0008344,GO:0014065,GO:0043547,GO:0048813 NA NA chr8 68527686 68528845 1152 * Intron (ENST00000518698.6/116328, intron 6 of 13) 116328 ENST00000518515.1 -4175 C8orf34 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 72435070 72436207 1117 * Distal Intergenic 9312 ENST00000523207.2 -101018 KCNB2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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102724858 ENST00000668249.1 36761 LOC102724858 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 76347529 76348780 1252 * Distal Intergenic 102724858 ENST00000668249.1 -39214 LOC102724858 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 82093358 82094921 1564 * Intron (ENST00000663058.1/105375931, intron 2 of 7) 105375931 ENST00000659043.1 59578 LOC105375931 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 82116977 82118081 1105 * Intron (ENST00000663058.1/105375931, intron 2 of 7) 105375929 ENST00000520988.1 42461 LINC02839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 83385243 83386820 1578 * Distal Intergenic 103352670 ENST00000522365.1 -16938 LINC01419 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 83765920 83766969 1050 * Distal Intergenic 103352670 ENST00000522365.1 362162 LINC01419 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 84427023 84428364 1095 * Intron (ENST00000522613.5/138046, intron 2 of 2) 138046 ENST00000522647.1 242082 RALYL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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1750 * Distal Intergenic 7227 ENST00000518018.1 599781 TRPS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0001227,GO:0001501,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0008270,GO:0019904,GO:0032330,GO:0032991 NA NA chr8 114982166 114983731 1220 * Distal Intergenic 7227 ENST00000518018.1 508490 TRPS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0001227,GO:0001501,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0008270,GO:0019904,GO:0032330,GO:0032991 NA NA chr8 116175078 116176827 1033 * Intron (ENST00000505156.2/100859921, intron 4 of 13) 100859921 ENST00000505156.2 148232 LINC00536 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 117504925 117507274 1104 * Distal Intergenic 90390 ENST00000297347.7 -13439 MED30 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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3515 TMEM71 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005739,GO:0016021 NA NA chr8 133737016 133738500 1485 * Distal Intergenic 101927798 ENST00000517380.1 38852 LOC101927798 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 133795252 133796687 777 * Intron (ENST00000517695.1/ENST00000517695.1, intron 1 of 2) 101927798 ENST00000517380.1 -17900 LOC101927798 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 135164703 135165780 1078 * Distal Intergenic 286094 ENST00000522279.5 -68351 LINC01591 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr8 135737005 135739008 840 * Distal Intergenic 10656 ENST00000522578.1 89270 KHDRBS3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000381,GO:0003723,GO:0003723,GO:0003729,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006397,GO:0016032,GO:0017124,GO:0019904,GO:0032991,GO:0042802,GO:0048024 NA NA chr8 139691203 139692211 964 * Intron (ENST00000522317.5/51305, intron 1 of 3) 51305 ENST00000649473.1 10745 KCNK9 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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(ENST00000637383.1/6595, intron 1 of 1) 6595 ENST00000637383.1 6455 SMARCA2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000976,GO:0003677,GO:0003682,GO:0003713,GO:0004386,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006338,GO:0006338,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007286,GO:0007399,GO:0008094,GO:0008094,GO:0008285,GO:0016514,GO:0030308,GO:0042393,GO:0043044,GO:0043231,GO:0045111,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0071564,GO:0071565 hsa04714,hsa05225 NA chr9 2436154 2437294 1141 * Intron (ENST00000648733.1/101930053, intron 10 of 11) 101930053 ENST00000653709.1 -10197 LOC101930053 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 4898601 4901397 2797 * Distal Intergenic 406894 ENST00000362195.3 48304 MIR101-2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0035195 hsa05206 NA chr9 5314679 5315830 1152 * Distal Intergenic 6019 ENST00000381627.4 -9963 RLN2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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1102 * Intron (ENST00000381196.9/5789, intron 8 of 45) 105375972 ENST00000449531.1 -400698 LOC105375972 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 9561519 9563241 1541 * Intron (ENST00000381196.9/5789, intron 8 of 45) 105375972 ENST00000449531.1 -236182 LOC105375972 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 9590614 9591771 1158 * Intron (ENST00000381196.9/5789, intron 7 of 45) 105375972 ENST00000449531.1 -207652 LOC105375972 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 9697386 9698777 1392 * Intron (ENST00000381196.9/5789, intron 7 of 45) 105375972 ENST00000449531.1 -100646 LOC105375972 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 9775809 9777208 1400 * Intron (ENST00000381196.9/5789, intron 5 of 45) 105375972 ENST00000449531.1 -22215 LOC105375972 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 10262719 10263939 1079 * Intron (ENST00000381196.9/5789, intron 3 of 45) 5789 ENST00000463477.5 348784 PTPRD MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0016021,GO:0042803 NA NA chr9 25761599 25762821 1158 * Distal Intergenic 101929582 ENST00000668254.1 -17211 LINC01241 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 26366730 26367762 1033 * Distal Intergenic 100506422 ENST00000612217.2 300055 LOC100506422 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000287,GO:0004170,GO:0006226,GO:0046081 NA NA chr9 26603018 26603988 823 * Distal Intergenic 79886 ENST00000517946.1 283490 79886 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 27988308 27989857 1550 * Intron (ENST00000698399.1/158038, intron 6 of 6) 158038 ENST00000698405.1 -39720 158038 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 28049078 28050441 1364 * Intron (ENST00000698399.1/158038, intron 6 of 6) 158038 ENST00000698405.1 -100490 158038 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 28106098 28107676 1579 * Intron (ENST00000698399.1/158038, intron 6 of 6) 158038 ENST00000698405.1 -157510 158038 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 30558632 30560374 1743 * Exon (ENST00000419995.2/ENST00000419995.2, exon 1 of 1) 401497 ENST00000629369.1 14638 401497 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 32769365 32771057 1693 * Distal Intergenic 401498 ENST00000342743.6 -12483 TMEM215 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA chr9 35876872 35878044 1173 * Distal Intergenic 392309 ENST00000377981.4 -6471 OR13J1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911 hsa04740 NA chr9 40595991 40597424 1180 * Distal Intergenic 101929959 ENST00000700922.1 -16922 BMS1P14 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 40906438 40908237 997 * Distal Intergenic 100302167 ENST00000622265.1 20855 MIR1299 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 62798937 62800163 1227 * Promoter (1-2kb) 103352539 ENST00000427509.5 -1298 LINC01410 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 63038784 63040317 1534 * Distal Intergenic 286297 ENST00000601096.1 82054 LOC286297 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 63040998 63042363 1366 * Distal Intergenic 286297 ENST00000601096.1 80008 LOC286297 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 65207710 65210297 2588 * Distal Intergenic 112268045 ENST00000588215.1 20564 LOC112268045 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 71232431 71233455 1025 * Intron (ENST00000357533.6/80036, intron 1 of 24) 80036 ENST00000677713.2 -110810 TRPM3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005227,GO:0005261,GO:0005261,GO:0005262,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006812,GO:0016048,GO:0050951,GO:0051262,GO:0070588,GO:0098655 NA NA chr9 73927743 73929986 2244 * Distal Intergenic 105376085 ENST00000422909.1 354128 LOC105376085 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 73986720 73988246 714 * Distal Intergenic 101927358 ENST00000669866.1 -383089 LOC101927358 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 74130631 74131885 1255 * Distal Intergenic 101927358 ENST00000669866.1 -239450 LOC101927358 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 74270580 74271750 1171 * Distal Intergenic 101927358 ENST00000669866.1 -99585 LOC101927358 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 74322072 74323522 1451 * Distal Intergenic 101927358 ENST00000669866.1 -47813 LOC101927358 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 74880258 74881391 1134 * Intron (ENST00000361255.7/140803, intron 1 of 38) 140803 ENST00000361255.7 5956 TRPM6 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005261,GO:0005262,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006468,GO:0009636,GO:0016324,GO:0031526,GO:0046872,GO:0051262,GO:0070588,GO:0098655,GO:0106310,GO:0106311 hsa04978 NA chr9 76341107 76342301 1195 * Intron (ENST00000545128.5/5125, intron 34 of 36) 5125 ENST00000673745.1 44359 PCSK5 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0007283,GO:0016021,GO:0030154 NA NA chr9 89229579 89230906 1328 * Distal Intergenic 53358 ENST00000375835.9 -50761 SHC3 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000165,GO:0001784,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007169,GO:0007173,GO:0007265,GO:0007411,GO:0007417,GO:0019901,GO:0030971 hsa01521,hsa01522,hsa04012,hsa04014,hsa04062,hsa04072,hsa04510,hsa04650,hsa04722,hsa04910,hsa04915,hsa04917,hsa04926,hsa04935,hsa05034,hsa05100,hsa05214,hsa05220,hsa05224,hsa05225,hsa05226 NA chr9 90487819 90490319 2501 * Intron (ENST00000449990.3/340515, intron 5 of 5) 340515 ENST00000668348.1 11471 LINC01501 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr9 90740018 90741411 1394 * Distal Intergenic 6850 ENST00000375751.8 -60376 SYK MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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hsa00500,hsa01100 NA chrX 2902168 2903936 1769 * Promoter (<=1kb) 100506356 ENST00000414053.1 -968 ARSD-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 3130801 3131884 1084 * Distal Intergenic 416 ENST00000359361.2 63968 ARSF MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004065,GO:0005788,GO:0046872,GO:0070062 NA NA chrX 3439462 3440688 1078 * Distal Intergenic 109616969 ENST00000390912.1 91563 SNORA48B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005730,GO:0006396 NA NA chrX 3535398 3536896 1434 * Distal Intergenic 109616969 ENST00000390912.1 -3147 SNORA48B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005730,GO:0006396 NA NA chrX 3541052 3542795 1405 * Distal Intergenic 109616969 ENST00000390912.1 -8801 SNORA48B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005730,GO:0006396 NA NA chrX 3763271 3765043 1773 * Distal Intergenic 5613 ENST00000262848.6 -49622 PRKX MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intron (ENST00000664306.2/412, intron 12 of 12) 26609 ENST00000381059.7 -107736 VCX MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0005634,GO:0005730,GO:0006325,GO:0007283,GO:0007420,GO:0042255 NA NA chrX 7748956 7750043 1088 * Intron (ENST00000664306.2/412, intron 12 of 12) 26609 ENST00000381059.7 -92219 VCX MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0005634,GO:0005730,GO:0006325,GO:0007283,GO:0007420,GO:0042255 NA NA chrX 8498552 8499560 1009 * Intron (ENST00000670272.1/107985716, intron 1 of 4) 107985716 ENST00000670272.1 5004 107985716 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 8753377 8754759 1086 * Distal Intergenic 3730 ENST00000262648.8 -21240 3730 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 8900229 8901595 1367 * Intron (ENST00000650341.1/105373125, intron 3 of 3) 105373125 ENST00000650341.1 25558 105373125 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 8902208 8903788 1581 * Intron (ENST00000650341.1/105373125, intron 3 of 3) 105373125 ENST00000650341.1 23365 105373125 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 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-125611 171484 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 13406341 13407713 1373 * Distal Intergenic 105373137 ENST00000420403.1 11081 105373137 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 13462296 13463411 1116 * Distal Intergenic 105373137 ENST00000420403.1 67036 105373137 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 14167664 14169351 1305 * Distal Intergenic 286480 ENST00000411687.1 -75031 UBE2E4P MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 14188927 14190520 1288 * Distal Intergenic 286480 ENST00000411687.1 -53862 UBE2E4P MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 14309841 14311525 1360 * Distal Intergenic 286480 ENST00000411687.1 65459 UBE2E4P MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 14601269 14602817 1549 * Intron (ENST00000443437.6/2742, intron 6 of 10) 2742 ENST00000415367.1 70123 GLRA2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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83690 REPS2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006897,GO:0007173,GO:0016197,GO:0061024,GO:0065003 NA NA chrX 17351224 17352484 1261 * Distal Intergenic 4810 ENST00000676302.1 -22716 NHS MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002088,GO:0005794,GO:0005923,GO:0005925,GO:0016324,GO:0016604,GO:0030027,GO:0030054,GO:0030154 NA NA chrX 17353177 17354690 1514 * Distal Intergenic 4810 ENST00000676302.1 -20510 NHS MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002088,GO:0005794,GO:0005923,GO:0005925,GO:0016324,GO:0016604,GO:0030027,GO:0030054,GO:0030154 NA NA chrX 17653751 17654946 1196 * Promoter (1-2kb) 4810 ENST00000648929.1 -1193 NHS MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002088,GO:0005794,GO:0005923,GO:0005925,GO:0016324,GO:0016604,GO:0030027,GO:0030054,GO:0030154 NA NA chrX 17883014 17884236 1223 * Distal Intergenic 10742 ENST00000545871.1 -21677 RAI2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0009792 NA NA chrX 17951125 17953128 2004 * Distal Intergenic 10742 ENST00000545871.1 -89788 RAI2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0009792 NA NA chrX 17974082 17975233 1152 * Intron (ENST00000453902.1/105373144, intron 3 of 4) 10742 ENST00000545871.1 -112745 RAI2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0009792 NA NA chrX 17976567 17978022 1456 * Intron (ENST00000453902.1/105373144, intron 3 of 4) 10742 ENST00000545871.1 -115230 RAI2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005515,GO:0005575,GO:0009792 NA NA chrX 17983771 17984872 1102 * Intron (ENST00000453902.1/105373144, intron 2 of 4) 105373144 ENST00000453902.1 119772 LINC01456 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 18016883 18018250 1368 * Intron (ENST00000453902.1/105373144, intron 1 of 4) 105373144 ENST00000453902.1 86394 LINC01456 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 18049661 18051264 1604 * Intron (ENST00000453902.1/105373144, intron 1 of 4) 105373144 ENST00000453902.1 53380 LINC01456 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 18121715 18123291 1095 * Distal Intergenic 105373144 ENST00000453902.1 -17071 LINC01456 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 18157901 18159431 1399 * Distal Intergenic 105373144 ENST00000453902.1 -53257 LINC01456 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 18364976 18366122 1147 * Distal Intergenic 10389 ENST00000251900.9 -10288 SCML2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0009653,GO:0031519,GO:0042393,GO:0045892 NA NA chrX 19395180 19396338 1159 * 3 UTR 389840 ENST00000470101.1 -22002 MAP3K15 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000165,GO:0000186,GO:0004672,GO:0004709,GO:0005524,GO:0006468,GO:0033554,GO:0046872 NA NA chrX 19412086 19413829 1744 * 3 UTR 389840 ENST00000470101.1 -38908 MAP3K15 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000165,GO:0000186,GO:0004672,GO:0004709,GO:0005524,GO:0006468,GO:0033554,GO:0046872 NA NA chrX 19470259 19471666 1355 * Intron (ENST00000518578.5/389840, intron 1 of 29) 389840 ENST00000359173.7 -10132 MAP3K15 MCF10A 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(ENST00000379374.5/5251, intron 6 of 21) 5251 ENST00000684745.1 30098 PHEX MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001501,GO:0004222,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006464,GO:0006508,GO:0007267,GO:0008270,GO:0016485,GO:0019637,GO:0030282,GO:0030324,GO:0042476,GO:0048471,GO:0060348,GO:0060416,GO:0071305,GO:0071374,GO:1904383,GO:1990418 NA NA chrX 22609992 22611149 1158 * Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 4 of 5) 158506 ENST00000323684.4 337079 CBLL2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005737,GO:0016567,GO:0016567,GO:0030155,GO:0046872,GO:0061630 NA NA chrX 22677670 22678844 1175 * Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 4 of 5) 168400 ENST00000327968.7 -321116 DDX53 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003723,GO:0003724,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005829,GO:0043231 NA NA chrX 22679097 22680494 1398 * Intron (ENST00000687248.1/100873065, intron 4 of 5) 168400 ENST00000327968.7 -319466 DDX53 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intron (ENST00000465127.1/7102, intron 3 of 8) 8406 ENST00000461865.1 39752 SRPX MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001845,GO:0005201,GO:0005515,GO:0005776,GO:0005783,GO:0006914,GO:0007155,GO:0009986,GO:0016020,GO:0034976,GO:0060244,GO:0062023,GO:2001241 NA NA chrX 38691459 38693653 2195 * Distal Intergenic 7102 ENST00000419600.3 25363 TSPAN7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005887,GO:0016032 hsa05202 NA chrX 39074764 39075893 1130 * Distal Intergenic 105373175 ENST00000693053.1 223893 LOC105373175 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 39107634 39108717 1021 * Distal Intergenic 105373175 ENST00000693053.1 191069 LOC105373175 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 39251961 39253264 1304 * Intron (ENST00000693053.1/105373175, intron 2 of 3) 105373175 ENST00000693053.1 46522 LOC105373175 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 39315629 39316798 1170 * Intron (ENST00000448597.1/286442, intron 2 of 3) 286442 ENST00000655040.1 5687 LINC01281 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA 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LOC101927476 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 40977520 40979316 1596 * Distal Intergenic 8239 ENST00000324545.9 -106129 USP9X MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0001764,GO:0004197,GO:0004843,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006625,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007179,GO:0007292,GO:0008234,GO:0016020,GO:0016477,GO:0016567,GO:0016579,GO:0016579,GO:0016579,GO:0016579,GO:0018215,GO:0030426,GO:0030509,GO:0042752,GO:0044267,GO:0048511,GO:0048675,GO:0050821,GO:0051301,GO:0070410,GO:0071108,GO:0071947,GO:0101005,GO:1901537,GO:1990380 NA NA chrX 41292938 41293797 860 * Distal Intergenic 105373185 ENST00000452501.1 17199 LINC02601 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 41648065 41650224 1545 * Intron (ENST00000421587.8/8573, intron 8 of 24) 8573 ENST00000643043.2 15542 CASK MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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5 of 12) 85417 ENST00000348603.2 15424 85417 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50315341 50316593 1144 * Intron (ENST00000376042.6/85417, intron 8 of 12) 85417 ENST00000487204.1 -25114 85417 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50352678 50353520 843 * Distal Intergenic 85417 ENST00000487204.1 10971 85417 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50435112 50436583 1472 * Intron (ENST00000611977.2/139189, intron 1 of 27) 139189 ENST00000611977.2 34242 139189 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50530941 50535168 4228 * Distal Intergenic 139189 ENST00000611977.2 -60116 139189 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50538270 50539524 1255 * Distal Intergenic 57477 ENST00000483955.1 56713 57477 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50551859 50554388 2530 * Distal Intergenic 57477 ENST00000483955.1 41849 57477 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 50599272 50600376 1105 * Intron (ENST00000376020.9/57477, intron 7 of 8) 57477 ENST00000483955.1 -3035 57477 MCF10A 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Intron (ENST00000374900.5/158584, intron 10 of 10) 158584 ENST00000465623.1 28840 FAAH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005811,GO:0016021,GO:0016042,GO:0017064,GO:0019369,GO:0102077,GO:0103073 NA NA chrX 57507545 57508588 945 * Distal Intergenic 158584 ENST00000465623.1 75547 FAAH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005811,GO:0016021,GO:0016042,GO:0017064,GO:0019369,GO:0102077,GO:0103073 NA NA chrX 57558091 57559082 979 * Distal Intergenic 158586 ENST00000374888.3 -32929 ZXDB MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0003712,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0008150,GO:0046872 NA NA chrX 57709352 57710408 1057 * Distal Intergenic 286430 ENST00000434992.1 -29092 NLRP2B MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005634,GO:0005737,GO:0010804,GO:0032088,GO:0032691,GO:0033137,GO:0034122,GO:0043065,GO:0045087,GO:0045786,GO:1900226 NA NA chrX 57812223 57814577 1785 * Distal Intergenic 7789 ENST00000358697.6 95881 ZXDA MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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12) 4841 ENST00000535149.5 -3463 NONO MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000398,GO:0000976,GO:0001650,GO:0002218,GO:0003676,GO:0003682,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006355,GO:0006397,GO:0007623,GO:0008380,GO:0016020,GO:0016363,GO:0016607,GO:0042382,GO:0042752,GO:0042802,GO:0045087,GO:0045892,GO:0090575,GO:1903377 NA NA chrX 71842141 71843259 1119 * Distal Intergenic 340527 ENST00000633930.2 -67586 NHSL2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0030154 NA NA chrX 72419674 72421963 2290 * Exon (ENST00000478743.2/55869, exon 10 of 10) 55869 ENST00000470998.2 42601 HDAC8 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000118,GO:0000118,GO:0000122,GO:0000228,GO:0004407,GO:0004407,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006325,GO:0006333,GO:0007062,GO:0008134,GO:0030544,GO:0031397,GO:0031647,GO:0032041,GO:0032204,GO:0045944,GO:0046872,GO:0051879,GO:0070932,GO:0070933,GO:0071922 hsa04613,hsa05034,hsa05203 NA chrX 72438035 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intron 4 of 13) 22 ENST00000526404.2 -50541 ABCB7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005524,GO:0005743,GO:0005743,GO:0005743,GO:0006879,GO:0015232,GO:0015886,GO:0016021,GO:0016887,GO:0042626,GO:0055085,GO:0055085 hsa02010 NA chrX 75209935 75212033 2099 * Intron (ENST00000652605.1/139596, intron 4 of 13) 22 ENST00000526404.2 -53203 ABCB7 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005524,GO:0005743,GO:0005743,GO:0005743,GO:0006879,GO:0015232,GO:0015886,GO:0016021,GO:0016887,GO:0042626,GO:0055085,GO:0055085 hsa02010 NA chrX 75247904 75249151 1050 * Intron (ENST00000652605.1/139596, intron 4 of 13) 139596 ENST00000531704.5 -24934 UPRT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005525,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006222,GO:0007565,GO:0007595,GO:0009116,GO:0016310,GO:0032868,GO:0043231 hsa00240,hsa01100 NA chrX 75267238 75268494 1257 * Intron (ENST00000652605.1/139596, intron 4 of 13) 139596 ENST00000531704.5 -5591 UPRT MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intergenic 158866 ENST00000541184.1 -84369 ZDHHC15 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005794,GO:0006612,GO:0008270,GO:0014069,GO:0016188,GO:0016409,GO:0018215,GO:0018230,GO:0018230,GO:0018345,GO:0019706,GO:0019706,GO:0030173,GO:0061001,GO:0062237,GO:0072657,GO:0098794,GO:0140450,GO:1900006 NA NA chrX 75855838 75857934 2097 * Distal Intergenic 139599 ENST00000373359.4 -70584 MAGEE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 75858048 75859565 1518 * Distal Intergenic 139599 ENST00000373359.4 -72794 MAGEE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 75873067 75874103 1037 * Distal Intergenic 139599 ENST00000373359.4 -87813 MAGEE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 75878748 75880649 1648 * Distal Intergenic 139599 ENST00000373359.4 -93494 MAGEE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 75925850 75926856 1007 * Distal Intergenic 139599 ENST00000373359.4 -140596 MAGEE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 75932102 75933927 1554 * Distal Intergenic 139599 ENST00000373359.4 -146848 MAGEE2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 75983379 75984627 1249 * Distal Intergenic 51260 ENST00000373357.3 -188413 PBDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chrX 76050961 76052121 1161 * Distal Intergenic 51260 ENST00000373357.3 -120919 PBDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chrX 76064231 76065163 806 * Distal Intergenic 51260 ENST00000373357.3 -107877 PBDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chrX 76115372 76116560 1189 * Distal Intergenic 51260 ENST00000373357.3 -56480 PBDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chrX 76235630 76238373 2592 * Distal Intergenic 51260 ENST00000373358.8 62568 PBDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chrX 76265894 76267001 1108 * Distal Intergenic 51260 ENST00000373358.8 92832 PBDC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150 NA NA chrX 78014760 78015816 1057 * Promoter (<=1kb) 538 ENST00000685033.1 98 ATP7A MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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-117659 POU3F4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005654,GO:0006357,GO:0007420,GO:0007605,GO:0090103,GO:1990837,GO:2001054 NA NA chrX 83873105 83874632 1528 * Exon (ENST00000329312.5/1538, exon 4 of 5) 1538 ENST00000329312.5 11959 CYLC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005198,GO:0005200,GO:0005634,GO:0007010,GO:0007275,GO:0007283,GO:0030154,GO:0033150,GO:0043159,GO:0043159 NA NA chrX 83949342 83950467 1126 * Distal Intergenic 1538 ENST00000329312.5 88196 CYLC1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005198,GO:0005200,GO:0005634,GO:0007010,GO:0007275,GO:0007283,GO:0030154,GO:0033150,GO:0043159,GO:0043159 NA NA chrX 84976490 84977598 1109 * Exon (ENST00000456978.1/ENST00000456978.1, exon 3 of 3) 139322 ENST00000373173.7 -26279 APOOL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001401,GO:0002576,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005739,GO:0007007,GO:0031093,GO:0042407,GO:0061617,GO:0061617,GO:0061617,GO:0140275 NA NA chrX 85012549 85013946 1136 * Intron (ENST00000373173.7/139322, intron 1 of 8) 139322 ENST00000373173.7 8672 APOOL MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001401,GO:0002576,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005739,GO:0007007,GO:0031093,GO:0042407,GO:0061617,GO:0061617,GO:0061617,GO:0140275 NA NA chrX 85097742 85099502 1761 * Intron (ENST00000644105.2/340562, intron 4 of 7) 340562 ENST00000395409.7 9466 SATL1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0008080 NA NA chrX 85823933 85825262 1039 * Distal Intergenic 100302171 ENST00000637766.1 -10518 MIR1321 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 86061208 86062169 962 * Distal Intergenic 1121 ENST00000483950.1 -13647 CHM MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004663,GO:0005092,GO:0005096,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005968,GO:0005968,GO:0006612,GO:0007264,GO:0007601,GO:0016192,GO:0018215,GO:0018344,GO:0018344,GO:0031267,GO:0031267,GO:0042981,GO:0043547,GO:0043687 NA NA chrX 86082099 86083334 1171 * Distal Intergenic 1121 ENST00000483950.1 -34538 CHM MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004663,GO:0005092,GO:0005096,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005968,GO:0005968,GO:0006612,GO:0007264,GO:0007601,GO:0016192,GO:0018215,GO:0018344,GO:0018344,GO:0031267,GO:0031267,GO:0042981,GO:0043547,GO:0043687 NA NA chrX 86197059 86198564 1506 * Intron (ENST00000373125.9/117154, intron 1 of 11) 117154 ENST00000506327.6 48438 DACH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0046545 NA NA chrX 86280156 86282031 1301 * Intron (ENST00000373125.9/117154, intron 1 of 11) 117154 ENST00000510272.5 17188 DACH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0046545 NA NA chrX 86337543 86339279 1548 * Intron (ENST00000373125.9/117154, intron 1 of 11) 117154 ENST00000510272.5 74575 DACH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0046545 NA NA chrX 86405184 86406399 1216 * Intron (ENST00000373125.9/117154, intron 2 of 11) 117154 ENST00000510272.5 142216 DACH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0046545 NA NA chrX 87044699 87045787 1051 * Distal Intergenic 117154 ENST00000484479.1 330047 DACH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0046545 NA NA chrX 87153534 87154649 650 * Distal Intergenic 56062 ENST00000652270.1 -362760 KLHL4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0003779,GO:0005737,GO:0008150,GO:0015630,GO:0034451 NA NA chrX 87193827 87195484 1507 * Distal Intergenic 56062 ENST00000652270.1 -321925 KLHL4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0003779,GO:0005737,GO:0008150,GO:0015630,GO:0034451 NA NA chrX 87262489 87263694 1206 * Distal Intergenic 56062 ENST00000652270.1 -253715 KLHL4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0003779,GO:0005737,GO:0008150,GO:0015630,GO:0034451 NA NA chrX 87462050 87462950 718 * Distal Intergenic 56062 ENST00000652270.1 -54459 KLHL4 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA 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Intergenic 643486 ENST00000605735.1 437524 BRDTP1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 96215332 96216412 1081 * Intron (ENST00000653599.1/ENST00000653599.1, intron 2 of 4) 643486 ENST00000605735.1 121500 BRDTP1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 96584732 96585890 1159 * Distal Intergenic 1730 ENST00000373049.8 -98822 DIAPH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003779,GO:0005102,GO:0005730,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005829,GO:0007015,GO:0007275,GO:0007292,GO:0043231,GO:0048477 hsa04810 NA chrX 96598467 96599448 982 * Distal Intergenic 1730 ENST00000373049.8 -85264 DIAPH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003779,GO:0005102,GO:0005730,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005829,GO:0007015,GO:0007275,GO:0007292,GO:0043231,GO:0048477 hsa04810 NA chrX 96632894 96634122 1229 * Distal Intergenic 1730 ENST00000373049.8 -50590 DIAPH2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003779,GO:0005102,GO:0005730,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005829,GO:0007015,GO:0007275,GO:0007292,GO:0043231,GO:0048477 hsa04810 NA chrX 96754460 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(ENST00000649508.1/ENST00000649508.1, intron 1 of 6) 10824 ENST00000445414.1 -962697 DIAPH2-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005575,GO:0007165 NA NA chrX 99002122 99003839 1578 * Distal Intergenic 10824 ENST00000445414.1 -1384863 DIAPH2-AS1 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005575,GO:0007165 NA NA chrX 99061365 99065629 3905 * Distal Intergenic 57526 ENST00000636150.1 1340886 PCDH19 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007420 NA NA chrX 99151189 99152437 1249 * Distal Intergenic 57526 ENST00000636150.1 1254078 PCDH19 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007420 NA NA chrX 99349792 99351184 1393 * Distal Intergenic 57526 ENST00000636150.1 1055331 PCDH19 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007420 NA NA chrX 99473221 99475345 2125 * Distal Intergenic 57526 ENST00000636150.1 931170 PCDH19 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007420 NA NA 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1221 * Distal Intergenic 84631 ENST00000335565.6 -158474 SLITRK2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007409,GO:0050807,GO:0050807,GO:0051965,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099560,GO:0099560,GO:1905606,GO:1905606 NA NA chrX 145721329 145722364 1036 * Intron (ENST00000650977.1/ENST00000650977.1, intron 2 of 2) 84631 ENST00000335565.6 -95465 SLITRK2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007409,GO:0050807,GO:0050807,GO:0051965,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099560,GO:0099560,GO:1905606,GO:1905606 NA NA chrX 145759365 145760314 950 * Exon (ENST00000650977.1/ENST00000650977.1, exon 2 of 3) 84631 ENST00000335565.6 -57515 SLITRK2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007409,GO:0050807,GO:0050807,GO:0051965,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099560,GO:0099560,GO:1905606,GO:1905606 NA NA chrX 145765997 145767116 1120 * Intron (ENST00000650977.1/ENST00000650977.1, intron 1 of 2) 84631 ENST00000335565.6 -50713 SLITRK2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007409,GO:0050807,GO:0050807,GO:0051965,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099560,GO:0099560,GO:1905606,GO:1905606 NA NA chrX 145776410 145777566 1157 * Intron (ENST00000650977.1/ENST00000650977.1, intron 1 of 2) 84631 ENST00000335565.6 -40263 SLITRK2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007409,GO:0050807,GO:0050807,GO:0051965,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099560,GO:0099560,GO:1905606,GO:1905606 NA NA chrX 148403658 148404707 1050 * Distal Intergenic 2334 ENST00000370460.7 -95910 AFF2 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002151,GO:0002151,GO:0006397,GO:0007420,GO:0007611,GO:0008380,GO:0010468,GO:0010468,GO:0010629,GO:0016607,GO:0016607,GO:0032783,GO:0035063,GO:0043484,GO:0043484 NA NA chrX 149821715 149823276 1551 * Promoter (2-3kb) 101241891 ENST00000629221.1 -2432 101241891 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 150123354 150124454 1101 * Intron (ENST00000449111.5/100272228, intron 11 of 14) 100313839 ENST00000516645.3 -103550 100313839 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 150332455 150333565 1111 * Distal Intergenic 10046 ENST00000468306.1 -27857 10046 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 150390839 150391943 1105 * Intron (ENST00000468306.1/10046, intron 2 of 2) 10046 ENST00000432680.7 27522 10046 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 151120836 151122288 1453 * Distal Intergenic 100422930 ENST00000579077.1 -45934 100422930 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 151532519 151533611 1093 * Distal Intergenic 105377213 ENST00000454307.1 16968 105377213 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 151639200 151640272 1073 * Intron (ENST00000370357.5/139135, intron 8 of 15) 79057 ENST00000674441.1 -54335 79057 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 151657582 151658656 1075 * Intron (ENST00000370357.5/139135, intron 9 of 15) 79057 ENST00000674441.1 -35951 79057 MCF10A h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chrX 151716743 151718257 1461 * Promoter (<=1kb) 89885 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