seqnames start end width strand annotation geneId transcriptId distanceToTSS Symbol Type HM data_source_link GO KEGG reference chr1 629457 630010 554 * Promoter (1-2kb) 101928626 ENST00000452176.2 1140 LOC101928626 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr1 630755 631410 446 * Promoter (<=1kb) 101928626 ENST00000452176.2 0 LOC101928626 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr1 631910 632466 322 * Promoter (<=1kb) 105378947 ENST00000641296.1 663 LOC105378947 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr1 633901 634793 798 * Promoter (<=1kb) 105378947 ENST00000440196.3 -772 LOC105378947 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr1 2440205 2440787 549 * Intron (ENST00000609981.5/9651, intron 2 of 3) 9651 ENST00000609981.5 14225 PLCH2 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004435,GO:0004435,GO:0005509,GO:0005575,GO:0005737,GO:0005886,GO:0016042,GO:0043647,GO:0046488,GO:0048015,GO:0048015 hsa00562,hsa01100 NA chr11 10508957 10509985 1029 * Promoter (<=1kb) 100616263 ENST00000638094.1 -631 MIR4485 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 41363411 41363958 548 * Intron (ENST00000402685.7/29951, intron 3 of 9) 107984499 ENST00000548450.1 48519 LOC107984499 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr12 114063989 114064529 295 * Distal Intergenic 105369995 ENST00000552413.1 -12604 LOC105369995 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr14 32484658 32485119 337 * Exon (ENST00000554243.1/ENST00000554243.1, exon 1 of 1) 9472 ENST00000554410.5 -9152 AKAP6 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001508,GO:0005515,GO:0005635,GO:0005737,GO:0005901,GO:0006605,GO:0008179,GO:0010738,GO:0010880,GO:0014701,GO:0014704,GO:0016529,GO:0016529,GO:0019933,GO:0030307,GO:0030315,GO:0031965,GO:0034237,GO:0034704,GO:0043495,GO:0044325,GO:0044325,GO:0048471,GO:0048471,GO:0048471,GO:0051018,GO:0051018,GO:0051018,GO:0051281,GO:0060090,GO:0060306,GO:0060316,GO:0061051,GO:0070886,GO:0071320,GO:0071345,GO:1901381,GO:1902261 NA NA chr18 47853091 47853587 497 * Exon (ENST00000591258.1/ENST00000591258.1, exon 1 of 1) 4087 ENST00000587353.5 33336 SMAD2 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000987,GO:0001228,GO:0001228,GO:0001657,GO:0001701,GO:0001706,GO:0001707,GO:0003677,GO:0003682,GO:0003690,GO:0003700,GO:0003700,GO:0005160,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006357,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007182,GO:0007183,GO:0007352,GO:0007369,GO:0008134,GO:0008285,GO:0009653,GO:0009749,GO:0009791,GO:0009952,GO:0010718,GO:0016579,GO:0017015,GO:0019902,GO:0023019,GO:0030073,GO:0030154,GO:0030324,GO:0030325,GO:0030509,GO:0030512,GO:0030513,GO:0031016,GO:0031053,GO:0031625,GO:0032444,GO:0032924,GO:0032991,GO:0033613,GO:0034713,GO:0035019,GO:0035265,GO:0035556,GO:0038092,GO:0042060,GO:0045165,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0046332,GO:0046872,GO:0048156,GO:0048340,GO:0048617,GO:0048701,GO:0051098,GO:0060039,GO:0060395,GO:0062009,GO:0070410,GO:0070411,GO:0070411,GO:0070412,GO:0070723,GO:0071141,GO:0071144,GO:0071144,GO:0097718,GO:1900224 hsa04110,hsa04144,hsa04218,hsa04350,hsa04371,hsa04390,hsa04550,hsa04659,hsa04926,hsa04933,hsa05142,hsa05166,hsa05200,hsa05205,hsa05210,hsa05212,hsa05225,hsa05226,hsa05321,hsa05415 NA chr19 47367998 47368445 394 * Promoter (<=1kb) 9704 ENST00000486327.6 885 DHX34 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000184,GO:0000956,GO:0003723,GO:0003723,GO:0003724,GO:0005524,GO:0005622,GO:0016020,GO:2000623 NA NA chr2 32866591 32867023 300 * Intron (ENST00000654101.1/285045, intron 1 of 2) 285045 ENST00000435075.1 -15778 LINC00486 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 32916046 32916627 545 * Intron (ENST00000414054.5/285045, intron 4 of 4) 285045 ENST00000663506.1 -10458 LINC00486 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr2 148881524 148882089 566 * Exon (ENST00000690366.2/ENST00000690366.2, exon 1 of 1) 112267889 ENST00000608822.1 3488 KIF5C-AS1 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr20 47894621 47895357 737 * Distal Intergenic 105372637 ENST00000666669.1 -55440 LOC105372637 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr22 11212790 11213550 295 * Distal Intergenic 102723780 ENST00000635667.1 -251452 FRG1FP SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA chr3 93470145 93471000 856 * Distal Intergenic 5627 ENST00000649585.1 415413 PROS1 SKBR3 h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0002576,GO:0004866,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005789,GO:0005796,GO:0005886,GO:0006888,GO:0007596,GO:0010951,GO:0030449,GO:0031093,GO:0042730,GO:0050900,GO:0070062,GO:0072562 hsa04610 NA