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intron 5 of 12)" 57147 ENST00000367770.5 16423 SCYL3 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0000139,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005737,GO:0005794,GO:0006468,GO:0006954,GO:0016301,GO:0016477,GO:0021522,GO:0030027,GO:0034613,GO:0042802,GO:0048666" NA chr1 223674246 223674537 292 * Distal Intergenic 388743 ENST00000366873.6 -8523 CAPN8 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0004198,GO:0005509,GO:0005737,GO:0005794,GO:0006508,GO:0007586" NA chr1 224012240 224012856 617 * Distal Intergenic 100287497 ENST00000572124.2 10333 SEPTIN7P13 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr1 228557119 228557461 343 * Distal Intergenic 100129094 ENST00000595971.3 -44814 BTNL10 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0001817,GO:0005102,GO:0009897,GO:0016021,GO:0050852" NA chr1 228557639 228558071 433 * Distal Intergenic 100129094 ENST00000595971.3 -45334 BTNL10 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0001817,GO:0005102,GO:0009897,GO:0016021,GO:0050852" NA chr1 229736185 229736475 291 * Distal Intergenic 9816 ENST00000434387.1 85338 URB2 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0005730,GO:0005730,GO:0016235,GO:0030496,GO:0042254" NA chr1 236096902 236097640 739 * Distal Intergenic 4811 ENST00000366595.7 -31793 NID1 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0005201,GO:0005201,GO:0005509,GO:0005518,GO:0005576,GO:0005604,GO:0005886,GO:0007160,GO:0010811,GO:0030198,GO:0032836,GO:0043236,GO:0043237,GO:0043394,GO:0062023,GO:0062023,GO:0062023,GO:0070062,GO:0071711" NA chr1 246785630 246785941 312 * Promoter (2-3kb) 149134 ENST00000662358.1 2135 LINC01341 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr1 247937024 247937322 299 * "Exon (ENST00000685080.2/ENST00000685080.2, exon 1 of 1)" 391190 ENST00000623922.1 -11536 OR2L8 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0003674,GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0008150,GO:0016021,GO:0050911" hsa04740 chr1 248306635 248306958 324 * Distal Intergenic 127064 ENST00000641276.1 -3211 OR2T12 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911" hsa04740 chr1 248408125 248409077 953 * Downstream (<=300bp) 26696 ENST00000642005.1 5077 OR2T1 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911" hsa04740 chr10 38488938 38489462 525 * Distal Intergenic 101929540 ENST00000634512.1 81307 LOC101929540 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38527656 38528087 432 * Distal Intergenic 101929540 ENST00000634512.1 120025 LOC101929540 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38528129 38529825 1697 * Distal Intergenic 101929540 ENST00000634512.1 120498 LOC101929540 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38573239 38573782 544 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 -122642 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38578807 38579346 540 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 -117078 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38580747 38581050 304 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 -115374 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38783570 38783875 306 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 87146 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38791904 38792226 323 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 95480 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38872777 38873072 296 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 176353 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38911852 38913028 1177 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 215428 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 38918806 38920236 1431 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 222382 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 39986240 39986767 528 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 1289816 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 40128025 40128331 307 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 1431601 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 40447068 40447598 531 * Distal Intergenic 399746 ENST00000448440.1 1750644 ACTR3BP5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 40556591 40557145 555 * Distal Intergenic 101929373 ENST00000622823.4 -1685576 LOC101929373 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 NA NA chr10 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MARCHF5 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0000209,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005741,GO:0005783,GO:0005789,GO:0008270,GO:0016020,GO:0016021,GO:0051020,GO:0051865,GO:0061630,GO:0061630,GO:0070585,GO:0090140,GO:0090141,GO:0090344" NA chr10 92690291 92690581 291 * Promoter (<=1kb) 3087 ENST00000282728.10 336 HHEX HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 "GO:0000122,GO:0000785,GO:0000976,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006357,GO:0006406,GO:0008134,GO:0008190,GO:0008301,GO:0009611,GO:0009952,GO:0010621,GO:0010944,GO:0016055,GO:0016525,GO:0016973,GO:0017025,GO:0030154,GO:0030154,GO:0030177,GO:0030183,GO:0030948,GO:0032993,GO:0034504,GO:0042803,GO:0043434,GO:0043565,GO:0045736,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045944,GO:0045944,GO:0070491,GO:0070663,GO:0071103,GO:0090263" "hsa04950,hsa05202" chr10 107285367 107285657 291 * Distal Intergenic 114815 ENST00000263054.11 -120661 SORCS1 HCC1954 H3K9ME3 GSE85158 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"GO:0000122,GO:0000785,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001708,GO:0001756,GO:0001756,GO:0003163,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0016331,GO:0042803,GO:0051145,GO:0060829,GO:0060930,GO:0060931,GO:0072189,GO:0090103,GO:0090571,GO:0098907,GO:1990837" NA chr6 106770664 106771005 342 * "Exon (ENST00000602934.3/100422737, exon 3 of 3)" 100422737 ENST00000663403.1 -5554 LINC02532 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr6 140433697 140434015 319 * "Intron (ENST00000684511.1/105378027, intron 1 of 8)" 105378027 ENST00000684511.1 118797 LOC105378027 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr6 141953145 141953439 295 * Distal Intergenic 100126572 ENST00000450456.3 -179486 GJE1 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0000902,GO:0002088,GO:0005243,GO:0005922,GO:0007267,GO:0016021,GO:0035265,GO:0055085" NA chr6 143213599 143213895 297 * "Intron (ENST00000367601.8/51390, intron 4 of 5)" 51390 ENST00000470265.1 48655 AIG1 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 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"GO:0000785,GO:0000981,GO:0001502,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007389,GO:0010468,GO:0021516,GO:0021889,GO:0035726,GO:0045595,GO:1990837,GO:1990837" NA chr7 10995507 10995822 316 * "Intron (ENST00000642461.1/9678, intron 3 of 15)" 9678 ENST00000476774.1 -17999 PHF14 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0005515,GO:0006357,GO:0042393,GO:0043972,GO:0043994,GO:0044154,GO:0046872,GO:0070776" NA chr7 23337478 23337792 315 * "Intron (ENST00000258729.8/10643, intron 10 of 14)" 10643 ENST00000495009.1 8369 IGF2BP3 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0001817,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003730,GO:0003730,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006412,GO:0007399,GO:0009653,GO:0010468,GO:0017148,GO:0043488,GO:0045182,GO:0048027,GO:0051028,GO:0051252" NA chr7 45811198 45811764 567 * "Exon (ENST00000609439.2/101929008, exon 17 of 17)" 101929008 ENST00000438487.1 37603 GTF2IP13 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 45812224 45812996 773 * "Exon (ENST00000609439.2/101929008, exon 17 of 17)" 101929008 ENST00000438487.1 38629 GTF2IP13 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 55741515 55741805 291 * "Exon (ENST00000621362.1/ENST00000621362.1, exon 1 of 1)" 360132 ENST00000441699.1 -28263 FKBP9P1 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 55744131 55744494 364 * Distal Intergenic 360132 ENST00000441699.1 -30879 FKBP9P1 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 56370427 56370939 513 * Distal Intergenic 650226 ENST00000422212.1 61763 LOC650226 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 56371150 56372364 1215 * Distal Intergenic 650226 ENST00000422212.1 60338 LOC650226 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 56372411 56373093 683 * Distal Intergenic 650226 ENST00000422212.1 59609 LOC650226 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 56373579 56374703 1125 * Distal Intergenic 650226 ENST00000422212.1 57999 LOC650226 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 57495306 57495753 448 * Distal Intergenic 441234 ENST00000420713.2 45129 ZNF716 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 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"GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872" hsa05168 chr7 59995736 59996030 295 * Distal Intergenic 441234 ENST00000420713.2 2545559 ZNF716 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872" hsa05168 chr7 60639061 60639351 291 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 2664637 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 61021066 61021358 293 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 2282630 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 61071035 61071606 572 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 2232382 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 61579707 61580224 518 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 1723764 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62309137 62309603 467 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 994385 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62312020 62312405 386 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 991583 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62347517 62347863 347 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 956125 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62350158 62350725 568 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 953263 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62402763 62403116 354 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 900872 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62450950 62451461 512 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 852527 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 62451959 62452256 298 * Distal Intergenic 643955 ENST00000444809.1 851732 ZNF733P hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr7 73994900 73995284 385 * Distal Intergenic 2006 ENST00000445912.5 -32505 ELN hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0003151,GO:0003180,GO:0005201,GO:0005515,GO:0005576,GO:0007519,GO:0007585,GO:0008015,GO:0009887,GO:0030023,GO:0030198,GO:0030833,GO:0031012,GO:0043149,GO:0048660,GO:0050840,GO:0062023,GO:0071953" hsa04974 chr7 105711779 105712289 511 * "Intron (ENST00000419735.8/222255, intron 3 of 11)" 222255 ENST00000472195.1 -20142 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(ENST00000622202.1/ENST00000622202.1, exon 2 of 2)" 105375937 ENST00000520459.1 131417 LOC105375937 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85656380 85656742 363 * "Exon (ENST00000379010.3/ENST00000379010.3, exon 1 of 1)" 105375937 ENST00000520459.1 132481 LOC105375937 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85662383 85663052 670 * "Exon (ENST00000379010.3/ENST00000379010.3, exon 1 of 1)" 105375937 ENST00000520459.1 138484 LOC105375937 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85663419 85663712 294 * "Exon (ENST00000608646.2/ENST00000608646.2, exon 1 of 1)" 105375937 ENST00000520459.1 139520 LOC105375937 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85714331 85715305 975 * "Exon (ENST00000622156.1/ENST00000622156.1, exon 1 of 1)" 105375622 ENST00000650562.1 146257 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85735489 85735783 295 * "Exon (ENST00000620964.2/ENST00000620964.2, exon 2 of 2)" 105375622 ENST00000650562.1 125779 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85746157 85746472 316 * "Intron (ENST00000615707.1/ENST00000615707.1, intron 1 of 1)" 105375622 ENST00000650562.1 115090 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85758794 85759106 313 * Distal Intergenic 105375622 ENST00000650562.1 102456 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85764431 85764941 511 * "Intron (ENST00000604264.2/ENST00000604264.2, intron 1 of 1)" 105375622 ENST00000650562.1 96621 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85775774 85776124 351 * "Exon (ENST00000425429.3/ENST00000425429.3, exon 2 of 2)" 105375622 ENST00000650562.1 85438 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85803133 85803586 454 * "Exon (ENST00000605109.2/ENST00000605109.2, exon 2 of 2)" 105375622 ENST00000650562.1 57976 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85826656 85827006 351 * "Exon (ENST00000619970.1/ENST00000619970.1, exon 1 of 1)" 105375622 ENST00000650562.1 34556 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85827482 85828142 661 * "Exon (ENST00000619970.1/ENST00000619970.1, exon 1 of 1)" 105375622 ENST00000650562.1 33420 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 85828352 85828663 312 * "Exon (ENST00000603433.2/ENST00000603433.2, exon 1 of 1)" 105375622 ENST00000650562.1 32899 LINC02849 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 NA NA chr8 91867525 91867815 291 * "Intron (ENST00000521199.1/ENST00000521199.1, intron 1 of 3)" 862 ENST00000521078.1 103345 RUNX1T1 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0003677,GO:0003714,GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006351,GO:0016363,GO:0045599,GO:0045892,GO:0045892,GO:0046872" "hsa05200,hsa05202,hsa05221" chr8 96172098 96172472 375 * Distal Intergenic 392255 ENST00000287020.7 -11292 GDF6 hcc1954 h3k9me3 GSE85158 "GO:0005125,GO:0005615,GO:0006915,GO:0007275,GO:0008083,GO:0010862,GO:0010862,GO:0030509,GO:0032332,GO:0032924,GO:0045444,GO:0045893,GO:0060389,GO:0060395,GO:0060395,GO:0060395,GO:1900745,GO:1990009" "hsa04060,hsa04350,hsa04390" chr8 100670839 100671129 291 * Distal Intergenic 169166 ENST00000520352.5 -7424 SNX31 hcc1954 h3k9me3 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